脳科学辞典 - 利用者の投稿記録 [ja]

トーク:全反射顕微鏡

2012-07-18T23:21:02Z

Hiroyasuhatakeyama: /* 編集　林　作業記録 */

== 編集　林　作業記録 ==

*イントロが無かったので、要約の第１文を細胞機能の所に持って来て「全反射顕微鏡とは」というイントロに致しました。歴史的経緯等含め適宜御拡張下さい。
*内部リンク、外部リンク作成
*実際の画像があればよりよいかと思います。

--[[利用者:WikiSysop|Yasunori Hayashi]] 2012年7月6日 (金) 06:11 (JST)

林先生、各種訂正等ありがとうございました。実際の画像は、適切な画像（動画）がとれましたら掲載したいと存じます。 --[[利用者:Hiroyasuhatakeyama|Hiroyasu Hatakeyama]] 2012年7月19日 (木) 08:21 (JST)

全反射顕微鏡

2012-06-18T00:13:04Z

Hiroyasuhatakeyama:

英：Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy、英略語：TIRF microscopy, TIRFM 
同義語：Evanescent Wave Microscopy 

全反射蛍光顕微鏡は、細胞とカバーガラスとの接着面のごく近傍で起こる分子・細胞内器官の動態や基板表面における1分子蛍光の観察の際に広く用いられている蛍光顕微鏡である。この蛍光顕微鏡では、光が屈折率の異なる界面において全反射するときに反対側にわずかにしみ出す光（エバネッセント光）を励起光として利用することで、界面のごく近傍のみが照明される。したがって、照明領域以外に存在する蛍光分子の励起を避け、背景光を極めて低減させることが可能となる。

==全反射蛍光顕微鏡による細胞機能の可視化==
現在までに、以下のような細胞機能等広い領域において全反射顕微鏡を用いた可視化が行われている。個々の具体例については、参考文献を参照のこと<ref><pubmed>19118676</pubmed></ref>。
*[[開口放出]](exocytosis)／エンドサイトーシス
*細胞接着／細胞骨格
*シグナル伝達（Ca2+, cAMPなど）

==全反射蛍光顕微鏡の原理と特徴==
===全反射===
[[Image:TIRF_Fig1.png|thumb|'''図1　光の屈折と反射''']]
　屈折率の異なる2つの媒質（媒質1、媒質2）の界面に対し斜めに光を入射させると、屈折光と反射光が発生する。2つの媒質の屈折率をそれぞれn1、n2、入射角をθ1、屈折角をθ2としたとき、これらの間には[[wikipedia:ja:スネルの法則|スネルの法則]] 
::<math>\dfrac{\sin \theta_1}{\sin \theta_2} = \dfrac{n_2}{n_1}</math> 
が成立する（図1）。屈折角θ2が90°になるときの入射角を特に臨界角(critical angle)といい、 
::<math>\theta_C = \sin^{-1} \left( \dfrac{n_2}{n_1} \right)</math> 
で示される（ただしθC：臨界角）。2つの媒質の屈折率がn1>n2を満たすとき、θ1>θCの条件で光が入射すると、媒質2には光は透過せず、すべてが反射する。この現象が全反射(total internal reflection)である。ガラス(n1=1.52)と水(n2=1.33)の間における臨界角は約61°となる。
===界面におけるエバネッセント場の形成===
[[Image:TIRF_Fig2.png|thumb|'''図2　全反射''']]
図2のようにガラス面に臨界角以上の角度で光を入射させ、全反射させた場合に試料側で起こる現象を考える。このとき、ガラス側に存在する光が試料側で急にゼロになるということは起こらず（光を含む電磁波は電荷のない界面においては連続的に変化する）、試料側へと光がしみ出す（図2）。このしみ出した光をエバネッセント光と呼び、全反射蛍光顕微鏡ではこの光を励起光として利用する。
　エバネッセント光の強度は全反射面からの距離の関数であり、 
::<math>I(z)=I_0 \exp \left(- \dfrac{z}{d}\right)</math> 
::<math>d=\dfrac{\lambda}{4\pi \sqrt{n_1^2 \sin^2 \theta_1-n_2^2}}</math> 
で示される。（ただし、I(z): 全反射面からの距離zにおけるエバネッセント光強度、I0: 全反射面における光の強度、d: 光の強度が1/eとなる界面からの距離、λ: 入射光の波長）。たとえばガラス(n1=1.52)と水(n2=1.33)の間に形成されたエバネッセント光がしみ出す深さdは、励起光として可視光を用いた場合にはおよそ50–200 nmとなる。
===全反射蛍光顕微鏡の特徴===
上に示したように、エバネッセント光強度は界面から遠ざかるにつれて急速に減衰する。また、エバネッセント光強度は、界面において最大で入射光の約4倍に強くなる<ref>'''鶴田匡夫''' 応用光学I ''培風館'':1990</ref>。したがって、界面のごく近傍に存在する蛍光分子のみを効率的に励起できる一方で背景光となる深部に存在する蛍光分子の励起は少なく、高いコントラストで蛍光を観察することが可能となる。

[[Image:TIRF_Fig3.png|thumb|'''図3　励起方式''']]
==全反射蛍光顕微鏡の装置構成==
全反射蛍光顕微鏡は、基本的には通常の蛍光顕微鏡と同様に顕微鏡本体と励起光源・検出器（CCDカメラ）から構成され、ここに全反射を実現するための光学系を組み込むことによって構築可能である。各顕微鏡メーカーからもシステムとして市販されている。励起光源にはレーザー光が広く用いられるが、水銀ランプやキセノンランプなどのアーク光源でも実現可能である。

===励起方式===
全反射照明を達成するための励起光の導入方式には、「プリズム式」と「対物レンズ式」の2種類が存在する（図3）。プリズム式は比較的安価に構築でき、背景光を低減できること、入射角を幅広く確保できることなどの利点があるが、試料上方の空間が塞がれてしまうために試料操作が困難であることが欠点である。一方で対物レンズ式は試料上方に空間が得られ、溶液交換や電極設置などの操作が容易に行える。またこの方式ではレーザー光の入射位置を調節するだけで容易に全反射照明と落射照明とを切り替えることが可能である。このような操作性の高さから、複数の顕微鏡メーカーから市販されている全反射蛍光顕微鏡システムでは「対物レンズ式」が用いられている。
===対物レンズの選択===
[[Image:TIRF_Fig4.png|thumb|'''図4　満たすべき対物レンズの要件''']]
全反射蛍光顕微鏡を構築する際に重要となる試料への励起光導入条件は以下の2点である。 
*臨界角以上の角度での照射 
*試料の均一な照明 
対物レンズ式全反射蛍光顕微鏡においてこれらの条件を満たすためには、励起光を対物レンズの後焦点面の辺縁部へと集光すれば良い。「辺縁部」とは、具体的には対物レンズ中心軸からの距離が試料の屈折率で決まるdn2と対物レンズの開口数(Numerical Aperture; NA)で決まるdNAの間、である（図4）。このため、この方式の全反射蛍光顕微鏡で用いられる対物レンズは、開口数が試料の屈折率よりも大きいものであることが必須である。各顕微鏡メーカーから1.65/1.49/1.45といった高い開口数を持つ対物レンズが市販されており、目的に応じてこれらの対物レンズを選択すると良い。
==参考文献==
<references/>

全反射顕微鏡

2012-06-15T07:24:44Z

Hiroyasuhatakeyama:

英：Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy、英略語：TIRF microscopy, TIRFM 
同義語：Evanescent Wave Microscopy、エバネッセント場顕微鏡 

全反射蛍光顕微鏡は、細胞とカバーガラスとの接着面のごく近傍で起こる分子・細胞内器官の動態や基板表面における1分子蛍光の観察に広く用いられる手法である。この顕微鏡は、光が屈折率の異なる界面において全反射するときに、反対側にわずかにしみ出す光（エバネッセント光）を励起光として利用し、界面のごく近傍のみを照明する手法である。したがって、照明領域以外に存在する蛍光分子の励起を避け、背景光を極めて低減させることが可能となる。

==全反射蛍光顕微鏡による細胞機能の可視化==
現在までに、以下のような細胞機能等広い領域において全反射顕微鏡を用いた可視化が行われている。個々の例については、参考文献を参照のこと<ref><pubmed>19118676</pubmed></ref>。
*開口放出(exocytosis)／エンドサイトーシス
*細胞接着／細胞骨格
*シグナル伝達（Ca2+, cAMPなど）

==全反射蛍光顕微鏡の原理と特徴==
[[Image:TIRF_Fig1.png|thumb|'''図1　光の屈折と反射''']]
===全反射===
　屈折率の異なる2つの媒質（媒質1、媒質2）の界面に対し斜めに光を入射させると、屈折光と反射光が発生する。2つの媒質の屈折率をそれぞれn1、n2、入射角をθ1、屈折角をθ2としたとき、スネルの法則 
::<math>\dfrac{\sin \theta_1}{\sin \theta_2} = \dfrac{n_2}{n_1}</math> 
が成立する（図1）。屈折角θ2が90°になるときの入射角を特に臨界角(critical angle)といい、 
::<math>\theta_C = \sin^{-1} \left( \dfrac{n_2}{n_1} \right)</math> 
で示される（ただしθC：臨界角）。2つの媒質の屈折率がn1>n2を満たすとき、θ1>θCの条件で光が入射すると、媒質2には光は透過せず、すべてが反射する。この現象が全反射(total internal reflection)である。たとえばガラス(n1=1.52)と水(n2=1.33)の間における臨界角は約61°となる。
[[Image:TIRF_Fig2.png|thumb|'''図2　全反射''']]
===界面におけるエバネッセント場の形成===
図2のようにガラス表面に臨界角以上の角度で光を入射させた場合の試料側で起こる現象を考える。このときガラス側には電磁波（光）が存在し、電磁波は電荷のない界面においては連続的に変化するため、試料側に電磁波のしみ出しが発生する（図1B）。このしみ出した電磁波をエバネッセント場(evanescent field)と呼び、全反射蛍光顕微鏡ではこの光（エバネッセント光）を励起光として利用する。
　エバネッセント光の強度は全反射面からの距離の関数であり、 
::<math>I(z)=I_0 \exp \left(- \dfrac{z}{d}\right)</math> 
::<math>d=\dfrac{\lambda}{4\pi \sqrt{n_1^2 \sin^2 \theta_1-n_2^2}}</math> 
で示される。（ただし、I(z): 全反射面からの距離zにおけるエバネッセント光強度、I0: 全反射面における光の強度、d: 光の強度が1/eとなる界面からの距離、λ: 入射光の波長）。たとえばガラス(n1=1.52)と水(n2=1.33)の間に形成されたエバネッセント光がしみ出す深さdは、励起波長として可視光を用いた場合にはおよそ50–200 nmとなる。
===全反射蛍光顕微鏡の特徴===
上に示したように、エバネッセント光強度は界面から遠ざかるにつれて急速に減衰する。また、エバネッセント光強度は、界面において最大で入射光の約4倍に強くなる。したがって、界面のごく近傍に存在する蛍光分子のみを効率的に励起できる一方で背景光となる深部に存在する蛍光分子の励起は少なく、高いコントラストで蛍光を観察することが可能となる。

[[Image:TIRF_Fig3.png|thumb|'''図3　励起方式''']]
==全反射蛍光顕微鏡の装置構成==
===励起方式===
蛍光顕微鏡下で全反射照明を達成するための励起光の導入方式には、「プリズム式」と「対物レンズ式」の2種類が存在する（図3）。プリズム式は比較的安価に構築でき、背景光を低減できること、入射角を幅広く確保できることなどの利点があるが、試料上方の空間が塞がれてしまうために試料操作が困難であることが欠点である。一方で対物レンズ式は試料上方に空間が得られ、溶液交換や電極設置などの操作が容易に行える。またこの方式では、後述するようにレーザー光の入射位置を調節するだけで容易に全反射照明と落射照明とを切り替えることが可能であり、このような操作性の高さから、近年では対物レンズ式全反射蛍光顕微鏡が複数の顕微鏡メーカーから市販されている。
===対物レンズの選択===
[[Image:TIRF_Fig4.png|thumb|'''図4　満たすべき対物レンズの要件''']]
前述のように、全反射蛍光顕微鏡では入射光を臨界角以上の角度で試料へと照射することが必須である。また、試料の目的部位に均一に照明することが必要である。この要件を対物レンズ式にて達成するためには、対物レンズの後焦点面の辺縁部へレーザー光を集光すれば良い。すなわち、レーザー光を、対物レンズ中心軸の距離が試料の屈折率で決まるdn2と対物レンズの開口数(Numerical Aperture; NA)で決まるdNAの間となるように入射させれば良い（図4）。このことから、対物レンズ式全反射蛍光顕微鏡を達成するために必要な対物レンズのNAは試料の屈折率よりも大きいものである必要があることがわかる。各顕微鏡メーカーから1.65/1.49/1.45といった高いNAを持つ対物レンズが市販されており、目的に応じてこれらの対物レンズを選択すると良い。
==参考文献==
<references/>

ファイル:TIRF Fig4.png

2012-06-15T07:16:52Z

Hiroyasuhatakeyama: 図4　対物レンズの要件

図4　対物レンズの要件

ファイル:TIRF Fig3.png

2012-06-15T07:14:35Z

Hiroyasuhatakeyama: 図3　励起方式

図3　励起方式

ファイル:TIRF Fig2.png

2012-06-15T07:03:02Z

Hiroyasuhatakeyama: 図2　全反射

図2　全反射

ファイル:TIRF Fig1.png

2012-06-15T07:02:47Z

Hiroyasuhatakeyama: 「ファイル:TIRF Fig1.png」の新しい版をアップロードしました: 図1　光の反射と屈折

図1　全反射

ファイル:TIRF Fig1.png

2012-06-15T06:58:28Z

Hiroyasuhatakeyama: 図1　全反射

図1　全反射

全反射顕微鏡

2012-06-15T06:05:47Z

Hiroyasuhatakeyama:

英：Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy、英略語：TIRF microscopy, TIRFM 
同義語：Evanescent Wave Microscopy、エバネッセント場顕微鏡 

全反射蛍光顕微鏡は、細胞とカバーガラスとの接着面のごく近傍で起こる分子・細胞内器官の動態や基板表面における1分子蛍光の観察に広く用いられる手法である。この顕微鏡は、光が屈折率の異なる界面において全反射するときに、反対側にわずかにしみ出す光（エバネッセント光）を励起光として利用し、界面のごく近傍のみを照明する手法である。したがって、照明領域以外に存在する蛍光分子の励起を避け、背景光を極めて低減させることが可能となる。

==全反射蛍光顕微鏡による細胞機能の可視化==
現在までに、以下のような細胞機能等広い領域において全反射顕微鏡を用いた可視化が行われている。個々の例については、参考文献を参照のこと<ref><pmid> 19118676 </pmid></ref>。
・開口放出(exocytosis)／エンドサイトーシス
・細胞接着／細胞骨格
・シグナル伝達（Ca2+, cAMPなど）

==全反射蛍光顕微鏡の原理と特徴==
===全反射===
　屈折率の異なる2つの媒質（媒質1、媒質2）の界面に対し斜めに光を入射させると、屈折光と反射光が発生する。2つの媒質の屈折率をそれぞれn1、n2、入射角をθ1、屈折角をθ2としたとき、スネルの法則
<math>\dfrac{\sin \theta_1}{\sin \theta_2} = \dfrac{n_2}{n_1}</math>

(sinθ_1)/(sinθ_2 )=n_2/n_1
が成立する（図1A）。屈折角θ2が90°になるときの入射角を特に臨界角(critical angle)といい、
θ_C=sin^(-1)⁡(n_2/n_1 )
で示される（ただしθC：臨界角）。2つの媒質の屈折率がn1>n2を満たすとき、θ1>θCの条件で光が入射すると、媒質2には光は透過せず、すべてが反射する。この現象が全反射(total internal reflection)である。たとえばガラス(n1=1.52)と水(n2=1.33)の間における臨界角は約61°となる。
===界面におけるエバネッセント場の形成===
図1Bのようにガラス表面に臨界角以上の角度で光を入射させた場合の試料側で起こる現象を考える。このときガラス側には電磁波（光）が存在し、電磁波は電荷のない界面においては連続的に変化するため、試料側に電磁波のしみ出しが発生する（図1B）。このしみ出した電磁波をエバネッセント場(evanescent field)と呼び、全反射蛍光顕微鏡ではこの光（エバネッセント光）を励起光として利用する。
　エバネッセント光の強度は全反射面からの距離の関数であり、
I(z)=I_0 exp(-z/d)
d=λ/(4π(n_1^2 sin^2⁡〖θ_1 〗-n_2^2 )^(1⁄2) )
で示される。ただし、
I(z): 全反射面からの距離zにおけるエバネッセント光強度
I0: 全反射面における光の強度
d: 光の強度が1/eとなる界面からの距離
λ: 入射光の波長
である。たとえばガラス(n1=1.52)と水(n2=1.33)の間に形成されたエバネッセント光がしみ出す深さdは、励起波長として可視光を用いた場合にはおよそ50–200 nmとなる。
===全反射蛍光顕微鏡の特徴===
Bで示したように、エバネッセント光強度は界面から遠ざかるにつれて急速に減衰する。また、エバネッセント光強度は、界面において最大で入射光の約4倍に強くなる。したがって、界面のごく近傍に存在する蛍光分子のみを効率的に励起できる一方で背景光となる深部に存在する蛍光分子の励起は少なく、高いコントラストで蛍光を観察することが可能となる。

==全反射蛍光顕微鏡の装置構成==
===励起方式===
蛍光顕微鏡下で全反射照明を達成するための励起光の導入方式には、「プリズム式」と「対物レンズ式」の2種類が存在する（図2）。プリズム式は比較的安価に構築でき、背景光を低減できること、入射角を幅広く確保できることなどの利点があるが、試料上方の空間が塞がれてしまうために試料操作が困難であることが欠点である。一方で対物レンズ式は試料上方に空間が得られ、溶液交換や電極設置などの操作が容易に行える。またこの方式では、後述するようにレーザー光の入射位置を調節するだけで容易に全反射照明と落射照明とを切り替えることが可能であり、このような操作性の高さから、近年では対物レンズ式全反射蛍光顕微鏡が複数の顕微鏡メーカーから市販されている。
===対物レンズの選択===
前述のように、全反射蛍光顕微鏡では入射光を臨界角以上の角度で試料へと照射することが必須である。また、試料の目的部位に均一に照明することが必要である。この要件を対物レンズ式にて達成するためには、対物レンズの後焦点面の辺縁部へレーザー光を集光すれば良い。すなわち、レーザー光を、対物レンズ中心軸の距離が試料の屈折率で決まるdn2と対物レンズの開口数(Numerical Aperture; NA)で決まるdNAの間となるように入射させれば良い（図3）。このことから、対物レンズ式全反射蛍光顕微鏡を達成するために必要な対物レンズのNAは試料の屈折率よりも大きいものである必要があることがわかる。各顕微鏡メーカーから1.65/1.49/1.45といった高いNAを持つ対物レンズが市販されており、目的に応じてこれらの対物レンズを選択すると良い。
==参考文献==
<references/>

全反射顕微鏡

2012-06-15T06:05:20Z

Hiroyasuhatakeyama:

英：Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy、英略語：TIRF microscopy, TIRFM 
同義語：Evanescent Wave Microscopy、エバネッセント場顕微鏡 

全反射蛍光顕微鏡は、細胞とカバーガラスとの接着面のごく近傍で起こる分子・細胞内器官の動態や基板表面における1分子蛍光の観察に広く用いられる手法である。この顕微鏡は、光が屈折率の異なる界面において全反射するときに、反対側にわずかにしみ出す光（エバネッセント光）を励起光として利用し、界面のごく近傍のみを照明する手法である。したがって、照明領域以外に存在する蛍光分子の励起を避け、背景光を極めて低減させることが可能となる。

==全反射蛍光顕微鏡による細胞機能の可視化==
現在までに、以下のような細胞機能等広い領域において全反射顕微鏡を用いた可視化が行われている。個々の例については、参考文献を参照のこと<ref><pmid> 19118676 </pmid></ref>。
・開口放出(exocytosis)／エンドサイトーシス
・細胞接着／細胞骨格
・シグナル伝達（Ca2+, cAMPなど）

==全反射蛍光顕微鏡の原理と特徴==
===全反射===
　屈折率の異なる2つの媒質（媒質1、媒質2）の界面に対し斜めに光を入射させると、屈折光と反射光が発生する。2つの媒質の屈折率をそれぞれn1、n2、入射角をθ1、屈折角をθ2としたとき、スネルの法則
<math>\dfrac{\sin \theta_1}{\sin \theta_2} = \dfrac{n_2}{n_1}

(sinθ_1)/(sinθ_2 )=n_2/n_1
が成立する（図1A）。屈折角θ2が90°になるときの入射角を特に臨界角(critical angle)といい、
θ_C=sin^(-1)⁡(n_2/n_1 )
で示される（ただしθC：臨界角）。2つの媒質の屈折率がn1>n2を満たすとき、θ1>θCの条件で光が入射すると、媒質2には光は透過せず、すべてが反射する。この現象が全反射(total internal reflection)である。たとえばガラス(n1=1.52)と水(n2=1.33)の間における臨界角は約61°となる。
===界面におけるエバネッセント場の形成===
図1Bのようにガラス表面に臨界角以上の角度で光を入射させた場合の試料側で起こる現象を考える。このときガラス側には電磁波（光）が存在し、電磁波は電荷のない界面においては連続的に変化するため、試料側に電磁波のしみ出しが発生する（図1B）。このしみ出した電磁波をエバネッセント場(evanescent field)と呼び、全反射蛍光顕微鏡ではこの光（エバネッセント光）を励起光として利用する。
　エバネッセント光の強度は全反射面からの距離の関数であり、
I(z)=I_0 exp(-z/d)
d=λ/(4π(n_1^2 sin^2⁡〖θ_1 〗-n_2^2 )^(1⁄2) )
で示される。ただし、
I(z): 全反射面からの距離zにおけるエバネッセント光強度
I0: 全反射面における光の強度
d: 光の強度が1/eとなる界面からの距離
λ: 入射光の波長
である。たとえばガラス(n1=1.52)と水(n2=1.33)の間に形成されたエバネッセント光がしみ出す深さdは、励起波長として可視光を用いた場合にはおよそ50–200 nmとなる。
===全反射蛍光顕微鏡の特徴===
Bで示したように、エバネッセント光強度は界面から遠ざかるにつれて急速に減衰する。また、エバネッセント光強度は、界面において最大で入射光の約4倍に強くなる。したがって、界面のごく近傍に存在する蛍光分子のみを効率的に励起できる一方で背景光となる深部に存在する蛍光分子の励起は少なく、高いコントラストで蛍光を観察することが可能となる。

==全反射蛍光顕微鏡の装置構成==
===励起方式===
蛍光顕微鏡下で全反射照明を達成するための励起光の導入方式には、「プリズム式」と「対物レンズ式」の2種類が存在する（図2）。プリズム式は比較的安価に構築でき、背景光を低減できること、入射角を幅広く確保できることなどの利点があるが、試料上方の空間が塞がれてしまうために試料操作が困難であることが欠点である。一方で対物レンズ式は試料上方に空間が得られ、溶液交換や電極設置などの操作が容易に行える。またこの方式では、後述するようにレーザー光の入射位置を調節するだけで容易に全反射照明と落射照明とを切り替えることが可能であり、このような操作性の高さから、近年では対物レンズ式全反射蛍光顕微鏡が複数の顕微鏡メーカーから市販されている。
===対物レンズの選択===
前述のように、全反射蛍光顕微鏡では入射光を臨界角以上の角度で試料へと照射することが必須である。また、試料の目的部位に均一に照明することが必要である。この要件を対物レンズ式にて達成するためには、対物レンズの後焦点面の辺縁部へレーザー光を集光すれば良い。すなわち、レーザー光を、対物レンズ中心軸の距離が試料の屈折率で決まるdn2と対物レンズの開口数(Numerical Aperture; NA)で決まるdNAの間となるように入射させれば良い（図3）。このことから、対物レンズ式全反射蛍光顕微鏡を達成するために必要な対物レンズのNAは試料の屈折率よりも大きいものである必要があることがわかる。各顕微鏡メーカーから1.65/1.49/1.45といった高いNAを持つ対物レンズが市販されており、目的に応じてこれらの対物レンズを選択すると良い。
==参考文献==
<references/>

全反射顕微鏡

2012-06-15T05:58:32Z

Hiroyasuhatakeyama:

英：Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy、英略語：TIRF microscopy, TIRFM 
同義語：Evanescent Wave Microscopy、エバネッセント場顕微鏡

全反射蛍光顕微鏡は、細胞とカバーガラスとの接着面のごく近傍で起こる分子・細胞内器官の動態や基板表面における1分子蛍光の観察に広く用いられる手法である。この顕微鏡は、光が屈折率の異なる界面において全反射するときに、反対側にわずかにしみ出す光（エバネッセント光）を励起光として利用し、界面のごく近傍のみを照明する手法である。したがって、照明領域以外に存在する蛍光分子の励起を避け、背景光を極めて低減させることが可能となる。

==全反射蛍光顕微鏡による細胞機能の可視化==
現在までに、以下のような細胞機能等広い領域において全反射顕微鏡を用いた可視化が行われている。個々の例については、参考文献を参照のこと<ref><pmid> 19118676 </pmid></ref>。
・開口放出(exocytosis)／エンドサイトーシス
・細胞接着／細胞骨格
・シグナル伝達（Ca2+, cAMPなど）

==全反射蛍光顕微鏡の原理と特徴==
===全反射===
　屈折率の異なる2つの媒質（媒質1、媒質2）の界面に対し斜めに光を入射させると、屈折光と反射光が発生する。2つの媒質の屈折率をそれぞれn1、n2、入射角をθ1、屈折角をθ2としたとき、スネルの法則
(sinθ_1)/(sinθ_2 )=n_2/n_1
が成立する（図1A）。屈折角θ2が90°になるときの入射角を特に臨界角(critical angle)といい、
θ_C=sin^(-1)⁡(n_2/n_1 )
で示される（ただしθC：臨界角）。2つの媒質の屈折率がn1>n2を満たすとき、θ1>θCの条件で光が入射すると、媒質2には光は透過せず、すべてが反射する。この現象が全反射(total internal reflection)である。たとえばガラス(n1=1.52)と水(n2=1.33)の間における臨界角は約61°となる。
===界面におけるエバネッセント場の形成===
図1Bのようにガラス表面に臨界角以上の角度で光を入射させた場合の試料側で起こる現象を考える。このときガラス側には電磁波（光）が存在し、電磁波は電荷のない界面においては連続的に変化するため、試料側に電磁波のしみ出しが発生する（図1B）。このしみ出した電磁波をエバネッセント場(evanescent field)と呼び、全反射蛍光顕微鏡ではこの光（エバネッセント光）を励起光として利用する。
　エバネッセント光の強度は全反射面からの距離の関数であり、
I(z)=I_0 exp(-z/d)
d=λ/(4π(n_1^2 sin^2⁡〖θ_1 〗-n_2^2 )^(1⁄2) )
で示される。ただし、
I(z): 全反射面からの距離zにおけるエバネッセント光強度
I0: 全反射面における光の強度
d: 光の強度が1/eとなる界面からの距離
λ: 入射光の波長
である。たとえばガラス(n1=1.52)と水(n2=1.33)の間に形成されたエバネッセント光がしみ出す深さdは、励起波長として可視光を用いた場合にはおよそ50–200 nmとなる。
===全反射蛍光顕微鏡の特徴===
Bで示したように、エバネッセント光強度は界面から遠ざかるにつれて急速に減衰する。また、エバネッセント光強度は、界面において最大で入射光の約4倍に強くなる。したがって、界面のごく近傍に存在する蛍光分子のみを効率的に励起できる一方で背景光となる深部に存在する蛍光分子の励起は少なく、高いコントラストで蛍光を観察することが可能となる。

==全反射蛍光顕微鏡の装置構成==
===励起方式===
蛍光顕微鏡下で全反射照明を達成するための励起光の導入方式には、「プリズム式」と「対物レンズ式」の2種類が存在する（図2）。プリズム式は比較的安価に構築でき、背景光を低減できること、入射角を幅広く確保できることなどの利点があるが、試料上方の空間が塞がれてしまうために試料操作が困難であることが欠点である。一方で対物レンズ式は試料上方に空間が得られ、溶液交換や電極設置などの操作が容易に行える。またこの方式では、後述するようにレーザー光の入射位置を調節するだけで容易に全反射照明と落射照明とを切り替えることが可能であり、このような操作性の高さから、近年では対物レンズ式全反射蛍光顕微鏡が複数の顕微鏡メーカーから市販されている。
===対物レンズの選択===
前述のように、全反射蛍光顕微鏡では入射光を臨界角以上の角度で試料へと照射することが必須である。また、試料の目的部位に均一に照明することが必要である。この要件を対物レンズ式にて達成するためには、対物レンズの後焦点面の辺縁部へレーザー光を集光すれば良い。すなわち、レーザー光を、対物レンズ中心軸の距離が試料の屈折率で決まるdn2と対物レンズの開口数(Numerical Aperture; NA)で決まるdNAの間となるように入射させれば良い（図3）。このことから、対物レンズ式全反射蛍光顕微鏡を達成するために必要な対物レンズのNAは試料の屈折率よりも大きいものである必要があることがわかる。各顕微鏡メーカーから1.65/1.49/1.45といった高いNAを持つ対物レンズが市販されており、目的に応じてこれらの対物レンズを選択すると良い。
==参考文献==
<references/>

全反射顕微鏡

2012-06-15T05:56:28Z

Hiroyasuhatakeyama:

全反射蛍光顕微鏡
英：Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy、英略語：TIRF microscopy, TIRFM
同義語：Evanescent Wave Microscopy、エバネッセント場顕微鏡

全反射蛍光顕微鏡は、細胞とカバーガラスとの接着面のごく近傍で起こる分子・細胞内器官の動態や基板表面における1分子蛍光の観察に広く用いられる手法である。この顕微鏡は、光が屈折率の異なる界面において全反射するときに、反対側にわずかにしみ出す光（エバネッセント光）を励起光として利用し、界面のごく近傍のみを照明する手法である。したがって、照明領域以外に存在する蛍光分子の励起を避け、背景光を極めて低減させることが可能となる。

==全反射蛍光顕微鏡による細胞機能の可視化==
現在までに、以下のような細胞機能等広い領域において全反射顕微鏡を用いた可視化が行われている。個々の例については、参考文献を参照のこと<ref><pmid> 19118676 </pmid></ref>。
・開口放出(exocytosis)／エンドサイトーシス
・細胞接着／細胞骨格
・シグナル伝達（Ca2+, cAMPなど）

==全反射蛍光顕微鏡の原理と特徴==
===全反射===
　屈折率の異なる2つの媒質（媒質1、媒質2）の界面に対し斜めに光を入射させると、屈折光と反射光が発生する。2つの媒質の屈折率をそれぞれn1、n2、入射角をθ1、屈折角をθ2としたとき、スネルの法則
(sinθ_1)/(sinθ_2 )=n_2/n_1
が成立する（図1A）。屈折角θ2が90°になるときの入射角を特に臨界角(critical angle)といい、
θ_C=sin^(-1)⁡(n_2/n_1 )
で示される（ただしθC：臨界角）。2つの媒質の屈折率がn1>n2を満たすとき、θ1>θCの条件で光が入射すると、媒質2には光は透過せず、すべてが反射する。この現象が全反射(total internal reflection)である。たとえばガラス(n1=1.52)と水(n2=1.33)の間における臨界角は約61°となる。
===界面におけるエバネッセント場の形成===
図1Bのようにガラス表面に臨界角以上の角度で光を入射させた場合の試料側で起こる現象を考える。このときガラス側には電磁波（光）が存在し、電磁波は電荷のない界面においては連続的に変化するため、試料側に電磁波のしみ出しが発生する（図1B）。このしみ出した電磁波をエバネッセント場(evanescent field)と呼び、全反射蛍光顕微鏡ではこの光（エバネッセント光）を励起光として利用する。
　エバネッセント光の強度は全反射面からの距離の関数であり、
I(z)=I_0 exp(-z/d)
d=λ/(4π(n_1^2 sin^2⁡〖θ_1 〗-n_2^2 )^(1⁄2) )
で示される。ただし、
I(z): 全反射面からの距離zにおけるエバネッセント光強度
I0: 全反射面における光の強度
d: 光の強度が1/eとなる界面からの距離
λ: 入射光の波長
である。たとえばガラス(n1=1.52)と水(n2=1.33)の間に形成されたエバネッセント光がしみ出す深さdは、励起波長として可視光を用いた場合にはおよそ50–200 nmとなる。
===全反射蛍光顕微鏡の特徴===
Bで示したように、エバネッセント光強度は界面から遠ざかるにつれて急速に減衰する。また、エバネッセント光強度は、界面において最大で入射光の約4倍に強くなる。したがって、界面のごく近傍に存在する蛍光分子のみを効率的に励起できる一方で背景光となる深部に存在する蛍光分子の励起は少なく、高いコントラストで蛍光を観察することが可能となる。

==全反射蛍光顕微鏡の装置構成==
===励起方式===
蛍光顕微鏡下で全反射照明を達成するための励起光の導入方式には、「プリズム式」と「対物レンズ式」の2種類が存在する（図2）。プリズム式は比較的安価に構築でき、背景光を低減できること、入射角を幅広く確保できることなどの利点があるが、試料上方の空間が塞がれてしまうために試料操作が困難であることが欠点である。一方で対物レンズ式は試料上方に空間が得られ、溶液交換や電極設置などの操作が容易に行える。またこの方式では、後述するようにレーザー光の入射位置を調節するだけで容易に全反射照明と落射照明とを切り替えることが可能であり、このような操作性の高さから、近年では対物レンズ式全反射蛍光顕微鏡が複数の顕微鏡メーカーから市販されている。
===対物レンズの選択===
前述のように、全反射蛍光顕微鏡では入射光を臨界角以上の角度で試料へと照射することが必須である。また、試料の目的部位に均一に照明することが必要である。この要件を対物レンズ式にて達成するためには、対物レンズの後焦点面の辺縁部へレーザー光を集光すれば良い。すなわち、レーザー光を、対物レンズ中心軸の距離が試料の屈折率で決まるdn2と対物レンズの開口数(Numerical Aperture; NA)で決まるdNAの間となるように入射させれば良い（図3）。このことから、対物レンズ式全反射蛍光顕微鏡を達成するために必要な対物レンズのNAは試料の屈折率よりも大きいものである必要があることがわかる。各顕微鏡メーカーから1.65/1.49/1.45といった高いNAを持つ対物レンズが市販されており、目的に応じてこれらの対物レンズを選択すると良い。

全反射顕微鏡

2012-06-15T05:52:40Z

Hiroyasuhatakeyama:

全反射蛍光顕微鏡 Total Internal Reflection Fluorescence (TIRF) Microscopy Evanescent Wave Microscopy

全反射蛍光顕微鏡は、細胞とカバーガラスとの接着面のごく近傍で起こる分子・細胞内器官の動態や基板表面における1分子蛍光の観察に広く用いられる手法である。この顕微鏡は、光が屈折率の異なる界面において全反射するときに、反対側にわずかにしみ出す光（エバネッセント光）を励起光として利用し、界面のごく近傍のみを照明する手法である。したがって、照明領域以外に存在する蛍光分子の励起を避け、背景光を極めて低減させることが可能となる。

全反射蛍光顕微鏡による細胞機能の可視化 現在までに、以下のような細胞機能等広い領域において全反射顕微鏡を用いた可視化が行われている。個々の例については、各種参考文献を参照のこと<ref><pmid>19118676</pmid></ref>。 ・開口放出(exocytosis)／エンドサイトーシス ・細胞接着／細胞骨格 ・シグナル伝達（Ca2+, cAMPなど）

全反射蛍光顕微鏡の原理と特徴 全反射 　屈折率の異なる2つの媒質（媒質1、媒質2）の界面に対し斜めに光を入射させると、屈折光と反射光が発生する。2つの媒質の屈折率をそれぞれn1、n2、入射角をθ1、屈折角をθ2としたとき、スネルの法則 (sinθ_1)/(sinθ_2 )=n_2/n_1 が成立する（図1A）。屈折角θ2が90°になるときの入射角を特に臨界角(critical angle)といい、 θ_C=sin^(-1)⁡(n_2/n_1 ) で示される（ただしθC：臨界角）。2つの媒質の屈折率がn1>n2を満たすとき、θ1>θCの条件で光が入射すると、媒質2には光は透過せず、すべてが反射する。この現象が全反射(total internal reflection)である。たとえばガラス(n1=1.52)と水(n2=1.33)の間における臨界角は約61°となる。 界面におけるエバネッセント場の形成 図1Bのようにガラス表面に臨界角以上の角度で光を入射させた場合の試料側で起こる現象を考える。このときガラス側には電磁波（光）が存在し、電磁波は電荷のない界面においては連続的に変化するため、試料側に電磁波のしみ出しが発生する（図1B）。このしみ出した電磁波をエバネッセント場(evanescent field)と呼び、全反射蛍光顕微鏡ではこの光（エバネッセント光）を励起光として利用する。 　エバネッセント光の強度は全反射面からの距離の関数であり、 I(z)=I_0 exp(-z/d) d=λ/(4π(n_1^2 sin^2⁡〖θ_1 〗-n_2^2 )^(1⁄2) ) で示される。ただし、 I(z): 全反射面からの距離zにおけるエバネッセント光強度 I0: 全反射面における光の強度 d: 光の強度が1/eとなる界面からの距離 λ: 入射光の波長 である。たとえばガラス(n1=1.52)と水(n2=1.33)の間に形成されたエバネッセント光がしみ出す深さdは、励起波長として可視光を用いた場合にはおよそ50–200 nmとなる。 全反射蛍光顕微鏡の特徴 Bで示したように、エバネッセント光強度は界面から遠ざかるにつれて急速に減衰する。また、エバネッセント光強度は、界面において最大で入射光の約4倍に強くなる。したがって、界面のごく近傍に存在する蛍光分子のみを効率的に励起できる一方で背景光となる深部に存在する蛍光分子の励起は少なく、高いコントラストで蛍光を観察することが可能となる。

全反射蛍光顕微鏡の装置構成 励起方式 蛍光顕微鏡下で全反射照明を達成するための励起光の導入方式には、「プリズム式」と「対物レンズ式」の2種類が存在する（図2）。プリズム式は比較的安価に構築でき、背景光を低減できること、入射角を幅広く確保できることなどの利点があるが、試料上方の空間が塞がれてしまうために試料操作が困難であることが欠点である。一方で対物レンズ式は試料上方に空間が得られ、溶液交換や電極設置などの操作が容易に行える。またこの方式では、後述するようにレーザー光の入射位置を調節するだけで容易に全反射照明と落射照明とを切り替えることが可能であり、このような操作性の高さから、近年では対物レンズ式全反射蛍光顕微鏡が複数の顕微鏡メーカーから市販されている。 対物レンズの選択 前述のように、全反射蛍光顕微鏡では入射光を臨界角以上の角度で試料へと照射することが必須である。また、試料の目的部位に均一に照明することが必要である。この要件を対物レンズ式にて達成するためには、対物レンズの後焦点面の辺縁部へレーザー光を集光すれば良い。すなわち、レーザー光を、対物レンズ中心軸の距離が試料の屈折率で決まるdn2と対物レンズの開口数(Numerical Aperture; NA)で決まるdNAの間となるように入射させれば良い（図3）。このことから、対物レンズ式全反射蛍光顕微鏡を達成するために必要な対物レンズのNAは試料の屈折率よりも大きいものである必要があることがわかる。各顕微鏡メーカーから1.65/1.49/1.45といった高いNAを持つ対物レンズが市販されており、目的に応じてこれらの対物レンズを選択すると良い。 
<references/>

全反射顕微鏡

2012-06-15T05:50:04Z

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全反射蛍光顕微鏡 Total Internal Reflection Fluorescence (TIRF) Microscopy Evanescent Wave Microscopy

全反射蛍光顕微鏡は、細胞とカバーガラスとの接着面のごく近傍で起こる分子・細胞内器官の動態や基板表面における1分子蛍光の観察に広く用いられる手法である。この顕微鏡は、光が屈折率の異なる界面において全反射するときに、反対側にわずかにしみ出す光（エバネッセント光）を励起光として利用し、界面のごく近傍のみを照明する手法である。したがって、照明領域以外に存在する蛍光分子の励起を避け、背景光を極めて低減させることが可能となる。

全反射蛍光顕微鏡による細胞機能の可視化 現在までに、以下のような細胞機能等広い領域において全反射顕微鏡を用いた可視化が行われている。個々の例については、各種参考文献を参照のこと(Axelrod 2008)。 ・開口放出(exocytosis)／エンドサイトーシス ・細胞接着／細胞骨格 ・シグナル伝達（Ca2+, cAMPなど）

全反射蛍光顕微鏡の原理と特徴 全反射 　屈折率の異なる2つの媒質（媒質1、媒質2）の界面に対し斜めに光を入射させると、屈折光と反射光が発生する。2つの媒質の屈折率をそれぞれn1、n2、入射角をθ1、屈折角をθ2としたとき、スネルの法則 (sinθ_1)/(sinθ_2 )=n_2/n_1 が成立する（図1A）。屈折角θ2が90°になるときの入射角を特に臨界角(critical angle)といい、 θ_C=sin^(-1)⁡(n_2/n_1 ) で示される（ただしθC：臨界角）。2つの媒質の屈折率がn1>n2を満たすとき、θ1>θCの条件で光が入射すると、媒質2には光は透過せず、すべてが反射する。この現象が全反射(total internal reflection)である。たとえばガラス(n1=1.52)と水(n2=1.33)の間における臨界角は約61°となる。 界面におけるエバネッセント場の形成 図1Bのようにガラス表面に臨界角以上の角度で光を入射させた場合の試料側で起こる現象を考える。このときガラス側には電磁波（光）が存在し、電磁波は電荷のない界面においては連続的に変化するため、試料側に電磁波のしみ出しが発生する（図1B）。このしみ出した電磁波をエバネッセント場(evanescent field)と呼び、全反射蛍光顕微鏡ではこの光（エバネッセント光）を励起光として利用する。 　エバネッセント光の強度は全反射面からの距離の関数であり、 I(z)=I_0 exp(-z/d) d=λ/(4π(n_1^2 sin^2⁡〖θ_1 〗-n_2^2 )^(1⁄2) ) で示される。ただし、 I(z): 全反射面からの距離zにおけるエバネッセント光強度 I0: 全反射面における光の強度 d: 光の強度が1/eとなる界面からの距離 λ: 入射光の波長 である。たとえばガラス(n1=1.52)と水(n2=1.33)の間に形成されたエバネッセント光がしみ出す深さdは、励起波長として可視光を用いた場合にはおよそ50–200 nmとなる。 全反射蛍光顕微鏡の特徴 Bで示したように、エバネッセント光強度は界面から遠ざかるにつれて急速に減衰する。また、エバネッセント光強度は、界面において最大で入射光の約4倍に強くなる。したがって、界面のごく近傍に存在する蛍光分子のみを効率的に励起できる一方で背景光となる深部に存在する蛍光分子の励起は少なく、高いコントラストで蛍光を観察することが可能となる。

全反射蛍光顕微鏡の装置構成 励起方式 蛍光顕微鏡下で全反射照明を達成するための励起光の導入方式には、「プリズム式」と「対物レンズ式」の2種類が存在する（図2）。プリズム式は比較的安価に構築でき、背景光を低減できること、入射角を幅広く確保できることなどの利点があるが、試料上方の空間が塞がれてしまうために試料操作が困難であることが欠点である。一方で対物レンズ式は試料上方に空間が得られ、溶液交換や電極設置などの操作が容易に行える。またこの方式では、後述するようにレーザー光の入射位置を調節するだけで容易に全反射照明と落射照明とを切り替えることが可能であり、このような操作性の高さから、近年では対物レンズ式全反射蛍光顕微鏡が複数の顕微鏡メーカーから市販されている。 対物レンズの選択 前述のように、全反射蛍光顕微鏡では入射光を臨界角以上の角度で試料へと照射することが必須である。また、試料の目的部位に均一に照明することが必要である。この要件を対物レンズ式にて達成するためには、対物レンズの後焦点面の辺縁部へレーザー光を集光すれば良い。すなわち、レーザー光を、対物レンズ中心軸の距離が試料の屈折率で決まるdn2と対物レンズの開口数(Numerical Aperture; NA)で決まるdNAの間となるように入射させれば良い（図3）。このことから、対物レンズ式全反射蛍光顕微鏡を達成するために必要な対物レンズのNAは試料の屈折率よりも大きいものである必要があることがわかる。各顕微鏡メーカーから1.65/1.49/1.45といった高いNAを持つ対物レンズが市販されており、目的に応じてこれらの対物レンズを選択すると良い。