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CLUSTALWプログラムにより作成した[[シナプトタグミン]]1から15までの系統樹を示す。シナプトタグミンファミリーはアミノ酸配列の相同性からシナプトタグミン1/2/9（赤）、シナプトタグミン4/11（緑）、シナプトタグミン3/5/6/10（青）、およびそれ以外のシナプトタグミンに分類される。[[カルシウム]]結合能を持つアイソフォームを青色の四角で囲った。なお、シナプトタグミン4はカルシウム非結合型に分類されることが多いが、アストロサイトなど一部の細胞でカルシウムセンサーとして機能することが報告されている（点線の四角）。