「開口確率」の版間の差分

2012年6月16日 (土) 14:05時点における版

開口確率 open probability, Po

イオンチャネルのシングルチャネル記録を行なうと、チャネルの開閉が確率論的な振る舞いをすることが分かる。イオンチャネルが開いた状態にある確率を開口確率という。イオンチャネルの開きやすさの指標として用いられる。

一つのイオンチャネルからの記録を行なっている時、このイオンチャネルの開口確率（Po）はamplitude histgramから簡単に測定することが出来る。チャネルが開口している状態の部分の面積（チャネルが開口している時間の長さに比例）をヒストグラム全体の面積（記録を行った時間の長さに比例）で割れば良い。複数個（n個）のチャネルがパッチ内にあるときは、そのパッチのチャネルの平均Poは、 Po=ΣnAn/nΣAnで求めることが出来る。

例えば、3このイオンチャネルが含まれる場合、Po=(3A3+2A2+1A1+0A0)/3(A3+A2+A1+A0)

A3は3個全てが開いている状態の部分の面積

（執筆者：古谷和春、倉智嘉久　担当編集委員：林康紀）

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-<div align="right">
+開口確率 open probability, Po
-<font size="+1">[http://researchmap.jp/kazuharu_furutani 古谷 和春]、[http://researchmap.jp/read0042758 倉智 嘉久]</font><br>
-''大阪大学 医学系研究科''<br>
-DOI：<selfdoi />　原稿受付日：2012年7月9日　原稿完成日：2013年8月20日<br>
-担当編集委員：[http://researchmap.jp/2rikenbsi 林 康紀]（独立行政法人理化学研究所 脳科学総合研究センター）<br>
-</div>
-英：open probability、英語略：''P''<sub>o</sub>　独：Offenwahrscheinlichkeit　仏：probabilité d'ouverture
+イオンチャネルのシングルチャネル記録を行なうと、チャネルの開閉が確率論的な振る舞いをすることが分かる。イオンチャネルが開いた状態にある確率を開口確率という。イオンチャネルの開きやすさの指標として用いられる。
-{{box|text=
+一つのイオンチャネルからの記録を行なっている時、このイオンチャネルの開口確率（Po）はamplitude histgramから簡単に測定することが出来る。チャネルが開口している状態の部分の面積（チャネルが開口している時間の長さに比例）をヒストグラム全体の面積（記録を行った時間の長さに比例）で割れば良い。
-　[[イオンチャネル]]の[[シングルチャネル記録]]を行なうと、チャネルの開閉が[[wikipedia:ja:確率論|確率論]]的な振る舞いをすることが分かる（図1A）。イオンチャネルが開いた状態にある確率を開口確率（もしくは開確率）という<ref>'''Bertil Hille''' <br>Ion Channels of Excitable Membrane third edition<br>Sinauer Associates,Inc.(Massachusetts,USA)</ref>。イオンチャネルの開きやすさの指標として用いられ、イオンチャネルの個数N、シングルチャネル電流iとともに[[生体膜]]のイオン電流量を規定する。
+複数個（n個）のチャネルがパッチ内にあるときは、そのパッチのチャネルの平均Poは、
+Po=ΣnAn/nΣAnで求めることが出来る。
-I=N''P''<sub>o</sub>i
+#例えば、3このイオンチャネルが含まれる場合、Po=(3A3+2A2+1A1+0A0)/3(A3+A2+A1+A0)
+A3は3個全てが開いている状態の部分の面積
-　一方で、図2に図解したケースでは、開口確率''P''<sub>o</sub>が同じにも関わらずそれぞれのゲート機能（振る舞い）は異なっていると解釈できる。つまり''P''<sub>o</sub>はイオンチャネルの開きやすさの指標となるが、[[ゲート]]機能の絶対的な指標ではない。
+（執筆者：古谷和春、倉智嘉久　担当編集委員：林康紀）
-　イオンチャネルの機能は[[膜電位]]変化や選択的な[[リガンド]]との結合で制御されるが、このような場合、開口確率が変化していることが多い。
-}}
-== 開口確率の求め方 ==
-[[Image:Open_probability_fig1.png|thumb|right|336x257px|<b>図1．Kir2.1チャネルのsingle channel recordingの解析</b><br>A: single channel current ([K]<sub>o</sub>=[K]<sub>i</sub>=150 mM、-100 mV、室温）。 B: Amplitude Histogram。この場合の''P''<sub>o</sub>は0.91であった。]]
-[[Image:Open_probability_fig2.png|thumb|right|336px|'''図2．異なる振る舞いをみせるシングルチャネルの仮想的電流''']]
-　一個のイオンチャネルからの記録を行なっている時、このイオンチャネルの開口確率（''P''<sub>o</sub>）はamplitude histogramから簡単に求めること出来る（図1B） 。チャネルが開口している状態の部分の面積（チャネルが開口している時間の長さに比例）をヒストグラム全体の面積（記録を行った時間の長さに比例）で割れば良い。
-　複数個（N個）のチャネルがパッチ内にあるときは、そのパッチのチャネルの平均''P''<sub>o</sub>は、<br> <br> <math>P_o=\sum_{k=1}^NkAk/k\sum_{k=1}^NAk</math> <br> <br> で求めることが出来る。
-　例えば、3個のイオンチャネルが含まれる場合は、以下の式から求めることが出来る。<br> <br> <math>P_o=\frac{3A3+2A2+1A1+0A0}{3 (A3+A2+A1+A0)}</math> <br>
-　ここで、A3は3個全てが開いている状態の部分の面積である。<br>
-==開口確率の構造基盤==
-　開口確率はチャネルの開閉に繋がる構造変化の平衡の全体を反映するものである。つまり、この平衡に影響を及ぼす部位はチャネルの開口確率の値に関わる。
-　チャネルの開口確率を決定している機構的な構造としては以下のようなものが考えられる。
-#チャネルの開構造open structure、閉構造closed structureの構造的安定性に関わる部位
-#チャネルのゲーティングに繋がる構造変化に関わる部位
-#リガンド結合部位や電位センサー領域などチャネルのゲート機能を制御する外部刺激や情報（神経伝達物質や薬物なども含む）を受容する部位
-　上記1-3は形式上分類したが、それらはお互い密接に関係するものであるため、ある部位がどの機能に関わるか定義できない可能性もある。
-また、これらの構造的基盤はチャネルの種類によって異なるため、例えば活性化状態にあるイオンチャネルにおける開口確率もチャネルの種類によって異なる。
-==関連項目==
-*[[イオンチャネル]]
-*[[ゲート]]
-*[[パッチクランプ法]]
-== 参考文献 ==
-<references />

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