「機能獲得実験」の版間の差分

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<br>英：gain of function
<font size="+1">[http://researchmap.jp/read0204069 平林 敬浩]、[http://researchmap.jp/read0076409 八木 健]</font><br>
''大阪大学 大学院生命機能研究科''<br>
DOI：<selfdoi />　原稿受付日：2013年2月12日　原稿完成日：2016年5月2日<br>
担当編集委員：[http://researchmap.jp/read0080380 上口 裕之]（独立行政法人理化学研究所 脳科学総合研究センター）<br>         
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英語名：gain of function
　ある遺伝子の機能を調べる際にその遺伝子の機能や発現量を増強させることで機能を類推する実験手法を機能獲得実験という。


{{box|text=
==機能獲得実験とは==
　ある[[wikipedia:ja:遺伝子|遺伝子]]の機能を調べる際にその遺伝子の機能や発現量を増強させることで機能を類推する実験手法を機能獲得実験という。
}}


== 機能獲得実験とは  ==
　ある遺伝子の機能を調べる際にその遺伝子の機能・発現量を増強させて得られた表現型から機能解析する実験手法。逆に遺伝子の機能や発現量を減弱させる実験は[[機能欠失実験]]と呼ばれる。
また、[[機能欠失実験]]によって得られた表現型を機能獲得実験により正常な表現型に回復させる実験を特にrescue実験と呼ぶ


　ある遺伝子の機能を調べる際にその遺伝子の機能・発現量を増強させて得られた表現型から機能解析する実験手法。逆に遺伝子の機能や発現量を減弱させる実験は[[機能欠失実験]]と呼ばれる。 また、機能欠失実験によって得られた表現型を機能獲得実験により正常な表現型に回復させる実験を特にrescue実験と呼ぶ


== 遺伝子導入による発現量の増加  ==
==機能獲得実験の手法==


　動物個体あるいは細胞に外来遺伝子を導入することで任意の遺伝子
==遺伝子導入による発現量の増加==


　発現量を増加させることができる。外来遺伝子を導入した動物個体は[[トランスジェニック動物]]と呼ばれ現在ではあらゆる動物種で作製が可能となっている。
　動物個体あるいは細胞に外来遺伝子を導入することで任意の遺伝子発現量を増加させることができる。外来遺伝子を導入した動物個体はトランスジェニック動物と呼ばれ現在ではあらゆる動物種で作製が可能となっている。


=== 導入する遺伝子  ===
[[Image:機能獲得実験.jpg|thumb|300px|'''図1．発現量を増加させる外来遺伝子の構造''']]


　この外来遺伝子は遺伝子発現制御するプロモーター配列の下流に目的の遺伝子、さらに[[wikipedia:ja:polyA付加配列|polyA付加配列]]という構造をもつものが一般的である（図1）。この外来遺伝子を構築する際、どのプロモーター配列を選択するかにより目的遺伝子の発現部位、発現時期、発現量が決まる。
===導入する遺伝子===


=== 導入方法  ===
　この外来遺伝子は遺伝子発現制御するプロモーター配列の下流に目的の遺伝子、さらにpolyA付加配列という構造をもつものが一般的である（図）。この外来遺伝子を構築する際、どのプロモーター配列を選択するかにより目的遺伝子の発現部位、発現時期、発現量が決まる。


　現在では遺伝子の導入方法として主に以下の方法が用いられている。


*リン酸カルシウム法<br>　導入する遺伝子 (DNA)と[[wikipedia:ja:リン酸カルシウム|リン酸カルシウム]]を混和することで形成された不溶性複合体を細胞表面に吸着させ、細胞の[[wikipedia:ja:食作用|食作用]]などを利用して細胞内に遺伝子を導入する方法。操作が簡便で特殊な装置を必要としない。
===遺伝子導入の方法===
*リポフェクション法<br>　正に荷電している[[wikipedia:ja:脂質|脂質]]からなる[[wikipedia:ja:脂質二重膜小胞|脂質二重膜小胞]]（[[wikipedia:ja:リポソーム|リポソーム]]）と負に荷電している遺伝子は電気的に複合体を形成する。これらを負に荷電している[[細胞膜]]と融合、あるいは細胞の食作用などにより細胞に取り込まれる。リン酸カルシウム法と同様に特殊な装置を必要とぜず、また各社から試薬が市販されているため[[細胞株|培養細胞]]では広く用いられている。
*エレクトロポレーション法<br>　高電圧パルスを細胞に与えることで細胞膜構造に小孔をあけ、遺伝子を導入する方法。遺伝子導入効率は比較的高い反面、細胞生存率は低い。
*パーティクルガン法<br>　[[wikipedia:ja:金|金]]などの高比重かつ化学的に安定な金属粒子を導入したい遺伝子でコーティングしたものを高圧ガスで射出し細胞内に物理的に導入する方法。ジーンガンとも呼ばれる。
*ウイルスベクター法<br>　目的の遺伝子を組み込んだウイルスを細胞に感染させることで遺伝子を導入する方法。現在では主に、[[wikipedia:ja:アデノウイルスベクター|アデノウイルスベクター]]、[[wikipedia:ja:アデノ随伴ウイルスベクター|アデノ随伴ウイルスベクター]]の他、感染した細胞内で逆転写されて細胞ゲノムにに組み込まれる[[wikipedia:ja:レトロウイルスベクター|レトロウイルスベクター]]、[[wikipedia:ja:レンチウイルスベクター|レンチウイルスベクター]]などが使用されている。
*マイクロインジェクション法<br>　微細なガラス管をを介し細胞に直接遺伝子を導入する方法。個々の細胞に対して操作が必要であるため対象とする細胞数に制限が生じるが、導入効率が高いためトランスジェニック動物作製時においては本法で受精卵に遺伝子を導入するのが一般的である。


== 機能の増強  ==
現在では遺伝子の導入方法として主に以下の方法が用いられている。


=== アミノ酸置換による疑似リン酸化  ===
====リン酸カルシウム法====


　目的のタンパク質が持つアミノ酸がリン酸化されることでその機能が増強する場合、そのアミノ酸を[[グルタミン酸]], または[[wikipedia:ja:アスパラギン酸|アスパラギン酸]]に置換した変異体を発現することで恒常的なリン酸化状態を擬似的に再現できる場合がある。これはリン酸化アミノ酸が水溶液中では負電荷をもつが、グルタミン酸、アスパラギン酸などの酸性アミノ酸も負電荷をもつためである。例えば、[[リン酸化酵素]][[MAP kinase kinase]] (MKK)はSer218およびSer222は上流の[[Raf1]]/[[MAP KKK]]によりリン酸化されることで活性化するが、これらのセリン残基をグルタミン酸に置換したMAPKK変異体は恒常的に活性を持つ<ref><pubmed> 7936666 </pubmed></ref>。
　導入する遺伝子 (DNA)とリン酸カルシウムを混和することで形成された不溶性複合体を細胞表面に吸着させ、細胞の食作用などを利用して細胞内に遺伝子を導入する方法。操作が簡便で特殊な装置を必要としない。


=== 局在の変化  ===
====リポフェクション法====


　目的のタンパク質が局在の変化がその機能が増強する場合、そのタンパク質の局在を強制的に変化させる変異を導入することで機能を増強することが出来る。リン酸化酵素[[AKT]]は細胞膜へ移行することで活性化すると考えられているが[[ミリストイル化]]配列を付加したAKTは恒常的に活性化する<ref><pubmed> 10467260 </pubmed></ref>
　正に荷電している脂質からなる脂質二重膜小胞（リポソーム）と負に荷電している遺伝子は電気的に複合体を形成する。これらを負に荷電している細胞膜と融合、あるいは細胞の食作用などにより細胞に取り込まれる。リン酸カルシウム法と同様に特殊な装置を必要とぜず、また各社から試薬が市販されているため培養細胞では広く用いられている。


=== 阻害ドメインの欠失 ===
====エレクトロポレーション法====


[[Image:機能獲得実験図２.jpg|thumb|300px|'''図２．(A) CaMKIIの構造　AID：自己抑制ドメイン、CaM-BD：Ca2+/カルモジュリン結合ドメイン　(B)  CaMKIIの活性化　(C) 活性化型CaMKII ]]
　高電圧パルスを細胞に与えることで細胞膜構造に小孔をあけ、遺伝子を導入する方法。遺伝子導入効率は比較的高い反面、細胞生存率は低い。


　ある種の酵素はそのタンパク質内に自身の活性を抑制する自己阻害ドメイン (autoinhibitory domain)を持ち、酵素活性の制御をしている。
====パーティクルガン法====
カルシウムカルモジュリン依存性タンパク質キナーゼII (CaMKII)はキナーゼドメイン、自己阻害ドメイン (AID)とCa2+/カルモジュリン結合ドメイン (CaM-BD)で構成される調節ドメインからなり（図2A）、カルシウムカルモジュリン (Ca2+/CaM)複合体の非存在下では、自己抑制ドメイン（autoinhibitory domain）により活性が抑制されている。Ca2+/カルモジュリン結合ドメインにCa2+/カルモジュリンが結合するとタンパク質立体構造が変化し、自己抑制が解除されて活性化する（図2B）<ref><pubmed> 21884935 </pubmed></ref>。このように目的のタンパク質が持つ自己阻害ドメインにより活性制御されている場合、阻害ドメインを欠失したタンパク質は恒常的に活性化している（図2C）<ref><pubmed> 1651329 </pubmed></ref>。


　金などの高比重かつ科学的に安定な金属粒子を導入したい遺伝子でコーティングしたものを高圧ガスで射出し細胞内に物理的に導入する方法。ジーンガンとも呼ばれる。


====ウイルスベクター法====


==関連項目==
　目的の遺伝子を組み込んだウイルスを細胞に感染させることで遺伝子を導入する方法。現在では主に、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクターの他、感染した細胞内で逆転写されて細胞ゲノムにに組み込まれるレトロウイルスベクター、レンチウイルスベクターなどが使用されている。
*[[機能欠失実験]]
*[[遺伝子導入]]
*[[ウイルスベクター]]
*[[トランスジェニック動物]]


====マイクロインジェクション法====


== 参考文献 ==
　微細なガラス管をを介し細胞に直接遺伝子を導入する方法。個々の細胞に対して操作が必要であるため対象とする細胞数に制限が生じるが、導入効率が高いためトランスジェニック動物作製時においては本法で受精卵に遺伝子を導入するのが一般的である。


<references />
==機能の増強==
1. アミノ酸置換による疑似リン酸化
 
目的のタンパク質が持つアミノ酸がリン酸化されることでその機能が増強する場合、そのアミノ酸をGlu, またはAspに置換した変異体を発現することで恒常的なリン酸化状態を擬似的に再現できる場合がある。これはリン酸化アミノ酸が水溶液中では負電荷をもつが、Glu, Aspなどの酸性アミノ酸も負電荷をもつためである。
 
例）MAP kinase kinase (MKK)はSer218およびSer222は上流のRaf1/MAP KKKによりリン酸化されることで活性化する。これらのSer残基をGluに置換したMAPKK変異体は恒常的に活性化する<ref><pubmed>7936666 </pubmed></ref>
 
局在の変化
AKT

2013年2月10日 (日) 14:14時点における版


英：gain of function

　ある遺伝子の機能を調べる際にその遺伝子の機能や発現量を増強させることで機能を類推する実験手法を機能獲得実験という。

機能獲得実験とは

　ある遺伝子の機能を調べる際にその遺伝子の機能・発現量を増強させて得られた表現型から機能解析する実験手法。逆に遺伝子の機能や発現量を減弱させる実験は機能欠失実験と呼ばれる。 また、機能欠失実験によって得られた表現型を機能獲得実験により正常な表現型に回復させる実験を特にrescue実験と呼ぶ


機能獲得実験の手法

遺伝子導入による発現量の増加

　動物個体あるいは細胞に外来遺伝子を導入することで任意の遺伝子発現量を増加させることができる。外来遺伝子を導入した動物個体はトランスジェニック動物と呼ばれ現在ではあらゆる動物種で作製が可能となっている。


導入する遺伝子

　この外来遺伝子は遺伝子発現制御するプロモーター配列の下流に目的の遺伝子、さらにpolyA付加配列という構造をもつものが一般的である（図）。この外来遺伝子を構築する際、どのプロモーター配列を選択するかにより目的遺伝子の発現部位、発現時期、発現量が決まる。


遺伝子導入の方法

現在では遺伝子の導入方法として主に以下の方法が用いられている。

リン酸カルシウム法

　導入する遺伝子 (DNA)とリン酸カルシウムを混和することで形成された不溶性複合体を細胞表面に吸着させ、細胞の食作用などを利用して細胞内に遺伝子を導入する方法。操作が簡便で特殊な装置を必要としない。

リポフェクション法

　正に荷電している脂質からなる脂質二重膜小胞（リポソーム）と負に荷電している遺伝子は電気的に複合体を形成する。これらを負に荷電している細胞膜と融合、あるいは細胞の食作用などにより細胞に取り込まれる。リン酸カルシウム法と同様に特殊な装置を必要とぜず、また各社から試薬が市販されているため培養細胞では広く用いられている。

エレクトロポレーション法

　高電圧パルスを細胞に与えることで細胞膜構造に小孔をあけ、遺伝子を導入する方法。遺伝子導入効率は比較的高い反面、細胞生存率は低い。

パーティクルガン法

　金などの高比重かつ科学的に安定な金属粒子を導入したい遺伝子でコーティングしたものを高圧ガスで射出し細胞内に物理的に導入する方法。ジーンガンとも呼ばれる。

ウイルスベクター法

　目的の遺伝子を組み込んだウイルスを細胞に感染させることで遺伝子を導入する方法。現在では主に、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクターの他、感染した細胞内で逆転写されて細胞ゲノムにに組み込まれるレトロウイルスベクター、レンチウイルスベクターなどが使用されている。

マイクロインジェクション法

　微細なガラス管をを介し細胞に直接遺伝子を導入する方法。個々の細胞に対して操作が必要であるため対象とする細胞数に制限が生じるが、導入効率が高いためトランスジェニック動物作製時においては本法で受精卵に遺伝子を導入するのが一般的である。

機能の増強

1. アミノ酸置換による疑似リン酸化

目的のタンパク質が持つアミノ酸がリン酸化されることでその機能が増強する場合、そのアミノ酸をGlu, またはAspに置換した変異体を発現することで恒常的なリン酸化状態を擬似的に再現できる場合がある。これはリン酸化アミノ酸が水溶液中では負電荷をもつが、Glu, Aspなどの酸性アミノ酸も負電荷をもつためである。

例）MAP kinase kinase (MKK)はSer218およびSer222は上流のRaf1/MAP KKKによりリン酸化されることで活性化する。これらのSer残基をGluに置換したMAPKK変異体は恒常的に活性化する[1]

局在の変化 AKT

  1. ↑ Brunet, A., Pagès, G., & Pouysségur, J. (1994).
    Constitutively active mutants of MAP kinase kinase (MEK1) induce growth factor-relaxation and oncogenicity when expressed in fibroblasts. Oncogene, 9(11), 3379-87. [PubMed:7936666] [WorldCat]
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