「Parkin」の版間の差分

DOI：<selfdoi />　原稿受付日：2020年9月28日　原稿完成日：2020年11月5日<br>

担当編集委員：[http://researchmap.jp/kojiyamanaka 山中 宏二]（名古屋大学 環境医学研究所 病態神経科学）

<br>

{{box|text=　Parkin（パーキン）遺伝子は、常染色体性潜性（劣性）若年性パーキンソニズム(autosomal recessive-juvenile Parkinsonism: AR-JP) の原因遺伝子である。Parkin遺伝子の正式名称はPRKNであり、PARK2とも表記される。遺伝子産物Parkinはユビキチン転移酵素（ユビキチンリガーゼ）であり、損傷したミトコンドリアを排除するミトコンドリアの品質管理に関与すると考えられている。一方、がん抑制遺伝子、らい菌の感受性遺伝子としても報告され、未解明の生理的機能も示唆される。}}

[[ファイル:Imai Parkin Fig1.jpg|サムネイル|'''図1. PINK1-Parkinを介したマイトファジー'''<br>'''①''' 膜電位（∆Ψm）が低下したミトコンドリアは、断片化し切り離される。<br>'''②''' 膜電位低下したミトコンドリア外膜にPINK1が蓄積、キナーゼが活性化する。<br>'''③''' PINK1が活性したミトコンドリアに、Parkinがリクルートされる。'<br>'''④''' 断片化したミトコンドリアは、健常なミトコンドリアと再融合しない。<br>'''⑤''' オートファジーで除去される。Ub, ユビキチン。図は文献<ref name=Imai2012>'''Imai Y. (2012).'''<br>Mitochondrial Regulation by PINK1-Parkin Signaling. ISRN Cell Biol 2012: 926160</ref>より改変。

]]

　[[パーキンソン病]]は[[振戦]]、[[無動]]・[[寡動]]、[[筋固縮]]、[[姿勢保持障害]]などの[[運動機能障害]]を特徴とする[[神経変性疾患]]である。運動症状は[[中脳]][[黒質]]の[[ドーパミン]]神経の選択的変性脱落に起因する。高齢になるほど発病率が増加し、60歳以上では約1%が罹患する。パーキンソン病の一部に、40歳以下で発症する[[若年性パーキンソン病]]と呼ばれる群があり、そのうち[[家族性パーキンソン病|家族性]](遺伝性)のものがいくつかみつかっている。

　1998年、若年性パーキンソン病の一つである常染色体性潜性（劣性）若年性パーキンソニズム(autosomal recessive-juvenile Parkinsonism: AR-JP)の原因遺伝子としてParkin ([[PRKN]], [[PARK2]])が同定された<ref name=Kitada1998><pubmed>9560156</pubmed></ref> 。パーキンソン病原因遺伝子としては、[[αシヌクレイン]]（[[α-Synuclein]]; [[SNCA]]; [[PARK1]]/[[PARK4]])に次いで、２番目に同定された遺伝子である。Parkinは、6番染色体（6q26）にある1.38 Mbの巨大な遺伝子で、[[欠失変異]]、[[フレームシフト変異]]、[[ミスセンス変異]]が、遺伝子全体にわたって見つかっている。Parkin変異は人種を越えてみられ、遺伝性若年性パーキンソン病の約50%を占めると報告されている<ref name=Lucking2000><pubmed>10824074</pubmed></ref><ref name=Hattori2004><pubmed>15325839</pubmed></ref> 。

　Parkinタンパク質は[[基質]]タンパク質に[[ユビキチン]]を転移する[[ユビキチンリガーゼ]]で、多くの病因変異でその活性が損なわれている<ref name=Shimura2000><pubmed>10888878</pubmed></ref><ref name=Imai2000><pubmed>10973942</pubmed></ref><ref name=Zhang2000><pubmed>11078524</pubmed></ref> 。これまでにユビキチン化基質候補として数多くのタンパク質が報告されている<ref name=Zhang2015><pubmed>26793099</pubmed></ref> 。

　2004年、[[PINK1]]([[PTEN induced kinase 1]]; [[PARK6]])が、常染色体性潜性若年性パーキンソン病原因遺伝子として同定された<ref name=Valente2004><pubmed>15087508</pubmed></ref> 。遺伝性若年性パーキンソン病のうち、PINK1変異はParkinに次いで頻度が高く、Parkinと臨床像は類似している<ref name=Kumazawa2008><pubmed>18541801</pubmed></ref> 。[[ショウジョウバエ]]を用いた遺伝学的研究から、常染色体性潜性（劣性）若年性パーキンソン病原因遺伝子PINK1がParkinの上流因子であり、PINK1とParkinが[[ミトコンドリア]]の機能維持に関与することが明らかとなった<ref name=Clark2006><pubmed>16672981</pubmed></ref><ref name=Park2006><pubmed>16672980</pubmed></ref><ref name=Yang2006><pubmed>16818890</pubmed></ref> 。その後、[[ヒト]][[培養細胞]]を用いた研究から、PINK1がParkinをリン酸化し<ref name=Kondapalli2012><pubmed>22724072</pubmed></ref><ref name=Shiba-Fukushima2012><pubmed>23256036</pubmed></ref><ref name=Shiba-Fukushima2014a><pubmed>24901221</pubmed></ref>、協働して膜電位の低下したミトコンドリアを除去する[[マイトファジー]]（ミトコンドリアを対象とする[[オートファジー]]）に関与することが明らかになった（'''図1'''）<ref name=Narendra2008><pubmed>19029340</pubmed></ref><ref name=Narendra2010><pubmed>20126261</pubmed></ref><ref name=Matsuda2010><pubmed>20404107</pubmed></ref><ref name=Geisler2010><pubmed>20098416</pubmed></ref> 。

[[ファイル:Imai Parkin Fig2.jpg|サムネイル|450 px|'''図2. Parkinタンパク質のドメイン構造'''<br>ドメインの説明は本文を参照。REP(Repressor Element of Parkin)の役割は図３を参照。図は文献<ref name=Imai2012 />より改変。]]

[[ファイル:Imai Parkin Fig3.jpg|サムネイル|450 px|'''図3. Parkinの活性化と構造変換'''<br>

'''④''' リン酸化されたUblがParkin本体から遊離するとともに、REPがRING1から外れ、RING2がRING0から遊離する。その結果、RING2の活性中心が露出する。<br>

'''⑤''' リン酸化UblがRING0に結合し、安定的な活性化構造となる。RING1に結合したユビキチン結合酵素（E2）と協働して、基質(S)にユビキチンを転移する。<br>]]

　ヒトParkinタンパク質は465 アミノ酸残基からなり、N末端のユビキチン様ドメイン(Ubl)、C末端に２つの[[RING fingerモチーフ]](RING1, RING2)とIn-Between-RINGs (IBR)という構造をもつ（'''図2'''）。その後、UblとRNIG1-IBR-RING2の間に、RING様構造が見つかり、[[RING0]]（またはUPD; unique parkin domain）と呼ばれる<ref name=Hristova2009><pubmed>19339245</pubmed></ref> （'''図2'''）。Parkinは、RING-IBR-RINGドメインを有するRBR型[[ユビキチンリガーゼ]]に分類され、同様の構造をもヒトユビキチンリガーゼに、[[HOIL-1]], [[HHARI]], [[DORFIN]]がある。タンパク質の全体構造は2013-2015年に解かれ、コンパクトに折り畳まれた状態であることが明らかとなった<ref name=Trempe2013><pubmed>23661642</pubmed></ref><ref name=Wauer2015><pubmed>26161729</pubmed></ref>（'''図3'''）。

　コンパクトに折り畳まれたParkinは、活性中心がマスクされ不活性型である。Parkinの活性化は２つのステップで起こる。１段階目として、PINK1によってSer65が[[リン酸化]]されたユビキチン<ref name=Kane2014><pubmed>24751536</pubmed></ref><ref name=Kazlauskaite2014><pubmed>24660806</pubmed></ref><ref name=Koyano2014><pubmed>24784582</pubmed></ref> がParkinのリン酸基結合ポケットに結合し、ユビキチン様ドメインのリン酸化サイト（Ser65）が露出する。2段階目に、露出したユビキチン様ドメインのSer65がPINK1によりリン酸化され、リン酸化ユビキチン様ドメインがRING0/UPDに結合することで、RING2にある活性中心とRING1にあるユビキチン結合酵素（E2）結合部位が安定的に露出する<ref name=Wauer2015><pubmed>26161729</pubmed></ref>（'''図3'''）。

[[ファイル:Imai Parkin Fig4.jpg|サムネイル|450 px|'''図4. PINK1によるParkinのミトコンドリアへの集積メカニズム'''<br>

'''⑦''' 残りのParkinのリン酸化ポリユビキチン鎖への結合（以降'''④''' 〜'''⑦'''の繰り返し）。<br>

図は文献<ref name=Shiba-Fukushima2014a />)より改変。<br>]]

　ヒトParkin [[mRNA]]はユビキタスに発現しているが、[[筋]]組織、[[腎臓]]、[[脳]]で比較的高発現をしている<ref name=Kitada1998><pubmed>9560156</pubmed></ref><ref name=Uhlen2015><pubmed>25613900</pubmed></ref> 。哺乳類ゲノムにおいて、PRKNはPACRG (Parkin co-regulated gene)と双方向プロモーターを共有する<ref name=West2003><pubmed>12547187</pubmed></ref> 。Parkinの発現を制御する[[転写因子]]として、[[N-myc]] <ref name=West2004><pubmed>15078880</pubmed></ref> , [[p53]] <ref name=Zhang2011><pubmed>21930938</pubmed></ref> , [[ATF4]] <ref name=Bouman2011><pubmed>21113145</pubmed></ref> が報告されている。[[小胞体ストレス]]・[[ミトコンドリアストレス]] <ref name=Imai2000><pubmed>10973942</pubmed></ref><ref name=Bouman2011><pubmed>21113145</pubmed></ref><ref name=Wang2007><pubmed>17465879</pubmed></ref> 、[[成長因子]]・栄養制限 <ref name=Klinkenberg2012><pubmed>22028146</pubmed></ref> などの環境要因でも発現上昇が見られる。

[[ファイル:Imai Parkin Fig5.jpg|サムネイル|450 px|'''図5. PINK1の活性化メカニズム'''<br>

図は文献<ref name=Imai2012 />より引用。]]

　ミトコンドリア局在性キナーゼPINK1は、ミトコンドリア[[膜電位]]依存的に健常なミトコンドリアの内膜まで輸送され、ミトコンドリア内[[プロテアーゼ]][[MPP]]([[mitochondrial processing peptidase]])<ref name=Greene2012><pubmed>22354088</pubmed></ref> とPARL <ref name=Zhou2008><pubmed>18687899</pubmed></ref><ref name=Jin2010><pubmed>21115803</pubmed></ref> によって２段階の切断を受け、その後、細胞質にてユビキチン-[[プロテアソーム]]経路で分解されると考えられている<ref name=Yamano2013><pubmed>24121706</pubmed></ref> 。ミトコンドリア膜電位が低下すると、膜電位依存的な輸送効率が低下し、ミトコンドリア外膜に蓄積、自己会合および自己リン酸化により、[[キナーゼ]]が活性化する<ref name=Okatsu2015><pubmed>25609704</pubmed></ref><ref name=Okatsu2012><pubmed>22910362</pubmed></ref><ref name=Okatsu2013><pubmed>24189060</pubmed></ref> （'''図5'''）。以上から、PINK1は膜電位が低下した（機能低下した）ミトコンドリアを検出するセンサーとして働くと考えられる。

　活性化したPINK1は、近傍の[[ポリユビキチン化]]修飾を受けたタンパク質（主にミトコンドリア外膜のタンパク質）をリン酸化する（リン酸化ポリユビキチン鎖の種の形成）。Parkinはリン酸化ポリユビキチンへの親和性が高く、細胞質からミトコンドリア上のリン酸化ポリユビキチンへ繋留され活性化する。活性化されたParkinは、近傍のミトコンドリアタンパク質をユビキチン化する。さらに、PINK1がParkinによるポリユビキチン鎖をリン酸化し、新たなリン酸化ポリユビキチン鎖をミトコンドリア外膜上に形成する（リン酸化ポリユビキチン鎖の増幅）。増幅されたリン酸化ポリユビキチン鎖に、細胞質に残っている不活性型Parkinが繋留され活性化し、PINK1と協働して、さらにリン酸化ポリユビキチン鎖を形成する（リン酸化ポリユビキチン鎖の再増幅）。PINK1とParkinの役割は、上述のようなフィードフォワードループを形成して、不良ミトコンドリアをリン酸化ポリユビキチン鎖にて速やかにマーキングすることだと考えられる（'''図4'''）<ref name=Ordureau2014><pubmed>25284222</pubmed></ref><ref name=Shiba-Fukushima2014b><pubmed>25474007</pubmed></ref> 。

　マイトファジー時のParkinのユビキチン化基質は数多く報告され、ミトコンドリア外膜・内膜・マトリクスタンパク質のほか、細胞質や核のタンパク質も含まれる<ref name=Sarraf2013><pubmed>23503661</pubmed></ref> 。そのうち、[[Dynamin-like GTPase]], [[Mitofusi]]n（哺乳類では[[Mitofusin 1]]と[[Mitofusin 2]]がある）は、Parkinによって早期にユビキチン化とその後のプロテアソーム経路での分解を受けるミトコンドリア外膜分子として知られる。Mitofusinの分解により、ミトコンドリアが断片化する<ref name=Gegg2010><pubmed>20871098</pubmed></ref><ref name=Poole2010><pubmed>20383334</pubmed></ref><ref name=Rakovic2011><pubmed>21408142</pubmed></ref><ref name=Tanaka2010><pubmed>21173115</pubmed></ref><ref name=Ziviani2010><pubmed>20194754</pubmed></ref> 。ミトコンドリアの断片化は、[[隔離膜]]形成とオートファジーによる除去を容易にすると考えられる<ref name=Tanaka2010><pubmed>21173115</pubmed></ref> 。実際、ミトコンドリア断片化に働くDynamin-like GTPase, [[Drp1]]の過剰発現は、ParkinやPINK1ノックアウトハエのミトコンドリア変性を緩和する<ref name=Deng2008><pubmed>18799731</pubmed></ref><ref name=Yang2008><pubmed>18443288</pubmed></ref> 。このDrp1の効果は、Parkin非介在マイトファジーによる補完を促進するからと考えられる。

 

　ミトコンドリア外膜[[Rho-GTPase]], [[Miro]] (哺乳類では[[Miro 1]]と[[Miro 2]]がある）は、[[キネシン]]タンパク質[[KIF5]]と協働して、[[微小管]]を介したミトコンドリアの順行輸送に関与する<ref name=Wang2011><pubmed>22078885</pubmed></ref><ref name=Liu2012><pubmed>22396657</pubmed></ref> 。神経細胞においては、[[神経軸索]]、[[前シナプス]]へのミトコンドリア供給機構として重要である。MiroがPINK1-Parkinによりユビキチン化、プロテアソーム経路での分解を受けることにより、ミトコンドリア輸送が停止する<ref name=Wang2011><pubmed>22078885</pubmed></ref><ref name=Liu2012><pubmed>22396657</pubmed></ref> 。その生理的意義として、不良ミトコンドリアを神経終末へ輸送しないミトコンドリア品質管理と考えられる（'''図6'''）。

　Parkinは[[PACRG]] ([[Parkin co-regulated gene]])とともに[[wj:サルモネラ菌|サルモネラ菌]]、[[wj:らい菌|らい菌]]感染の感受性遺伝子座に位置する<ref name=Mira2004><pubmed>14737177</pubmed></ref><ref name=Ali2006><pubmed>16734611</pubmed></ref> 。実験的にParkinが[[wj:結核菌|結核菌]]の[[ゼノファジー]]（異物排除のためのオートファジー）に関与することが示されたが、Parkinが活性化するメカニズムは不明である<ref name=Manzanillo2013><pubmed>24005326</pubmed></ref> 。

　常染色体性潜性若年性パーキンソニズム脳[[アストロサイト]]の形態的異常や患者[[iPS細胞]]で作製した中脳[[オルガノイド]]でのアストロサイトの分化能低下<ref name=Kano2020><pubmed>33298969</pubmed></ref> 、Parkinノックアウトマウスにおいてアストロサイトのミトコンドリア損傷の報告<ref name=Schmidt2011><pubmed>21212098</pubmed></ref> がある。

　免疫・炎症へのParkinの関与が示唆されている。PINK1とParkinは、ミトコンドリアの[[抗原提示経路]]に関わる分子[[Sorting nexin-9]]を分解し、[[T細胞]]への抗原提示を阻害する。Parkinのこの機能が過剰な免疫反応を抑制している可能性が報告された<ref name=Matheoud2016><pubmed>27345367</pubmed></ref> . PINK1, Parkinノックアウトマウスでは、ミトコンドリアへの強い負荷（激しい運動やミトコンドリアDNAへの構成的な変異の蓄積）により、[[STING経路]]を介した炎症性[[サイトカイン]]の上昇がみられる <ref name=Sliter2018><pubmed>30135585</pubmed></ref> 。STINGは血清中に遊離した損傷ミトコンドリアのDNAを認識し、自然免疫を活性化する。ミトコンドリアストレスで生した損傷ミトコンドリアのPINK1-Parkin経路を介したマイトファジーでの除去が、炎症の沈静化に寄与していることが示唆されている。

　PRKNミスセンス病因変異・レアバリアントとタンパク質の安定性・マイトファジーとの相関を培養細胞で調べた研究がある<ref name=Yi2019><pubmed>30994895</pubmed></ref> 。病態が比較的重篤なミスセンス病因変異は、すべてマイトファジー活性が50%以下(対野生型比）に低下していた。しかし、病態が軽度・病態への意義が不明なミスセンス病因変異・レアバリアントでは、マイトファジーへの影響がほとんどなく、まれに亢進しているものも観察された。ユビキチンリガーゼ活性やタンパク質の安定性に影響しない病因変異については、不活性状態を解く[[アミノ酸]]への置換（REPを不安定化させるF146AやW403A、'''図3'''参照）の導入により、マイトファジー活性が戻ることが示された。この観察は、Parkinの不活性状態を解く化合物がパーキンソン病の疾患修飾薬となる可能性を示唆している。

　Parkin変異によるパーキンソン病の典型的な臨床像として、40歳未満での発症、緩慢な病態進行、正常な[[認知機能]]、下肢[[ジストニア]]、良好な[[L-ドーパ]]への反応性、が挙げられる <ref name=久保紳一郎、波田野琢、服部信孝2013>'''久保紳一郎、波田野琢、服部信孝. 2013.'''<br>常染色体劣性パーキンソン病  In ''パーキンソン病と運動症状'', ed. 高橋良輔, pp. 400-06: 中山書店</ref> 。神経病理学的特徴として、[[黒質]]および[[青斑核]]に限局した神経細胞減少を示し、[[グリオーシス]]は通常見られない。孤発性パーキンソン病の特徴的病理所見である[[レビー小体]]は通常みられない<ref name=久保紳一郎、波田野琢、服部信孝2013></ref> 。10歳未満での発症の報告もあり、Parkinはドーパミン神経発生の段階で機能していることが推察される<ref name=Matsumine1997><pubmed>9042918</pubmed></ref><ref name=Takei2000><pubmed>11086400</pubmed></ref> 。

その他、[[がん抑制遺伝子]]として、いくつか報告がある<ref name=Denison2003><pubmed>12874785</pubmed></ref><ref name=Cesari2003><pubmed>12719539</pubmed></ref><ref name=Fujiwara2008><pubmed>18574468</pubmed></ref><ref name=Veeriah2010><pubmed>19946270</pubmed></ref><ref name=Gong2014><pubmed>24793136</pubmed></ref> 。