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== Aキナーゼアンカータンパク質とは == | == Aキナーゼアンカータンパク質とは == | ||
[[ファイル:Hoshi AKAP Fig1.png|サムネイル|'''図1. AKAPの細胞内局在'''<br>様々な細胞内小器官に局在する<ref name=Omar2020><pubmed>33082006</pubmed></ref>]] | [[ファイル:Hoshi AKAP Fig1.png|サムネイル|'''図1. AKAPの細胞内局在'''<br>様々な細胞内小器官に局在する<ref name=Omar2020><pubmed>33082006</pubmed></ref>]] | ||
初めて[[Aキナーゼ制御サブユニット]]に結合するタンパク質が記載されたのは、1984年である。Charles S. Rubinは、後に[[AKAP75]]として知られることになるタンパク質を、[[カルモジュリン]]、[[Aキナーゼ制御サブユニットII]]とともに分離し、報告した<ref name=Sarkar1984><pubmed>6086653</pubmed></ref>。その後、[[John D. Scott]]を含め多くのグループが精力的にさまざまなAキナーゼ結合タンパク質(AKAP)があることを示した。このタンパク質が単にAキナーゼに結合するだけでなく、さまざまな[[酵素]]、[[細胞骨格]]、[[細胞小器官]]の局在タンパク質とも結合することを見出し、細胞内シグナルの区画化(compartmentalization)に深く関わっていることを明らかにした('''図1''')。 | |||
==サブタイプ== | ==サブタイプ== | ||
AKAPのタンパク質名は古典的なタンパク質精製時の命名法から、[[SDS-PAGE]]上の分子量を使ったので、同じタンパク質でも種によってAKAP番号が異なることがあるので混乱を招きやすい。一方、遺伝子名は[[AKAP1]]、[[AKAP2]]などとなっているので、最近は、その明快さから遺伝子名をタンパク質名として使っている例も見受けられる。[例)遺伝子名:[[AKAP5]]、タンパク質名:[[AKAP75]]([[ウシ]])、[[AKAP79]]([[ヒト]])、[[AKAP150]]([[齧歯類]])] | |||
PKA結合タンパク質をAKAPと定義すると、AKAP | PKA結合タンパク質をAKAPと定義すると、AKAP を呼ばれるタンパク以外にも、例えば[[神経細胞]]に多く発現している[[MAP2]]もAKAPとして機能することが知られており、どこまでをAKAPと呼ぶか研究者により違いが見られる。そのため、この項では遺伝子名にAKAPとつけられた13種を'''表'''に示し要約する。より網羅的な一覧は文献<ref name=Omar2020><pubmed>33082006</pubmed></ref>を参照のこと。 | ||
[[ファイル:Hoshi AKAP Fig2.png|サムネイル|'''図2. AKAPの基本構造と、PKAの結合様式''']] | [[ファイル:Hoshi AKAP Fig2.png|サムネイル|'''図2. AKAPの基本構造と、PKAの結合様式''']] | ||
== 構造 == | == 構造 == | ||
AKAPは共通した起源タンパク質を持たないにも関わらず、1)Aキナーゼ結合部位、2)細胞局在部位、3)その他のシグナル酵素結合部位、4)制御対象タンパク質結合部位のモジュールから構成されるという特徴を共有する('''図2''')。細胞膜に局在するAKAP | AKAPは共通した起源タンパク質を持たないにも関わらず、1)Aキナーゼ結合部位、2)細胞局在部位、3)その他のシグナル酵素結合部位、4)制御対象タンパク質結合部位のモジュールから構成されるという特徴を共有する('''図2''')。細胞膜に局在するAKAP は、[[cAMP]]を生成する[[アデニル酸シクラーゼ]]と結合するものや(AKAP5, AKAP9)、cAMPを分解する[[ホスホジエステラーゼ]]を保持するもの(AKAP2, [[AKAP6|6]], [[AKAP9|9]], [[AKAP12|12]])があり、cAMPの拡散を制限し局所的上昇の機序を担うと考えられている<ref name=Dessauer2009><pubmed>19684092</pubmed></ref><ref name=Omar2020><pubmed>33082006</pubmed></ref><ref name=Tasken2004><pubmed>14715913</pubmed></ref>。また、多くのAKAPはキナーゼとともに[[ホスファターゼ]]を保持することが多く、対象タンパクの[[リン酸化]]、[[脱リン酸化]]を最適に調整して言えると考えられている。注意しなければならないのは、同定された結合酵素が全て同時に結合しているとは限らないこと、刺激によって異なる細胞部位を行き来することがあるなど、AKAPタンパク複合体がダイナミックに変化することである。 | ||
AKAPは各サブタイプ共通して、比較的相同性を持つ短い[[αヘリックス]]を介してAキナーゼの制御サブユニットの2量体領域(dimerization domain)と結合する<ref name=Falcone2025><pubmed>40199400</pubmed></ref><ref name=Gold2006><pubmed>17081989</pubmed></ref>('''図2''')。Aキナーゼの制御サブユニットには[[RI]], [[RII]]の二種類があり、RIは細胞質にあって、細胞全体のAキナーゼ反応を担い、RIIは細胞小器官に局在し局所的なAキナーゼ反応を担う<ref name=Taylor2005><pubmed>16214430</pubmed></ref>。RIIの細胞小器官局在はAKAPによる。実際AKAPの多くはRII特異的に結合することが知られている<ref name=Omar2020><pubmed>33082006</pubmed></ref>。AKAPのPKA結合部位は比較的保存され、RI サブユニット特異性、もしくはRII サブユニット特異性のあるAKAPのサブグループ間ではAキナーゼの結合部位は比較的保存されている<ref name=Alto2003><pubmed>12672969</pubmed></ref><ref name=Falcone2025><pubmed>40199400</pubmed></ref><ref name=Wang2015><pubmed>25765284</pubmed></ref>。それらのAキナーゼ結合部位は、Aキナーゼの制御サブユニットの2量体領域を横断するように結合する<ref name=Falcone2025><pubmed>40199400</pubmed></ref><ref name=Gold2006><pubmed>17081989</pubmed></ref>('''図2''')。この保存されたαヘリックスのアミノ酸配列を利用し、それぞれ、AKAP結合競合ペプチドが開発された(RIにはRI-STAD <ref name=Wang2015><pubmed>25765284</pubmed></ref>、RIIにはAKAP-IS <ref name=Alto2003><pubmed>12672969</pubmed></ref>)。これらの競合ペプチドは、研究対象の細胞応答にAKAPが関与しているか、などの確認などに利用されている。 | |||
[[ファイル:Hoshi AKAP Fig3.png|サムネイル|'''図3. AKAPの細胞内局在'''<br>AKAP79/150タンパクの構造、チャンネル複合体例とその機能<br>枠は対象チャンネルへの主要作用酵素を示す。PKC: タンパク質キナーゼC、PKA: A-キナーゼ、PP2B: カルシニューリン。文献<ref name=Hall2007><pubmed>17279627</pubmed></ref><ref name=Hoshi2003><pubmed>12754513</pubmed></ref><ref name=Sanderson2012><pubmed>23100425</pubmed></ref>より作成]] | [[ファイル:Hoshi AKAP Fig3.png|サムネイル|'''図3. AKAPの細胞内局在'''<br>AKAP79/150タンパクの構造、チャンネル複合体例とその機能<br>枠は対象チャンネルへの主要作用酵素を示す。PKC: タンパク質キナーゼC、PKA: A-キナーゼ、PP2B: カルシニューリン。文献<ref name=Hall2007><pubmed>17279627</pubmed></ref><ref name=Hoshi2003><pubmed>12754513</pubmed></ref><ref name=Sanderson2012><pubmed>23100425</pubmed></ref>より作成]] | ||
==機能== | ==機能== | ||
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|+表. AKAPの一覧 | |+表. AKAPの一覧 | ||
! 遺伝子名 !! タンパク質名 !! | ! 遺伝子名 !! タンパク質名 !! 係留タンパク質・酵素<ref name=Bucko2021><pubmed>32628872</pubmed></ref> !! 特徴 !! 関連した疾患 | ||
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! AKAP1 | ! [[AKAP1]] | ||
| D-AKAP1 など || PP1, PP2B, RSK1, src etc. || | | [[D-AKAP1]] など || [[PP1]], [[PP2B]], [[RSK1]], [[src]] etc. || [[ミトコンドリア]]機能<ref name=Merrill2014><pubmed>24412345</pubmed></ref> || [[緑内障]] <ref name=Edwards2020><pubmed>32312949</pubmed></ref>、[[乳がん]] <ref name=Bucko2021><pubmed>32628872</pubmed></ref> | ||
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! AKAP2 | ! [[AKAP2]] | ||
| AKAP-KL など || mypT1, AQP0, etc. || | | [[AKAP-KL]] など || [[mypT1]], [[AQP0]], etc. || 細胞骨格、[[形質膜]] || | ||
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! AKAP3 | ! [[AKAP3]] | ||
| AKAP110 など || PDE4A, Gα13, etc. || || | | [[AKAP110]] など || [[PDE4A]], [[Gα13]], etc. || || | ||
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! AKAP4 | ! [[AKAP4]] | ||
| AKAP4 など || ERK1/2, RhoA, etc || || | | AKAP4 など || [[ERK1]]/[[ERK2|2]], [[RhoA]], etc || || | ||
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! AKAP5 | ! [[AKAP5]] | ||
| AKAP75/79/150 など || AC, PKC, CaM, PP2B, PDZ proteins, Cav1.2, Kv7.2 TRPV1/4, etc || | | AKAP75/79/150 など || [[AC]], [[PKC]], [[CaM]], [[PP2B]], [[PDZ proteins]], [[Cav1.2]], [[Kv7.2]], [[TRPV1]]/[[TRPV4|4]], etc || [[形質膜]]、[[長期抑制現象]] ([[LTD]])、[[M電流抑制]] || [[総合失調症]]、[[糖尿病]]<ref name=Bucko2021><pubmed>32628872</pubmed></ref> | ||
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! AKAP6 | ! [[AKAP6]] | ||
| mAKAP など || PKC, MEK5, ERK5, RSK3, PDE4D3 etc || | | [[mAKAP]]など || PKC, [[MEK5]], [[ERK5]], [[RSK3]], [[PDE4D3]] etc || [[心筋]]([[筋小胞体]]) || [[不整脈]] <ref name=Suryavanshi2018><pubmed>29370121</pubmed></ref>、[[心筋症]]<ref name=Bucko2021><pubmed>32628872</pubmed></ref> | ||
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! AKAP7 | ! [[AKAP7]] | ||
| AKAP15/18 など || Cav, AQP2 etc || | | [[AKAP15]]/[[AKAP18|18]] など || [[Cav]], [[AQP2]] etc || 心筋([[形質膜]]) || [[不整脈]] <ref name=Suryavanshi2018><pubmed>29370121</pubmed></ref>、[[熱性痙攣]]<ref name=Bucko2021><pubmed>32628872</pubmed></ref> | ||
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! AKAP8 | ! [[AKAP8]] | ||
| AKAP95 など || AMY-1, CASP3, RSK1 etc. || 核 || | | [[AKAP95]]など || [[AMY-1]], [[CASP3]], [[RSK1]] etc. || [[核]]|| | ||
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! AKAP9 | ! [[AKAP9]] | ||
| Yotiao/AKAP450 など || AC, PDE4D3, PKC, PP2A, tubulin, CK1, CaM, cyclin E, cdk2, Kv7.1 etc. || | | [[Yotiao]]/[[AKAP450]] など || AC, PDE4D3, PKC, [[PP2A]], [[tubulin]], [[CK1]], CaM, [[cyclin E]], [[cdk2]], [[Kv7.1]] etc. || [[スプライシング]]バリアントによって細胞局在が異なる || [[QT延長症候群]] <ref name=Bucko2021><pubmed>32628872</pubmed></ref> | ||
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! AKAP10 | ! [[AKAP10]] | ||
| D-AKAP2 など || Rab4, Rab11 || || 不整脈 <ref name=Suryavanshi2018><pubmed>29370121</pubmed></ref> | | [[D-AKAP2]]など || [[Rab4]], [[Rab11]] || || [[不整脈]] <ref name=Suryavanshi2018><pubmed>29370121</pubmed></ref> | ||
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! AKAP11 | ! [[AKAP11]] | ||
| AKAP220 など || PP1, | | [[AKAP220]]など || PP1, [[GSK3β]], [[IQGAP]], [[アクチン]]など || || [[尿崩症]]<ref name=Bucko2021><pubmed>32628872</pubmed></ref> | ||
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! AKAP12 | ! [[AKAP12]] | ||
| Gravin/AKAP250 など || CaM, PDE4D, PKC etc. || || | | [[Gravin]]/[[AKAP250]]など || CaM, PDE4D, PKC etc. || || [[腎不全]]、[[前立腺癌]]、[[重症筋無力症]]<ref name=Bucko2021><pubmed>32628872</pubmed></ref> | ||
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! AKAP13 | ! [[AKAP13]] | ||
| AKAP-lbc/HT31 など || RhoA, Gα12, MLTK || 細胞骨格 || 高血圧 <ref name=Suryavanshi2018><pubmed>29370121</pubmed></ref> | | [[AKAP-lbc]]/[[HT31]] など || RhoA, [[Gα12]], [[MLTK]] || 細胞骨格 || [[高血圧]] <ref name=Suryavanshi2018><pubmed>29370121</pubmed></ref> | ||
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遺伝子名にAKAPと名前がついているものに限り、その他にも同様な機能を持つタンパク質は存在する。<br> | 遺伝子名にAKAPと名前がついているものに限り、その他にも同様な機能を持つタンパク質は存在する。<br> | ||