「POU転写因子」の版間の差分
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POUドメインは、保存されていない15－56アミノ酸からなるリンカー配列によって２つのサブドメインに分かれており、N末側の75アミノ酸からなるドメインはPOU特異的ドメイン（POU<sub>S</sub>: POU specific domain）、C末側の60アミノ酸からなるドメインは、ホメオドメインタンパク質スーパーファミリーに共通したDNA結合部位であるホメオドメインと相同性が高く、POUホメオドメイン（POU<sub>H</sub>: POU homeodomain）と名付けられている<ref name="b"><pubmed>7622033</pubmed></ref>。両方のサブドメイン共DNA結合モチーフの一種であるhelix-turn-helix構造をとり、オクタマー配列と呼ばれるDNA配列ATGCAAATに特異的に結合する<ref name="b" />。また、親和性は低いが、それぞれのドメイン単独でDNAに結合することが可能であり、POU<sub>S</sub>は5’側のATGC、POU<sub>H</sub>は3’側のA/Tリッチな配列を認識する<ref><pubmed>8156594</pubmed></ref>。さらに、POUドメインは標的遺伝子の転写調節において結合配列上でのホモ二量体やあるいは他ファミリーメンバーとのヘテロ二量体形成や共役する他因子との結合に必要とされる場合がある<ref><pubmed>9105675</pubmed></ref><ref name="e"><pubmed>11183772</pubmed></ref>。リンカー配列は、２つのドメインの局所的濃度を高め二量体形成やDNA結合能を高めるだけでなく、その長さの違いが両ドメインの相対的な空間配置の自由度の違いを生出し、実際の認識配列の多様性を決定しているようである<ref name="e" /><ref><pubmed>12213595</pubmed></ref>。 | |||
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POU転写因子は、それぞれのPOUドメインにおけるアミノ酸配列の相同性に基づいてⅠ～Ⅵの６つのクラスに分類される。例として以下にヒトの遺伝子ホモログを列記する。 | POU転写因子は、それぞれのPOUドメインにおけるアミノ酸配列の相同性に基づいてⅠ～Ⅵの６つのクラスに分類される。例として以下にヒトの遺伝子ホモログを列記する。 | ||
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POU転写因子ファミリーの様々なメンバーの生物学的機能は多岐にわたるが、その多くが個体発生における細胞増殖・分化・移動・生存等や神経内分泌を含めた内分泌系において、そこで必要とされる機能遺伝子の発現制御を行っている<ref><pubmed>9171367</pubmed></ref><ref name="h"><pubmed>11159814</pubmed></ref>。なお、標的遺伝子の発現制御においては、共役因子の違いや発現制御領域の構造によって転写活性化因子としても抑制因子としても働きうる<ref name="h" />。<br><br> | POU転写因子ファミリーの様々なメンバーの生物学的機能は多岐にわたるが、その多くが個体発生における細胞増殖・分化・移動・生存等や神経内分泌を含めた内分泌系において、そこで必要とされる機能遺伝子の発現制御を行っている<ref><pubmed>9171367</pubmed></ref><ref name="h"><pubmed>11159814</pubmed></ref>。なお、標的遺伝子の発現制御においては、共役因子の違いや発現制御領域の構造によって転写活性化因子としても抑制因子としても働きうる<ref name="h" />。<br><br> | ||
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2012年3月21日 (水) 16:34時点における版
英語名：POU transcription factors
ホメオドメインタンパク質スーパーファミリーのうち、POUドメインと呼ばれる、線虫からヒトに至るまで動物界で進化上高度に保存されたDNA結合モチーフを持った転写因子ファミリータンパク質の総称。POUは、いずれも1988年にその遺伝子クローニングが発表された最初のファミリーメンバーである、哺乳類のPit-1、Oct1およびOct-2と線虫のunc86遺伝子産物の頭文字を取って命名された[1]。
構造
| Pou domain - N-terminal to homeobox domain | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifiers | |||||||||
| Symbol | Pou | ||||||||
| Pfam | PF00157 | ||||||||
| InterPro | IPR000327 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00035 | ||||||||
| SCOP | 1oct | ||||||||
| SUPERFAMILY | 1oct | ||||||||
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POUドメインは、保存されていない15－56アミノ酸からなるリンカー配列によって２つのサブドメインに分かれており、N末側の75アミノ酸からなるドメインはPOU特異的ドメイン（POUS: POU specific domain）、C末側の60アミノ酸からなるドメインは、ホメオドメインタンパク質スーパーファミリーに共通したDNA結合部位であるホメオドメインと相同性が高く、POUホメオドメイン（POUH: POU homeodomain）と名付けられている[2]。両方のサブドメイン共DNA結合モチーフの一種であるhelix-turn-helix構造をとり、オクタマー配列と呼ばれるDNA配列ATGCAAATに特異的に結合する[2]。また、親和性は低いが、それぞれのドメイン単独でDNAに結合することが可能であり、POUSは5’側のATGC、POUHは3’側のA/Tリッチな配列を認識する[3]。さらに、POUドメインは標的遺伝子の転写調節において結合配列上でのホモ二量体やあるいは他ファミリーメンバーとのヘテロ二量体形成や共役する他因子との結合に必要とされる場合がある[4][5]。リンカー配列は、２つのドメインの局所的濃度を高め二量体形成やDNA結合能を高めるだけでなく、その長さの違いが両ドメインの相対的な空間配置の自由度の違いを生出し、実際の認識配列の多様性を決定しているようである[5][6]。
ファミリーメンバー
POU転写因子は、それぞれのPOUドメインにおけるアミノ酸配列の相同性に基づいてⅠ～Ⅵの６つのクラスに分類される。例として以下にヒトの遺伝子ホモログを列記する。
Class
Ⅰ POU1F1;
Ⅱ POU2F1; POU2F2; POU2F3;
Ⅲ POU3F1; POU3F2; POU3F3; POU3F4;
Ⅳ POU4F1; POU4F2; POU4F3;
Ⅴ POU5F1; POU5F1P1; POU5F1P3; POU5F1P4; POU5F2;
Ⅵ POU6F2
機能
POU転写因子ファミリーの様々なメンバーの生物学的機能は多岐にわたるが、その多くが個体発生における細胞増殖・分化・移動・生存等や神経内分泌を含めた内分泌系において、そこで必要とされる機能遺伝子の発現制御を行っている[7][8]。なお、標的遺伝子の発現制御においては、共役因子の違いや発現制御領域の構造によって転写活性化因子としても抑制因子としても働きうる[8]。
参考文献
- ↑
Herr, W., Sturm, R.A., Clerc, R.G., Corcoran, L.M., Baltimore, D., Sharp, P.A., ..., & Ruvkun, G. (1988).
The POU domain: a large conserved region in the mammalian pit-1, oct-1, oct-2, and Caenorhabditis elegans unc-86 gene products. Genes & development, 2(12A), 1513-6. [PubMed:3215510] [WorldCat] [DOI] - ↑ 2.0 2.1
Herr, W., & Cleary, M.A. (1995).
The POU domain: versatility in transcriptional regulation by a flexible two-in-one DNA-binding domain. Genes & development, 9(14), 1679-93. [PubMed:7622033] [WorldCat] [DOI] - ↑
Klemm, J.D., Rould, M.A., Aurora, R., Herr, W., & Pabo, C.O. (1994).
Crystal structure of the Oct-1 POU domain bound to an octamer site: DNA recognition with tethered DNA-binding modules. Cell, 77(1), 21-32. [PubMed:8156594] [WorldCat] [DOI] - ↑
Malik, K.F., Jaffe, H., Brady, J., & Young, W.S. (1997).
The class III POU factor Brn-4 interacts with other class III POU factors and the heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U. Brain research. Molecular brain research, 45(1), 99-107. [PubMed:9105675] [WorldCat] [DOI] - ↑ 5.0 5.1
Phillips, K., & Luisi, B. (2000).
The virtuoso of versatility: POU proteins that flex to fit. Journal of molecular biology, 302(5), 1023-39. [PubMed:11183772] [WorldCat] [DOI] - ↑
Reményi, A., Tomilin, A., Schöler, H.R., & Wilmanns, M. (2002).
Differential activity by DNA-induced quarternary structures of POU transcription factors. Biochemical pharmacology, 64(5-6), 979-84. [PubMed:12213595] [WorldCat] [DOI] - ↑
Ryan, A.K., & Rosenfeld, M.G. (1997).
POU domain family values: flexibility, partnerships, and developmental codes. Genes & development, 11(10), 1207-25. [PubMed:9171367] [WorldCat] [DOI] - ↑ 8.0 8.1
Andersen, B., & Rosenfeld, M.G. (2001).
POU domain factors in the neuroendocrine system: lessons from developmental biology provide insights into human disease. Endocrine reviews, 22(1), 2-35. [PubMed:11159814] [WorldCat] [DOI]