「ヒストン脱メチル化酵素」の版間の差分

編集の要約なし
17行目: 17行目:
===JmjCドメイン含有タンパク質ファミリー===
===JmjCドメイン含有タンパク質ファミリー===
 JmjC domain-containing protein familyは共通してJmjCドメインを持つが、各々が保持する他のドメインや構造から、さらにいくつかのサブファミリーに分類される<ref name=Klose2006><pubmed>16983801</pubmed></ref>(ref 9)。酵素活性を持たない、もしくは報告されていないものが存在するが、ここでは酵素活性を持つものについて、各サブファミリーの構造<ref name=Klose2006><pubmed>16983801</pubmed></ref>(ref 9)や各酵素が標的とするヒストン修飾を表にまとめた。
 JmjC domain-containing protein familyは共通してJmjCドメインを持つが、各々が保持する他のドメインや構造から、さらにいくつかのサブファミリーに分類される<ref name=Klose2006><pubmed>16983801</pubmed></ref>(ref 9)。酵素活性を持たない、もしくは報告されていないものが存在するが、ここでは酵素活性を持つものについて、各サブファミリーの構造<ref name=Klose2006><pubmed>16983801</pubmed></ref>(ref 9)や各酵素が標的とするヒストン修飾を表にまとめた。
{| class="wikitable"
!  !! 遺伝子名 !! 標的 !! 遺伝子発現の組織特異性(ref 10) !! 構造 (ref 8, 9)
|-
| "Lysine specific demethylase ||  ||  ||  ||
|-
| (LSD) family" ||  LSD1 (KDM1A) || H3K4/K9me1, me2 || 低 (多くの組織で発現している) || 
|-
|  || LSD2 (KDM1B) || "H3K4me1, me2 ||  ||
|-
| H3K9me1, me2 " || 低 (多くの組織で発現している) ||  ||  ||
|-
| "Jumonji (JmjC) domain ||  ||  ||  ||
|-
| -containing protein family" || FBXL11 (KDM2A) || H3K36me2 || 低 (多くの組織で発現している) || 
|-
|  || FBXL10 (KDM2B) || "H3K36me1, me2 ||  ||
|-
| H3K4me3" || 低 (多くの組織で発現している) ||  ||  ||
|-
|  || JMJD1A (KDM3A) || H3K9me1, me2 || 低 (多くの組織で発現している) || 
|-
|  || JMJD1B (KDM3B) || H3K9me2 || 低 (多くの組織で発現している) || 
|-
|  || HR || H3K9me2,me1 || 食道、皮膚で高発現している || 
|-
|  || JMJD2A (KDM4A) || "H3K9/K36me3、 ||  ||
|-
| H1.4K26me3" || 低 (多くの組織で発現している) ||  ||  ||
|-
|  || JMJD2B (KDM4B) || "H3K9/K36 me3 ||  ||
|-
| H1.4K26me3" || 低 (多くの組織で発現している) ||  ||  ||
|-
|  || JMJD2C (KDM4C) || "H3K9/K36me3 ||  ||
|-
| H1.4K26me3" || 低 (多くの組織で発現している) ||  ||  ||
|-
|  || JMJD2D (KDM4D) || "H3K9me2, me3 ||  ||
|-
| H1.4K26me2,me3" || 精巣で高発現している ||  ||  ||
|}


==組織分布 ==
==組織分布 ==
22行目: 64行目:
JmjN: Jumonji N domain; PHD: plant homeobox domain; TPR: tetracopeptide repeat domain;  
JmjN: Jumonji N domain; PHD: plant homeobox domain; TPR: tetracopeptide repeat domain;  
ZF-like: zinc-finger-like domain.
ZF-like: zinc-finger-like domain.
== 機能 ==
== 機能 ==
===LSDファミリー===
===LSDファミリー===