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「ヒストン脱メチル化酵素」の版間の差分
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→組織分布
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===JmjCドメイン含有タンパク質ファミリー=== | ===JmjCドメイン含有タンパク質ファミリー=== | ||
JmjC domain-containing protein familyは共通してJmjCドメインを持つが、各々が保持する他のドメインや構造から、さらにいくつかのサブファミリーに分類される<ref name=Klose2006><pubmed>16983801</pubmed></ref>（ref 9）。酵素活性を持たない、もしくは報告されていないものが存在するが、ここでは酵素活性を持つものについて、各サブファミリーの構造<ref name=Klose2006><pubmed>16983801</pubmed></ref>（ref 9）や各酵素が標的とするヒストン修飾を表にまとめた。 | JmjC domain-containing protein familyは共通してJmjCドメインを持つが、各々が保持する他のドメインや構造から、さらにいくつかのサブファミリーに分類される<ref name=Klose2006><pubmed>16983801</pubmed></ref>（ref 9）。酵素活性を持たない、もしくは報告されていないものが存在するが、ここでは酵素活性を持つものについて、各サブファミリーの構造<ref name=Klose2006><pubmed>16983801</pubmed></ref>（ref 9）や各酵素が標的とするヒストン修飾を表にまとめた。 | ||
{| class="wikitable" | |||
! !! 遺伝子名 !! 標的 !! 遺伝子発現の組織特異性（ref 10） !! 構造 （ref 8, 9） | |||
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| "Lysine specific demethylase || || || || | |||
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| (LSD) family" || LSD1 (KDM1A) || H3K4/K9me1, me2 || 低 (多くの組織で発現している) || | |||
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| || LSD2 (KDM1B) || "H3K4me1, me2 || || | |||
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| H3K9me1, me2 " || 低 (多くの組織で発現している) || || || | |||
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| "Jumonji (JmjC) domain || || || || | |||
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| -containing protein family" || FBXL11 (KDM2A) || H3K36me2 || 低 (多くの組織で発現している) || | |||
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| || FBXL10 (KDM2B) || "H3K36me1, me2 || || | |||
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| H3K4me3" || 低 (多くの組織で発現している) || || || | |||
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| || JMJD1A (KDM3A) || H3K9me1, me2 || 低 (多くの組織で発現している) || | |||
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| || JMJD1B (KDM3B) || H3K9me2 || 低 (多くの組織で発現している) || | |||
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| || HR || H3K9me2,me1 || 食道、皮膚で高発現している || | |||
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| || JMJD2A (KDM4A) || "H3K9/K36me3、 || || | |||
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| H1.4K26me3" || 低 (多くの組織で発現している) || || || | |||
|- | |||
| || JMJD2B (KDM4B) || "H3K9/K36 me3 || || | |||
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| H1.4K26me3" || 低 (多くの組織で発現している) || || || | |||
|- | |||
| || JMJD2C (KDM4C) || "H3K9/K36me3 || || | |||
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| H1.4K26me3" || 低 (多くの組織で発現している) || || || | |||
|- | |||
| || JMJD2D (KDM4D) || "H3K9me2, me3 || || | |||
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| H1.4K26me2,me3" || 精巣で高発現している || || || | |||
|} | |||
==組織分布 == | ==組織分布 == | ||
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JmjN: Jumonji N domain; PHD: plant homeobox domain; TPR: tetracopeptide repeat domain; | JmjN: Jumonji N domain; PHD: plant homeobox domain; TPR: tetracopeptide repeat domain; | ||
ZF-like: zinc-finger-like domain. | ZF-like: zinc-finger-like domain. | ||
== 機能 == | == 機能 == | ||
===LSDファミリー=== | ===LSDファミリー=== | ||