「Gastrulation brain homeoboxファミリー」の版間の差分
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! 対称性 !! 大グループ !! 門 !! 遺伝子 !! 種名（一般名と学名） !! 出典 | ! 対称性 !! 大グループ !! 門 !! 遺伝子 !! 種名（一般名と学名） !! 出典 | ||
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| 放射相称動物 || | | 放射相称動物 || || 刺胞動物 || ''Gbx'' || イソギンチャク（''Nematostella vectensis''） || <ref name=He2023><pubmed>37315559</pubmed></ref> | ||
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| 左右相称動物 || 前口動物 || 節足動物 || ''Gbx'' || ショウジョウバエ（''Drosophila melanogaster''） || <ref name=Chiang1995><pubmed>8582298</pubmed></ref> | | 左右相称動物 || 前口動物 || 節足動物 || ''Gbx'' || ショウジョウバエ（''Drosophila melanogaster''） || <ref name=Chiang1995><pubmed>8582298</pubmed></ref> | ||
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| || || 軟体動物 || ''Gbx'' || | | || || 軟体動物 || ''Gbx'' || 二枚貝類（5種）、ヒザラガイ（''Acanthochitona crinita''）、サンゴノヒモ（''Wirenia argentea''）、イカ（''Loligo opalescens, Sepia officinalis''） || <ref name=Focareta2014><pubmed>25286399</pubmed></ref><ref name=Lee2003><pubmed>12718333</pubmed></ref><ref name=Mesias-Gansbiller2012><pubmed>22245384</pubmed></ref><ref name=Wollesen2017><pubmed>28710480</pubmed></ref> | ||
|| <ref name=Focareta2014><pubmed>25286399</pubmed></ref><ref name=Lee2003><pubmed>12718333</pubmed></ref><ref name=Mesias-Gansbiller2012><pubmed>22245384</pubmed></ref><ref name=Wollesen2017><pubmed>28710480</pubmed></ref> | |||
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| || || 環形動物 || ''Gbx'' || | | || || 環形動物 || ''Gbx'' || ユムシ（''Urechis caupo''）、ツリミミズ（''Lumbricus sp.''）、イソツルヒゲゴカイ（''Platynereis dumerilii''） || <ref name=Lee2003><pubmed>12718333</pubmed></ref><ref name=Steinmetz2011><pubmed>21210944</pubmed></ref> | ||
ユムシ（''Urechis caupo''）、ツリミミズ（''Lumbricus sp.'' | |||
|| <ref name=Lee2003><pubmed>12718333</pubmed></ref><ref name=Steinmetz2011><pubmed>21210944</pubmed></ref> | |||
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| 後口動物 || 棘皮動物 | | || 後口動物 || 棘皮動物 || ''Gbx'' || ウニ（''Holopneustes purpurescens''）、ヒトデ（''Asterina minor''） || <ref name=Mito1997><pubmed>9299226</pubmed></ref><ref name=Morris1997><pubmed>9409777</pubmed></ref> | ||
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| || | | || || 半索動物 || ''Gbx'' || ギボシムシ（''Saccoglossus kowalevskii''） || <ref name=Bouillet1995><pubmed>8601031</pubmed></ref><ref name=Lowe2003><pubmed>12837244</pubmed></ref> | ||
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| || | | || || 頭索動物 || ''Gbx'' || ナメクジウオ（''Branchiostoma floridae''） || <ref name=Bouillet1995><pubmed>8601031</pubmed></ref><ref name=Holland2005><pubmed>16144637</pubmed></ref> | ||
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| || || || ''Gbx'' || ヤツメウナギ（''Petromyzon marinus''） || <ref name=Bouillet1995><pubmed>8601031</pubmed></ref> | | || || || ''Gbx'' || ヤツメウナギ（''Petromyzon marinus''） || <ref name=Bouillet1995><pubmed>8601031</pubmed></ref> | ||
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| || | | || || 脊椎動物 || ''Gbx1'' || ヒト（''Homo sapiens''）、マウス（''Mus musculus''）、ニワトリ（''Gallus gallus''） || 本文参照 | ||
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| || || || ''Gbx2'' || ヒト（''Homo sapiens''）、マウス（''Mus musculus''）、ニワトリ（''Gallus gallus''）、ツメガエル（''Xenopus laevis''）、ゼブラフィッシュ（''Danio rerio''） || 本文参照 | | || || || ''Gbx2'' || ヒト（''Homo sapiens''）、マウス（''Mus musculus''）、ニワトリ（''Gallus gallus''）、ツメガエル（''Xenopus laevis''）、ゼブラフィッシュ（''Danio rerio''） || 本文参照 | ||
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1. ''Gbx'' 遺伝子の存在と配列が記載された主要動物群。ただし、モデル動物を除いてPCR産物による同定のみのものが多い。 | |||
2. ''Xenopus'' の ''gbx1'' については現時点ではゲノム配列からの予測に留まっている（2026年3月時点）。 | |||
== 構造的特徴 == | == 構造的特徴 == | ||
研究が先行している脊椎動物Gbx2は340–348アミノ酸からなるタンパク質であり、種間ではアミノ酸配列全長で65–72%の相同性を示す。一方、Gbx1については313–418アミノ酸から構成され、種間では全長で60–73%の一致が見られる。Gbx2内には、種間で特に保存性の高い4つの保存配列領域（CD1, CD2、ホメオドメイン、CD3）が存在する（図1A）<ref name=Kikuta2003><pubmed>14579382</pubmed></ref>。''Gbx''タンパク質のホメオドメインは、''Antp''クラスの中で''EHGbox''グループ<ref name=Pollard2000><pubmed>10996074</pubmed></ref>またはExtended Hoxグループに分類される<ref name=Holland2005><pubmed>16144637</pubmed></ref>。Gbx2およびGbx1のホメオドメインは、それぞれ脊椎動物種間でほぼ完全に保存されており、両者の間でも96%が一致する。さらにGbx2のホメオドメインとショウジョウバエGbx（''Unplugged''；以下''Unpg''）の間でもやはり高い相同性が見られる（92%）（図1B）。 | 研究が先行している脊椎動物Gbx2は340–348アミノ酸からなるタンパク質であり、種間ではアミノ酸配列全長で65–72%の相同性を示す。一方、Gbx1については313–418アミノ酸から構成され、種間では全長で60–73%の一致が見られる。Gbx2内には、種間で特に保存性の高い4つの保存配列領域（CD1, CD2、ホメオドメイン、CD3）が存在する（図1A）<ref name=Kikuta2003><pubmed>14579382</pubmed></ref>。''Gbx''タンパク質のホメオドメインは、''Antp''クラスの中で''EHGbox''グループ<ref name=Pollard2000><pubmed>10996074</pubmed></ref>またはExtended Hoxグループに分類される<ref name=Holland2005><pubmed>16144637</pubmed></ref>。Gbx2およびGbx1のホメオドメインは、それぞれ脊椎動物種間でほぼ完全に保存されており、両者の間でも96%が一致する。さらにGbx2のホメオドメインとショウジョウバエGbx（''Unplugged''；以下''Unpg''）の間でもやはり高い相同性が見られる（92%）（図1B）。 | ||