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→S-パルミトイル化タンパク質
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== ''S''-パルミトイル化タンパク質 == | == ''S''-パルミトイル化タンパク質 == | ||
[[Image:Palmitoylation table 1.png|thumb|right|400px]] これまでに多くのタンパク質がS- | [[Image:Palmitoylation table 1.png|thumb|right|400px]] これまでに多くのタンパク質がS-パルミトイル化修飾されることが明らかになってきた（表1）。 | ||
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|+ 表1 主なパルミトイル化タンパク質 特記以外はS-パルミトイル化 | |||
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| ファミリー<br> | |||
| 主な例<br> | |||
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| '''情報伝達分子'''<br> 小分子GTP結合蛋白質<br> 三量体GTP結合蛋白質<br> Srcファミリー<br> その他<br> | |||
| <br>H-Ras, N-Ras,R-Ras, RhoB, Cdc42 isoform 2, Rab10<br>Gαs, Gαq, Gαi2<br>Yes, Fyn, Lyn, Lck, Hcr, Fgr, Yrk<br>GAP43, eNOS, [[パラレミニン]], ハンチンチン, [[GAD65]], [[スタスミン]|-]2<br> | |||
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'''膜蛋白質'''<br> イオンチャネル<br> G蛋白質共役型受容体<br> 細胞接着分子<br> トランスポーター<br> [[マトリックスメタロプロテアーゼ]]<br> ミエリン結合分子<br> セクレターゼ<br> 細胞死関連<br> | |||
| <br>GluR1/2, GABAA γ2, アクアポリン 4, Kv1.1<br>ロドプシン, β2-アドレナリン受容体, <br>インテグリンα6, CD4, CD8, CD9, NCAM140, ニューロファシン, DCC<br>グルタミン酸トランスポーターEAAT1サブタイプ, EAAT3サブタイプ<br>MT1-マトリックスメタロプロテアーゼ<br>PLP, GPM6A<br>β-セクレターゼ, ニカストリン<br>Fas, 低親和性神経成長因子受容体 | |||
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| '''足場蛋白質'''<br> | |||
| PSD95, PSD93α/β, GRIP1/2, デルフィリン<br> | |||
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| '''ウイルス蛋白質'''<br> | |||
| インフルエンザ HA H1サブユニット, シンドビスウイルスE2蛋白質, HIV-1 gp160<br> | |||
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| '''N-パルミトイル化蛋白質'''<br> | |||
| Sonic Hedgehog, Wnt, グレリン | |||
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Ras（H-Ras, N-Ras）や[[チロシンリン酸化#.E9.9D.9E.E5.8F.97.E5.AE.B9.E4.BD.93.E5.9E.8B.E3.83.81.E3.83.AD.E3.82.B7.E3.83.B3.E3.82.AD.E3.83.8A.E3.83.BC.E3.82.BC|Srcキナーゼファミリー]]（Fyn、Lck。但しSrc自体はパルミトイル化されない）、Gタンパク質αサブユニット(Gα<sub>s</sub>, Gα<sub>i</sub>, Gα<sub>o</sub>)などのシグナルタンパク質、各種[[足場タンパク質]]([[PSD-95]], [[GRIP]])、さらには、膜貫通タンパク質である[[グルタミン酸受容体]]などの[[イオンチャネル]]、[[テトラスパニン]](CD9, CD151)、[[インテグリン]]などの[[細胞接着分子]]、[[Gタンパク質共役型受容体]]、ウイルス構成タンパク質など多岐にわたる。特に近年''S''-パルミトイル化の大規模探索（下記参照）がおこなわれ、非常に多くのタンパク質が候補として挙げられている。表１に主なパルミトイル化タンパク質を示す。 | |||
''S''-パルミトイル化はタンパク質内の近接する複数のシステインに付加する例も多く、また''N''-ミリストイル化や[[プレニル化]]とともに二重の脂質修飾を受けるタンパク質も複数知られている。''S''-パルミトイル化と''N''-ミリストイル化の二重修飾（dual acylation）を受けるタンパク質としてSrcキナーゼファミリーのFynやLck、Gタンパク質αサブユニット（Gα<sub>i1</sub>、Gα<sub>o</sub>など）、[[内皮型一酸化窒素合成酵素]]（endothelial NO synthase; eNOS）が有名である。詳細はミリストイル化の項を参照されたい。一方プレニル化は[[wikipedia:ja:イソプレノイド|イソプレノイド]]がシステイン残基にチオエーテル結合で結合する脂質修飾の総称で、15炭素鎖の[[ファルネシル化]]（farnesylation）と20炭素鎖の[[ゲラニルゲラニル化]]（geranylgeranylation）の2種類の修飾が存在する。H-RasやN-RasはS-パルミトイル化とプレニル化（ファルネシル化）の二重修飾を受けるタンパク質として有名であり、2つのCys残基はC末端領域の互いに近い位置にある。二重修飾の場合、パルミトイル化修飾は、ミリストイル化あるいはプレニル化された基質に対してのみ二次的に起こることが知られている。 | ''S''-パルミトイル化はタンパク質内の近接する複数のシステインに付加する例も多く、また''N''-ミリストイル化や[[プレニル化]]とともに二重の脂質修飾を受けるタンパク質も複数知られている。''S''-パルミトイル化と''N''-ミリストイル化の二重修飾（dual acylation）を受けるタンパク質としてSrcキナーゼファミリーのFynやLck、Gタンパク質αサブユニット（Gα<sub>i1</sub>、Gα<sub>o</sub>など）、[[内皮型一酸化窒素合成酵素]]（endothelial NO synthase; eNOS）が有名である。詳細はミリストイル化の項を参照されたい。一方プレニル化は[[wikipedia:ja:イソプレノイド|イソプレノイド]]がシステイン残基にチオエーテル結合で結合する脂質修飾の総称で、15炭素鎖の[[ファルネシル化]]（farnesylation）と20炭素鎖の[[ゲラニルゲラニル化]]（geranylgeranylation）の2種類の修飾が存在する。H-RasやN-RasはS-パルミトイル化とプレニル化（ファルネシル化）の二重修飾を受けるタンパク質として有名であり、2つのCys残基はC末端領域の互いに近い位置にある。二重修飾の場合、パルミトイル化修飾は、ミリストイル化あるいはプレニル化された基質に対してのみ二次的に起こることが知られている。 | ||
パルミトイル化蛋白質すべてに共通するコンセンサス配列は現時点では決定されていないが（下記参照）、これまでの知見を基に、''S''-パルミトイル化の予測プログラムCSS-palmが開発されておりインターネット上でフリーソフトとして配布されている。詳しくは[http://csspalm.biocuckoo.org/ こちら]を参照されたい。 | パルミトイル化蛋白質すべてに共通するコンセンサス配列は現時点では決定されていないが（下記参照）、これまでの知見を基に、''S''-パルミトイル化の予測プログラムCSS-palmが開発されておりインターネット上でフリーソフトとして配布されている。詳しくは[http://csspalm.biocuckoo.org/ こちら]を参照されたい。 | ||
== パルミトイル化サイクルの責任酵素 == | == パルミトイル化サイクルの責任酵素 == | ||