「ノンコーディングRNA」の版間の差分

　snRNP（small nuclear ribonucleoprotein）と呼ばれるリボ[[核酸]]タンパク質複合体を形成し、RNAスプライシング反応などに関わる核内に存在する低分子RNA。

　[[核小体低分子リボ核酸タンパク質複合体]]（[[snoRNPs]]:[[スノープス]]）を形成し、rRNAなどの化学的修飾に関与する一群の低分子RNA。主に核内の核小体に局在する。

====[[siRNA]]====

small interfering RNA

　CRISPR（clustered regulatory intersoaced short palindromic repeat:クリスパー）座位より転写される小分子RNAである[[crRNA]]（[[CRISPR RNA]]）と[[TracrRNA]]（[[Trans-acting crRNA]]）を組み合わせたもの。[[細菌]]や[[古細菌]]にみられる、[[バクテリオファージ]]などの外来性核酸遺伝因子を排除するための獲得[[免疫]]系として機能する座位として見つかった。（その後の応用テクノロジーは、ゲノム編集の稿を参照）

　[[wikipedia:ja:X染色体|X染色体]]の不活化に関わるncRNAである[[Xist]]は、長鎖型ノンコーディングRNA（long non-coding RNA: lncRNA）と略称が得られる以前より生物学的重要性が高く、ncRNA研究分野を牽引してきた分子である。このような[[wikipedia:ja:X染色体不活化|X染色体不活化]]は種を超えてncRNAが働き、[[クロマチン修飾因子]]との相互作用を介することで、遺伝子発現に対し抑制的に働いている。一方で、遺伝子発現の[[エンハンサー]]領域から転写される[[lncRNA]]（[[eRNA]]とも呼ばれる;[[enhancer RNA]]）は、[[RNAポリメラーゼII]]により転写され近傍の遺伝子の発現をメディエーター複合体と強調することで転写を活性化するモデルが提唱されている。いずれにせよ、配列特異性や局在性、相互作用する分子群に応じて[[転写制御]]を正にも負にも制御していると考えられる。

　lncRNAの中で、ある特定の核内構造体の形成および局在性を示す発現量の非常に高い分子群である。核内構造体には、古典的なリボソームの合成の場である核小体に加え[[核スペックル]]、[[パラスペックル]]などがある。例えば発現量が非常に高いlncRNAである[[Malat1]]や[[Neat1]]などが広く知られており、それぞれ核スペックル、パラスペックルの構成成分として、RNA結合タンパク質との結合を介した、転写制御やスプライシング制御への関与が指摘されている。lncRNAによる転写制御と同様に相互作用するRNA結合タンパク質に対するスポンジ効果（抑制）あるいは、機能の場の提供（協調活性化）の両方が想定されている。

　細胞質長鎖lncRNAには、実際は予期せぬ小分子ペプチドの産生も否定できないこと、および細胞質型lncRNA自体が機能的に解析されている代表例は少ない。一方で、最近存在が認められたスプライシング過程で産生される環状RNA（CircRNA）は、発現量も高く環状のためRNA発現の安定性も担保されることから、細胞質において[[miRNAスポンジ]]として働くことで、特定のmiRNAの機能抑制に働くとの報告がある。また同じような考え方で、[[ceRNA]]（[[competing endogenous RNA]]）とは、概念的であるが、miRNAと標的mRNAの相互作用およびその制御において、標的mRNA以外の別のmRNAが競合因子（ceRNA）としてmiRNA-mRNA相互作用に干渉するという機構として提唱されている。