「TAR DNA-binding protein of 43 kDa」の版間の差分

{{box|text=　TDP-43は核に局在するRNA結合タンパク質であり、様々な遺伝子の転写やスプライシングに関与している。2006年、筋萎縮性側索硬化症（ALS）や一部の前頭側頭葉変性症（FTLD）の神経細胞やグリア細胞に認められるユビキチン陽性封入体の主要な構成タンパク質としてTDP-43が同定された。TDP-43の凝集体形成と神経細胞脱落との関連が示唆されているが、その詳細は不明である。最近では、TDP-43凝集体のプリオン様性質が注目されており、凝集体が細胞間を伝播し、伝播した先の細胞内で凝集のシードとして機能し、その結果異常病変が経時的に拡がるという新たな病態メカニズムが考えられている。}}

　TAR DNA-binding protein of 43 kDa（TDP-43）は、ヒトエイズウイルス（HIV-1）遺伝子の末端反復配列中に存在するTAR（trans activation responsive region）と呼ばれるRNA調節配列に結合するタンパク質として1995年に最初に同定された<ref name=Ou1995><pubmed>7745706</pubmed></ref> （1）。その後、嚢胞性線維症の原因遺伝子であるcystic fibrosis transmembrane conductance regulator（CFTR）のスプライシング調節因子としてTDP-43が同定され、TDP-43がCFTRのpre-mRNAに結合し、エクソン9のスプライシングを抑制することが報告された<ref name=Buratti2001a><pubmed>11470789</pubmed></ref><ref name=Buratti2001b><pubmed>11285240</pubmed></ref> （2、 3）。

　2006年には、筋萎縮性側索硬化症（amyotrophic lateral sclerosis：ALS）およびタウ陰性の前頭側頭葉変性症（frontotemporal lobar degeneration：FTLD） に出現するユビキチン陽性封入体の主要な構成タンパク質として同定され<ref name=Arai2006><pubmed>17084815</pubmed></ref><ref name=Neumann2006><pubmed>17023659</pubmed></ref> （4、 5）、その後、TDP-43遺伝子のミスセンス変異<ref name=Prasad2019><pubmed>30837838</pubmed></ref>（6）が家族性ALSやFTLDの原因となることが遺伝学的に示されたことから、TDP-43の異常がこれらの疾患の発症と関連することが判明した。

　TDP-43は414アミノ酸からなる一本鎖ポリペプチドであり、核に局在する核タンパク質である。N末端側には核移行シグナルを有し、2つのRNA認識配列(RRM1/2)およびグリシンに富む領域（Gly-rich）が存在する('''図''')。分子の中央付近には核外搬出シグナルも存在するが、核移行シグナルが優位に機能するため主に核に局在する。このタンパク質は、不均一核内リボ核酸タンパク質（heterogeneous nuclear ribonucleoprotein：hnRNP）の一種であり、Gly-richドメインを含むC末端領域を介してhnRNP A2/B1やhnRNP A1などの他のRNA結合タンパク質と結合し、タンパク質複合体を形成することが知られている。一方、N末端側の領域はTDP-43の多量化に関与することも報告されている。

　2008年には、家族性ALSにおいてTDP-43遺伝子のミスセンス変異<ref name=Prasad2019><pubmed>30837838</pubmed></ref> （6）が相次いで報告され、TDP-43の異常と神経変性の直接的な関係が明らかとなった。TDP-43遺伝子は、染色体1p36.21上に存在し、6個のエキソンを含む。これまでに30以上のミスセンス変異が報告されているが、その殆どがC末端領域（239~414残基）をコードするエクソン6に見いだされている。TDP-43のC末端領域はGly-richドメインを有するため安定な立体構造を形成しにくいと推測され、またこの領域にはGln/Asnに富むQ/N-richドメインも存在し、プリオンの一次構造と類似性があることが報告されている<ref name=Guo2011><pubmed>21666678</pubmed></ref> （7）。このような領域に変異が多数集中していることから、これらの変異がTDP-43の立体構造に影響を及ぼす可能性が考えられるが、現在のところ、これらの変異効果についてははっきりした結果は得られていない。

　TDP-43はGly-richドメインを含むC末端領域を介して他のRNA結合タンパク質と結合し、タンパク質複合体を形成することによってスプライシングの調節に作用する。例えば、上述のようにTDP-43はCFTRのエクソン9をスキップさせ、スプライシング抑制因子として機能する<ref name=Buratti2001b><pubmed>11285240</pubmed></ref> （3）ことが判明した。またこのタンパク質は、ヒト低分子量ニューロフィラメント（hNFL）mRNAの安定化<ref name=Strong2011><pubmed>17481916</pubmed></ref> （8）、cyclin-dependent kinase 6（Cdk6）の発現抑制<ref name=Ayala2008><pubmed>18305152</pubmed></ref> （9）、survival of motor neuron 2遺伝子（SMN2）のエキソン7のスプライシング促進<ref name=Bose2008><pubmed>18703504</pubmed></ref> （10）などと関連することが報告されている。それ以外にも、マイクロRNAの生合成、長鎖ノンコーディングRNAとの関与、ストレス顆粒の形成にも関連することが知られている。

　またTDP-43遺伝子欠損マウスの解析より胎生致死となることが報告され、哺乳類においてTDP-43は必須であることが判明した<ref name=Wu2010><pubmed>20014337</pubmed></ref><ref name=Sephton2010><pubmed>20040602</pubmed></ref><ref name=Kraemer2010><pubmed>20198480</pubmed></ref> （11-13）。さらにTDP-43は自分自身でその発現量を厳密にコントロールしていることも明らかとなった。すなわちTDP-43が自身のmRNAの3'UTRに結合し，近傍の選択的スプライシングやpolyA付加を変化させることにより，自身の発現を制御していることが報告された<ref name=Polymenidou2011><pubmed>21358643</pubmed></ref><ref name=Ayala2011><pubmed>21131904</pubmed></ref><ref name=Avendanño-Vázquez2012><pubmed>22855830</pubmed></ref> （14-16）。この制御機構の破綻とALSやFTLDの発症との関連性が注目されている。

　TDP-43はほとんどすべての細胞に発現する[[核タンパク質]]であり、[[核]]内にびまん性に局在している。患者脳ではこの正常の局在が失われ、核内の一部や[[細胞質]]、[[神経突起]]などに異常な[[翻訳後修飾]]（[[リン酸化]]、[[ユビキチン]]化および断片化など）を受けた TDP-43が凝集体を形成し、それぞれ[[核内封入体]] (neuronal intranuclear inclusion: NII)、[[細胞内封入体]] (neuronal cytoplasmic inclusion: NCI）、[[変性神経突起]] (dystrophic neurite: DN)と呼ばれる。さらに神経細胞のみならず[[オリゴデンドロサイト]]の細胞質内にも凝集体を形成する。これらは[[グリア細胞質内封入体]] (glial cytoplasmic inclusion: GCI) と呼ばれ、その出現部位は多様である。

　家族性あるいは孤発性ALSやFTLDで見いだされたミスセンス変異と疾患との関わりとして、ミスセンス変異によりTDP-43の断片化が促進されること<ref name=Kabashi2008><pubmed>18372902</pubmed></ref><ref name=Sreedharan2008><pubmed>18309045</pubmed></ref> （19, 20）、あるいは凝集性の高いC末端断片（162-414残基）にミスセンス変異を導入すると、その凝集性が増加することが報告されており<ref name=Nonaka2009><pubmed>19515851</pubmed></ref> （21）、ミスセンス変異によるgain of toxic-functionの可能性が示唆されている。

　一方で、患者脳においてTDP-43の細胞質封入体が存在する細胞の核からTDP-43の染色性が消失すること<ref name=Arai2006><pubmed>17084815</pubmed></ref><ref name=Neumann2006><pubmed>17023659</pubmed></ref> （4, 5）、および培養細胞モデルを用いた解析により、C末端断片の凝集体に全長TDP-43も巻き込まれて蓄積すること<ref name=Nonaka2009><pubmed>19515851</pubmed></ref> （21）から、核におけるTDP-43の生理機能の喪失により神経細胞死が誘導される可能性（loss of function）も考えられており、現在のところ統一的な見解は得られていない。TDP-43の疾患モデル動物として種々のトランスジェニック動物が産出されているが、ヒト疾患とは異なる症状を呈する報告も散見されており、現在のところgold standardとなるモデルが出来ていない。

　また最近では、患者脳内で蓄積・凝集した不溶化TDP-43が、異常プリオンタンパク質と同様な性質を有することが示されており、TDP-43の凝集体が細胞から細胞へと伝播し、自身を鋳型として本来なら凝集しないはずの正常TDP-43を次々と凝集させ、最終的に細胞死を誘導するという機構が考えられている<ref name=Nonaka2013><pubmed>23831027</pubmed></ref> （22）。近年、タンパク質凝集の新たなメカニズムとして液-液相分離という現象が注目されており、TDP-43の凝集に関してもこの現象が関与することが多数報告されている<ref name=Prasad2019><pubmed>30837838</pubmed></ref> （6）。