「アルゴノート」の版間の差分

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 アルゴノートは、発現する組織の違いによってAGOサブファミリーとPIWIサブファミリーに分類される('''表''')。AGOサブファミリーは生殖組織を含む全ての組織で、PIWIサブファミリーは生殖組織(生殖細胞とそれを取り囲む生殖系体細胞)で特異的に発現する。それぞれのサブファミリーに属するアルゴノートの数は生物によって異なる。
 アルゴノートは、発現する組織の違いによってAGOサブファミリーとPIWIサブファミリーに分類される('''表''')。AGOサブファミリーは生殖組織を含む全ての組織で、PIWIサブファミリーは生殖組織(生殖細胞とそれを取り囲む生殖系体細胞)で特異的に発現する。それぞれのサブファミリーに属するアルゴノートの数は生物によって異なる。


 ショウジョウバエは5種類のアルゴノートを持ち、AGO1とAGO2はAGOサブファミリーに、Piwi、Aubergine、AGO3はPIWIサブファミリーに分類される<ref name=Siomi2011><pubmed>21427766</pubmed></ref><ref name=Yamashiro2018><pubmed>29281264</pubmed></ref><ref name=Williams2002><pubmed>12011447</pubmed></ref>。ヒトは8種類のアルゴノートを持つが<ref name=Sasaki2003><pubmed>12906857</pubmed></ref><ref name=Hutvagner2008><pubmed>18073770</pubmed></ref>[14, 15]、そのうちの4つ(AGO1、AGO2、AGO3、[[AGO4]])はAGOサブファミリーに、残りの4つ([[PIWIL1]]/[[HIWI]]、[[PIWIL2]]/[[HILI]]、[[PIWIL3]]、[[PIWIL4]]/[[HIWI2]])はPIWIサブファミリーに属する<ref name=Hutvagner2008><pubmed>18073770</pubmed></ref><ref name=Siomi2011><pubmed>21427766</pubmed></ref>。マウスは、4つのAGO(AGO1、AGO2、AGO3、AGO4)と、3つのPIWI(PIWIL1/MIWI、PIWIL2/MILI、PIWIL4/MIWI2)を持つ<ref name=Hutvagner2008><pubmed>18073770</pubmed></ref><ref name=Siomi2011><pubmed>21427766</pubmed></ref>。マウスのPIWIは全て雄特異的であることを特徴とする。
 ショウジョウバエは5種類のアルゴノートを持ち、AGO1とAGO2はAGOサブファミリーに、Piwi、Aubergine、AGO3はPIWIサブファミリーに分類される<ref name=Siomi2011><pubmed>21427766</pubmed></ref><ref name=Yamashiro2018><pubmed>29281264</pubmed></ref><ref name=Williams2002><pubmed>12011447</pubmed></ref>。ヒトは8種類のアルゴノートを持つが<ref name=Sasaki2003><pubmed>12906857</pubmed></ref><ref name=Hutvagner2008><pubmed>18073770</pubmed></ref>、そのうちの4つ(AGO1、AGO2、AGO3、[[AGO4]])はAGOサブファミリーに、残りの4つ([[PIWIL1]]/[[HIWI]]、[[PIWIL2]]/[[HILI]]、[[PIWIL3]]、[[PIWIL4]]/[[HIWI2]])はPIWIサブファミリーに属する<ref name=Hutvagner2008><pubmed>18073770</pubmed></ref><ref name=Siomi2011><pubmed>21427766</pubmed></ref>。マウスは、4つのAGO(AGO1、AGO2、AGO3、AGO4)と、3つのPIWI(PIWIL1/MIWI、PIWIL2/MILI、PIWIL4/MIWI2)を持つ<ref name=Hutvagner2008><pubmed>18073770</pubmed></ref><ref name=Siomi2011><pubmed>21427766</pubmed></ref>。マウスのPIWIは全て雄特異的であることを特徴とする。


 線虫は27種類のアルゴノートを持ち、そのうちの5つはAGOサブファミリーに、3つはPIWIサブファミリーに属する。残りのアルゴノートは線虫特異的で[[Worm-specific Argonaute]] ([[WAGO]])と称される<ref name=Ketting2021><pubmed>33992161</pubmed></ref>。
 線虫は27種類のアルゴノートを持ち、そのうちの5つはAGOサブファミリーに、3つはPIWIサブファミリーに属する。残りのアルゴノートは線虫特異的で[[Worm-specific Argonaute]] ([[WAGO]])と称される<ref name=Ketting2021><pubmed>33992161</pubmed></ref>。
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| ショウジョウバエ || AGO1, AGO2 || Piwi, Aubergine, AGO3  
| ショウジョウバエ || AGO1, AGO2 || Piwi, Aubergine, AGO3  
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| マウス || AGO1, AGO2, AGO3, AGO4  || MIWI(PIWIL1), MILI(PIWIL2), MIWI2(PIWIL4)   
| マウス || AGO1, AGO2, AGO3, AGO4  || MIWI (PIWIL1), MILI (PIWIL2), MIWI2 (PIWIL4)   
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| ヒト || AGO1, AGO2, AGO3, AGO4  || HIWI(PIWIL1), HILI(PIWIL2), PIWIL3, HIWI2(PIWIL4)  
| ヒト || AGO1, AGO2, AGO3, AGO4  || HIWI (PIWIL1), HILI (PIWIL2), PIWIL3, HIWI2 (PIWIL4)  
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 全てのアルゴノートは、N、PAZ、MID、PIWIという4つの主要ドメインと、2つのリンカー(Linker-1とLinker-2)を持つ<ref name=Hutvagner2008><pubmed>18073770</pubmed></ref><ref name=Nakanishi2022><pubmed>35736234</pubmed></ref>('''図1''')。
 全てのアルゴノートは、N、PAZ、MID、PIWIという4つの主要ドメインと、2つのリンカー(Linker-1とLinker-2)を持つ<ref name=Hutvagner2008><pubmed>18073770</pubmed></ref><ref name=Nakanishi2022><pubmed>35736234</pubmed></ref>('''図1''')。


 NドメインはRISC形成に寄与する。PAZドメインはガイド(小分子)RNAの3’末端に、MIDドメインは5’末端に結合する。PIWIドメインは[[RNaseH]]様構造をとっており、アルゴノートが標的RNAを切断するための[[エンドヌクレアーゼ]]活性(スライサー活性ともいう)を担う<ref name=Nakanishi2022><pubmed>35736234</pubmed></ref><ref name=Song2004><pubmed>15284453</pubmed></ref>。その活性中心に相当する[[アスパラギン酸]]-[[グルタミン酸]]-アスパラギン酸-[[ヒスチジン]](Asp-Glu-Asp-His)の4つのアミノ酸を変異させると、RNA切断活性を示さなくなる。但し、ヒトのAGO3はこの4つのアミノ酸を持つにもかかわらず、エンドヌクレアーゼ活性を示さない。
 NドメインはRISC形成に寄与する。PAZドメインはガイド(小分子)RNAの3’末端に、MIDドメインは5’末端に結合する。PIWIドメインは[[RNaseH]]様構造をとっており、アルゴノートが標的RNAを切断するための[[エンドヌクレアーゼ]]活性(スライサー活性ともいう)を担う<ref name=Nakanishi2022><pubmed>35736234</pubmed></ref><ref name=Song2004><pubmed>15284453</pubmed></ref>。その活性中心のアミノ酸は、[[アスパラギン酸]]-[[グルタミン酸]]-アスパラギン酸-[[ヒスチジン]](Asp-Glu-Asp-His)である。


 最初に立体構造が解明されたアルゴノートは、[[超高熱古細菌]](''Pyrococcus furiosus'')のAGOである<ref name=Song2004><pubmed>15284453</pubmed></ref>。ヒトの4種類全てのAGOと、ショウジョウバエPiwi、[[カイコ]](''Bombyx mori'')Piwiホモログ(Siwi)の立体構造も既に解かれている<ref name=Matsumoto2016><pubmed>27693359</pubmed></ref><ref name=Nakanishi2022><pubmed>35736234</pubmed></ref><ref name=Yamaguchi2020><pubmed>31913276</pubmed></ref>。
 最初に立体構造が解明されたアルゴノートは、[[超高熱古細菌]](''Pyrococcus furiosus'')のAGOである<ref name=Song2004><pubmed>15284453</pubmed></ref>。ヒトの4種類全てのAGOと、ショウジョウバエPiwi、[[カイコ]](''Bombyx mori'')Piwiホモログ(Siwi)の立体構造も既に解かれている<ref name=Matsumoto2016><pubmed>27693359</pubmed></ref><ref name=Nakanishi2022><pubmed>35736234</pubmed></ref><ref name=Yamaguchi2020><pubmed>31913276</pubmed></ref>。