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エンハンサーとそれに結合した複数の転写活性化因子から成る構造体を、enhanceosomeと呼ぶこともある<ref><pubmed>18206362</pubmed></ref>。<br> | エンハンサーとそれに結合した複数の転写活性化因子から成る構造体を、enhanceosomeと呼ぶこともある<ref><pubmed>18206362</pubmed></ref>。<br> | ||
コアクチベーターには、CBPやp300といったヒストンアセチルトランスフェラーゼ(histone acetyltransferase; HAT)活性を持つものがあり、ヒストンをアセチル化する<ref><pubmed>21131905</pubmed></ref><ref><pubmed>19698979</pubmed></ref>。アセチル化されたヒストンでは、DNAとの間の結合が弱まり、転写因子がDNAに結合しやすくなると考えられている。また、クロマチン再構成複合体(chromatin remodeling complex)は転写活性化因子に結合し、ATP依存的にヌクレオソームの配置を変更したり、分解する<ref><pubmed>20513433</pubmed></ref><ref><pubmed>10500090</pubmed></ref> | コアクチベーターには、CBPやp300といったヒストンアセチルトランスフェラーゼ(histone acetyltransferase; HAT)活性を持つものがあり、ヒストンをアセチル化する<ref><pubmed>21131905</pubmed></ref><ref><pubmed>19698979</pubmed></ref>。アセチル化されたヒストンでは、DNAとの間の結合が弱まり、転写因子がDNAに結合しやすくなると考えられている。また、クロマチン再構成複合体(chromatin remodeling complex)は転写活性化因子に結合し、ATP依存的にヌクレオソームの配置を変更したり、分解する<ref><pubmed>20513433</pubmed></ref><ref><pubmed>10500090</pubmed></ref>。その結果、より多くの転写活性化因子がエンハンサーに結合することができるようになり、プロモーターでは転写開始複合体の形成が促進され、転写が活性化される。<br> | ||
エンハンサーでは、ヒストンの翻訳後修飾が他の領域と異なり、ヒストンH3の4番目のリジンがモノメチル化またはジメチル化される(H3K4me1/ H3K4me2)<ref><pubmed>17277777</pubmed></ref>。また、H3.3やH2A.Zを含むヌクレオソームが存在し<ref><pubmed>19633671</pubmed></ref>、通常のヌクレオソームより不安定なため、転写活性化因子がDNAと容易に相互作用できると考えられている。ヒストンH3.3やH2A.Zを含むヌクレオソームは、プロモーターにも存在するが、ヒストンH3の4番目のリジンはトリメチル化されている(H3K4me3) | エンハンサーでは、ヒストンの翻訳後修飾が他の領域と異なり、ヒストンH3の4番目のリジンがモノメチル化またはジメチル化される(H3K4me1/ H3K4me2)<ref><pubmed>17277777</pubmed></ref>。また、H3.3やH2A.Zを含むヌクレオソームが存在し<ref><pubmed>19633671</pubmed></ref>、通常のヌクレオソームより不安定なため、転写活性化因子がDNAと容易に相互作用できると考えられている。ヒストンH3.3やH2A.Zを含むヌクレオソームは、プロモーターにも存在するが、ヒストンH3の4番目のリジンはトリメチル化されている(H3K4me3)。さらに、エンハンサーにおけるヒストンは、転写の有無により異なる。例えば、ヒトES細胞では、エンハンサーが働いている時はヒストンH3の27番目のリジンがアセチル化されるが(H3K27ac)、機能していない時はメチル化される(H3K27me3)ことが知られている<ref><pubmed>21160473</pubmed></ref>。<br> | ||
エンハンサーでは、enhancer RNA (eRNA)とよばれるRNAが双方向に転写されて産生されることがある<ref><pubmed>20393465</pubmed></ref>。eRNAはタンパク質をコードせず、ポリアデニル化されない。転写活性化因子p53が結合するエンハンサーの中には、その機能にeRNAを必要とするものがある<ref><pubmed>23273978</pubmed></ref>。しかし、eRNAが全てのエンハンサーの機能に関与するかはまだわかっていない。一方、100塩基以上の長さを持つノンコーディングRNA(lncRNA)が転写を活性化する場合がある<ref><pubmed>20887892</pubmed></ref>。lncRNAのほとんどは、一方向に転写され、ポリアデニル化される。''ncRNA-a7''と呼ばれるlncRNAの遺伝子をリポーター遺伝子と連結すると、''ncRNA-a7''遺伝子の位置や方向に関係なくリポーター遺伝子の転写が活性化される。lncRNAが転写を活性化する詳しいメカニズムはまだよくわかっていない。ENCODEプロジェクトによって、これまで「junk DNA」であると考えられてきたヒトゲノムの領域から、9640のlncRNAが転写されることが明らかとなった<ref><pubmed>22955616</pubmed></ref>。<br> | エンハンサーでは、enhancer RNA (eRNA)とよばれるRNAが双方向に転写されて産生されることがある<ref><pubmed>20393465</pubmed></ref>。eRNAはタンパク質をコードせず、ポリアデニル化されない。転写活性化因子p53が結合するエンハンサーの中には、その機能にeRNAを必要とするものがある<ref><pubmed>23273978</pubmed></ref>。しかし、eRNAが全てのエンハンサーの機能に関与するかはまだわかっていない。一方、100塩基以上の長さを持つノンコーディングRNA(lncRNA)が転写を活性化する場合がある<ref><pubmed>20887892</pubmed></ref>。lncRNAのほとんどは、一方向に転写され、ポリアデニル化される。''ncRNA-a7''と呼ばれるlncRNAの遺伝子をリポーター遺伝子と連結すると、''ncRNA-a7''遺伝子の位置や方向に関係なくリポーター遺伝子の転写が活性化される。lncRNAが転写を活性化する詳しいメカニズムはまだよくわかっていない。ENCODEプロジェクトによって、これまで「junk DNA」であると考えられてきたヒトゲノムの領域から、9640のlncRNAが転写されることが明らかとなった<ref><pubmed>22955616</pubmed></ref>。<br> | ||