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== サブファミリー== | == サブファミリー== | ||
アルゴノートは、発現する組織の違いによってAGOサブファミリーとPIWIサブファミリーに分類される（'''表'''）。AGOサブファミリーメンバーは生殖組織を含む全ての組織で、PIWIサブファミリーメンバーは生殖組織（生殖細胞とそれを取り囲む生殖系体細胞）で特異的に発現する。それぞれのサブファミリーに属するアルゴノートの数は生物によって異なる。 | |||
ショウジョウバエは5種類のアルゴノートを持ち、AGO1とAGO2はAGOサブファミリーに、Piwi、Aubergine、AGO3はPIWIサブファミリーに分類される<ref name=Siomi2011><pubmed>21427766</pubmed></ref><ref name=Yamashiro2018><pubmed>29281264</pubmed></ref> [10, 11, 13] | ショウジョウバエは5種類のアルゴノートを持ち、AGO1とAGO2はAGOサブファミリーに、Piwi、Aubergine、AGO3はPIWIサブファミリーに分類される<ref name=Siomi2011><pubmed>21427766</pubmed></ref><ref name=Yamashiro2018><pubmed>29281264</pubmed></ref> [10, 11, 13]。ヒトは8種類のアルゴノートを持つが<ref name=Hutvagner2008><pubmed>18073770</pubmed></ref><ref name=Sasaki2003><pubmed>12906857</pubmed></ref> [14, 15]、そのうちの4つ（AGO1、AGO2、AGO3、AGO4）はAGOサブファミリーに、残りの４つ（PIWIL1/HIWI、PIWIL2/HILI、PIWIL3、PIWIL4/HIWI2）はPIWIサブファミリーに属する<ref name=Hutvagner2008><pubmed>18073770</pubmed></ref><ref name=Siomi2011><pubmed>21427766</pubmed></ref> [10, 15] 。マウスは、４つのAGOメンバー（AGO1、AGO2、AGO3、AGO4）と、３つのPIWIメンバー（PIWIL1/MIWI、PIWIL2/MILI、PIWIL4/MIWI2）を持つ<ref name=Hutvagner2008><pubmed>18073770</pubmed></ref><ref name=Siomi2011><pubmed>21427766</pubmed></ref> [10, 15]。マウスのPIWIは全て雄特異的であることを特徴とする。 | ||
線虫は27種類のアルゴノートを持ち、そのうちの5メンバーはAGOサブファミリーに、3メンバーはPIWIサブファミリーに属する。残りのアルゴノートは線虫特異的でWAGO（Worm-specific Argonaute）と称される<ref name=Ketting2021><pubmed>33992161</pubmed></ref> [16]。 | |||
{| class="wikitable" | {| class="wikitable" | ||
|+表. ショウジョウバエ、マウス、ヒトのAGOサブファミリーメンバーとPIWIサブファミリーメンバー | |+表. ショウジョウバエ、マウス、ヒトのAGOサブファミリーメンバーとPIWIサブファミリーメンバー | ||
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| ヒト || AGO1 AGO2 AGO3 AGO4 || HIWI(PIWIL1) HILI(PIWIL2) PIWIL3 HIWI2(PIWIL4) | | ヒト || AGO1 AGO2 AGO3 AGO4 || HIWI(PIWIL1) HILI(PIWIL2) PIWIL3 HIWI2(PIWIL4) | ||
|} | |} | ||
== ドメイン構造と立体構造 == | == ドメイン構造と立体構造 == | ||
全てのアルゴノートは、N、PAZ、MID、PIWIという４つの主要ドメインと、２つのリンカー（Linker-1とLinker-2）を持つ<ref name=Hutvagner2008><pubmed>18073770</pubmed></ref><ref name=Nakanishi2022><pubmed>35736234</pubmed></ref> [15, 17] （図1）。NドメインはRISC形成に寄与する。PAZドメインはガイド（小分子）RNAの3’末端に、MIDドメインは5’末端に結合する。PIWIドメインはRNaseH様構造をとっており、アルゴノートが標的RNAを切断するためのエンドヌクレアーゼ活性（スライサー活性ともいう）を担う<ref name=Nakanishi2022><pubmed>35736234</pubmed></ref><ref name=Song2004><pubmed>15284453</pubmed></ref> [17, 18]。その活性中心に相当するアスパラギン酸-グルタミン酸-アスパラギン酸-ヒスチジン（Asp-Glu-Asp-His）の４つのアミノ酸を変異させると、RNA切断活性を示さなくなる。但し、ヒトのAGO3はこの４つのアミノ酸を持つにもかかわらず、エンドヌクレアーゼ活性を示さない。最初に立体構造が解明されたアルゴノートは、超高熱古細菌（Pyrococcus furiosus）のAGOである<ref name=Song2004><pubmed>15284453</pubmed></ref> [18]。ヒトの４種類全てのAGOと、ショウジョウバエPiwi、カイコ（Bombyx mori）Piwiホモログ（Siwi）の立体構造も既に解かれている<ref name=Matsumoto2016><pubmed>27693359</pubmed></ref><ref name=Nakanishi2022><pubmed>35736234</pubmed></ref><ref name=Yamaguchi2020><pubmed>31913276</pubmed></ref> [17, 19, 20]。 | 全てのアルゴノートは、N、PAZ、MID、PIWIという４つの主要ドメインと、２つのリンカー（Linker-1とLinker-2）を持つ<ref name=Hutvagner2008><pubmed>18073770</pubmed></ref><ref name=Nakanishi2022><pubmed>35736234</pubmed></ref> [15, 17] （図1）。NドメインはRISC形成に寄与する。PAZドメインはガイド（小分子）RNAの3’末端に、MIDドメインは5’末端に結合する。PIWIドメインはRNaseH様構造をとっており、アルゴノートが標的RNAを切断するためのエンドヌクレアーゼ活性（スライサー活性ともいう）を担う<ref name=Nakanishi2022><pubmed>35736234</pubmed></ref><ref name=Song2004><pubmed>15284453</pubmed></ref> [17, 18]。その活性中心に相当するアスパラギン酸-グルタミン酸-アスパラギン酸-ヒスチジン（Asp-Glu-Asp-His）の４つのアミノ酸を変異させると、RNA切断活性を示さなくなる。但し、ヒトのAGO3はこの４つのアミノ酸を持つにもかかわらず、エンドヌクレアーゼ活性を示さない。最初に立体構造が解明されたアルゴノートは、超高熱古細菌（Pyrococcus furiosus）のAGOである<ref name=Song2004><pubmed>15284453</pubmed></ref> [18]。ヒトの４種類全てのAGOと、ショウジョウバエPiwi、カイコ（Bombyx mori）Piwiホモログ（Siwi）の立体構造も既に解かれている<ref name=Matsumoto2016><pubmed>27693359</pubmed></ref><ref name=Nakanishi2022><pubmed>35736234</pubmed></ref><ref name=Yamaguchi2020><pubmed>31913276</pubmed></ref> [17, 19, 20]。 | ||