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<br>Shank分子内、あるいはShank分子間の相互作用としては、アンキリンリピートとSH3ドメインが相互作用する <ref><pubmed>15496675</pubmed></ref>ほか、PDZドメインはホモ二量体を<ref name="ref2"><pubmed>12954649</pubmed></ref>、SAMドメインは多量体を<ref name="ref3"><pubmed>16439662</pubmed></ref> 形成する．このPDZドメインによるホモ二量体形成には、PDZドメイン本来の蛋白質結合部位は関与しないので、二量体を形成しても、他のPDZリガンドは結合できる（図２）．一方、結晶化されたSAMドメインは一周6分子の螺旋状ポリマーを形成しており（図３）、更にこの螺旋が側面で会合して、Zn2+イオンに依存性の二次元の広がりをもつシートを形成する．<br> 但し、SAMドメインの大きさはShank全長の3%にしか相当しないので、上流の長い配列も含めて大きなポリマーを形成できるかどうかは不明である． | <br>Shank分子内、あるいはShank分子間の相互作用としては、アンキリンリピートとSH3ドメインが相互作用する <ref><pubmed>15496675</pubmed></ref>ほか、PDZドメインはホモ二量体を<ref name="ref2"><pubmed>12954649</pubmed></ref>、SAMドメインは多量体を<ref name="ref3"><pubmed>16439662</pubmed></ref> 形成する．このPDZドメインによるホモ二量体形成には、PDZドメイン本来の蛋白質結合部位は関与しないので、二量体を形成しても、他のPDZリガンドは結合できる（図２）．一方、結晶化されたSAMドメインは一周6分子の螺旋状ポリマーを形成しており（図３）、更にこの螺旋が側面で会合して、Zn2+イオンに依存性の二次元の広がりをもつシートを形成する．<br> 但し、SAMドメインの大きさはShank全長の3%にしか相当しないので、上流の長い配列も含めて大きなポリマーを形成できるかどうかは不明である． | ||
[[Image:1Q3P.jpg|frame|right|250px|図２ Shank PDZ ドメインによるダイマー形成とGKAPとの相互作用 | [[Image:1Q3P.jpg|frame|right|250px|図２ Shank PDZ ドメインによるダイマー形成とGKAPとの相互作用 <ref name="ref2" />]] | ||
図２ Shank PDZ ドメインによるダイマー形成とGKAPとの相互作用 <ref name="ref2" /> | 図２ Shank PDZ ドメインによるダイマー形成とGKAPとの相互作用 <ref name="ref2" /> | ||
図３ Shank SAM ドメインの結晶構造 <ref name="ref3" />[[Image:Shank-SAM 2F44.png|frame|right|250px|図３ Shank SAMドメインの結晶構造 | 図３ Shank SAM ドメインの結晶構造 <ref name="ref3" />[[Image:Shank-SAM 2F44.png|frame|right|250px|図３ Shank SAMドメインの結晶構造 <ref name="ref3" />]] | ||
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ProSAPiP1 <ref><pubmed>16522626</pubmed></ref> | ProSAPiP1 <ref><pubmed>16522626</pubmed></ref> | ||
[[Image:3L4F.jpg|frame|right|250px|図４ Shank PDZ ドメインとbetaPIXとの相互作用 | [[Image:3L4F.jpg|frame|right|250px|図４ Shank PDZ ドメインとbetaPIXとの相互作用 <ref><pubmed>20117114</pubmed></ref>]] | ||
=== [[アクチン]]結合蛋白質 === | === [[アクチン]]結合蛋白質 === | ||