「カルモジュリン」の版間の差分
ナビゲーションに移動
検索に移動
細 (→神経回路の発達) |
Hajimefujii (トーク | 投稿記録) 細 (→発見) |
||
| (3人の利用者による、間の88版が非表示) | |||
| 1行目: | 1行目: | ||
カルモジュリン 英：Calmodulin | |||
==要約== | |||
カルモジュリンは148アミノ酸残基、分子量約16.7kDa、酸性の[[CA2|Ca2]]+結合タンパク質であり、それぞれ2つのEFハンドドメインからなるN末側ドメインとC末側ドメインがリンカーでつながったダンベル様構造をしている。カルモジュリンは、酵母、植物、昆虫から[[ヒト]]まで真核生物に発現しており、特に脊椎動物の中では高い保存性を示す。Ca2+と結合することで、下流のタンパク質に結合して活性などを調節し、Ca2+センサーとしてCa2+シグナル伝達の中でも非常に重要な役割を果たす。特に脳においては、神経発生、軸策突起進展、[[長期記憶]]など様々な機能に関わる。 | |||
==発見== | ==発見== | ||
1970年、Kakiuchiらは、ラット脳抽出物中の環状ヌクレオチドフォスフォジエステラーゼ活性がCa2+により制御されることを報告し<ref>'''S Kakiuchi, R Yamazaki'''<br>Stimulation of the activity of cyclic 3',5'-nucleotide phosphodiesterase by [[calcium]] ion.<br>''Proc. Japan Acad. 46, 387-392'':1970</ref>、このCa2+依存性を担う活性化因子を見出した<ref>'''S Kakiuchi, R Yamazaki, H Nakajima'''<br>Properties of a heat-stable phosphodiesterase activating factor isolated from brain extract<br>''Proc. Japan Acad. 46, 587-592'':1970</ref><ref><pubmed> 4320714 </pubmed></ref>。また、同じ1970年に独立してCheungは環状ヌクレオチドフォスフォジエステラーゼの活性が精製の過程で減弱することから、精製の過程で分離される分画より活性化因子を発見し報告した<ref><pubmed> 4315350</pubmed></ref>。1973年にTeoとWangらはウシの心臓からこの活性化因子を精製し<ref><pubmed>4346337</pubmed></ref>、45Caとゲル濾過の手法を用いてこの別々に発見された因子の正体が同一のCa2+結合タンパク質であることを示した<ref><pubmed> 4353626 </pubmed></ref><ref>'''日高弘義、垣内史朗 編'''<br>カルモデュリン―Ca2+受容蛋白質<br>:1981</ref>。その後、トロポニンCに特性が類似したタンパク質であることが示され<ref><pubmed> 181374 </pubmed></ref> <ref><pubmed> 181375 </pubmed></ref>、アミノ酸配列が決定され<ref><pubmed> 7356670 </pubmed></ref>、分光学的解析によってCa2+結合に伴って構造が変化することが示された<ref><pubmed> 14663 </pubmed></ref> <ref><pubmed> 193856 </pubmed></ref> <ref><pubmed> 200611 </pubmed></ref>。その呼び名は研究グループによって、activator protein, modulator protein, Ca2+dependent regulator protein (CDR), Phosphodiesterase Activating Factor (PAF)などさまざまに呼ばれたが、1970年代末にCalmodulinという名称が付けられた<ref>"WY Cheung, Calcium and Cell Function: Volume 1"</ref><ref><pubmed> 208377 </pubmed></ref>。 | |||
==構造== | ==構造== | ||
カルモジュリンは148残基のアミノ酸からなる、分子量約16.7ｋDaのタンパク質である。1985年にウシ由来カルモジュリンのX線結晶構造が解かれ、原子レベルでの構造が明らかになった<ref><pubmed> 3990807 </pubmed></ref>。Ca2+と結合する4つのヘリックス・ループ・ヘリックス構造のEFハンドモチーフを持ち、2つずつがそれぞれペアとなって球状のN末側ドメイン、C末側ドメインを形成し、その間をリンカーがつながったダンベル様の構造をしている。それぞれの球状のドメインの大きさは約25×20×20オングストロームであり、分子全体としては長軸が約65オングストロームの長さである<ref><pubmed> 3990807 </pubmed></ref>。Ca2+と結合することで、疎水性領域が露出し、ターゲットとなるタンパク質のカルモジュリン結合ドメインと相互作用する。 | |||
==サブファミリー== | ==サブファミリー== | ||
Calmodulin1 | |||
Calmodulin2 | |||
Calmodulin3 | |||
ヒト、[[ラット]]のCalmodulin1, Calmodulin2, Calmodulin3は同一のアミノ酸配列のタンパク質をコードしている。 | |||
==機能== | ==機能== | ||
カルモジュリンは脳内で10～100マイクロモル/リットルの濃度で発現しており<ref><pubmed> 15803158 </pubmed></ref>、細胞内で上昇したCa2+と結合し、様々なカルモジュリン結合タンパク質と結合して生理機能を発揮する。カルモジュリン結合タンパク質の多くはCa2+依存的であり、Ca2+/カルモジュリンと結合するが、Ca2+と結合していないカルモジュリンと結合するタンパク質や、Ca2+非依存的に結合するタンパク質も存在する。カルモジュリンの主要な機能は、細胞内のCa2+濃度の変化を感知し、カルモジュリン結合タンパクの機能制御を通じて、細胞機能を制御することである。 | |||
カルモジュリン結合タンパク質としては、環状ヌクレオチド代謝酵素（フォスフォジエステラーゼ、アデニル酸シクラーゼ）、膜タンパク質（[[ATP]]依存的Ca2+ポンプ、代謝型[[グルタミン酸]]受容体、[[L型カルシウムチャネル]]、IP3 受容体）、リン酸化酵素（MLCK、Ca2+/CaM依存的キナーゼI/II/IV、ホスホリラーゼキナーゼ）、 脱リン酸化酵素（[[カルシニューリン]]）、 [[細胞骨格]]系タンパク質（カルデスモン、MAP２、アデューシン、カルスペクトリン、ミオシン）、シグナル伝達タンパク質（RasGRF1、[[一酸化窒素]]合成酵素）などが知られている。こうした様々なタンパク質と結合し、その活性や機能を制御することがカルモジュリンの機能である。 | |||
==阻害剤== | ==阻害剤== | ||
W-7<ref><pubmed>6254958 </pubmed></ref> ナフタレンスルホンアミド誘導体。カルモジュリンの疎水性領域に結合する。 | |||
カルミダゾリウム (Van Belle, 1989) | |||
== | ==カルモジュリンを用いたCa2+インディケーター== | ||
カルモジュリンがCa2+依存的にターゲットペプチドと相互作用することを用いて、様々なGenetically-encoded Ca2+ indicatorが開発されている。大まかには、２色の異なる色の蛍光タンパク質間の蛍光共鳴エネルギー移動を用いてその２色の蛍光強度の比をレシオメトリック測定することが可能なFRETセンサー(Cameleonなど)と<ref><pubmed> 9148946 </pubmed></ref><ref><pubmed> 9278050 </pubmed></ref>、円順列変異[[GFP]]を用いてその蛍光強度からCa2+濃度を測定する単色蛍光プローブ（G-CaMPなど）がある<ref><pubmed> 11175727 </pubmed></ref><ref><pubmed> 11248055 </pubmed></ref>。2010年前後から、GCaMPの改良が進んでおり、さまざまな色のインディケーターの開発や脳活動を神経細胞レベルで長期間観察するのに用いられている<ref><pubmed>19898485 </pubmed></ref><ref><pubmed>21903779 </pubmed></ref><ref><pubmed>23868258 </pubmed></ref><ref><pubmed>25419959</pubmed></ref>。 | |||
<references/> | <references/> | ||
2015年7月21日 (火) 14:56時点における版
カルモジュリン 英：Calmodulin
要約
カルモジュリンは148アミノ酸残基、分子量約16.7kDa、酸性のCa2+結合タンパク質であり、それぞれ2つのEFハンドドメインからなるN末側ドメインとC末側ドメインがリンカーでつながったダンベル様構造をしている。カルモジュリンは、酵母、植物、昆虫からヒトまで真核生物に発現しており、特に脊椎動物の中では高い保存性を示す。Ca2+と結合することで、下流のタンパク質に結合して活性などを調節し、Ca2+センサーとしてCa2+シグナル伝達の中でも非常に重要な役割を果たす。特に脳においては、神経発生、軸策突起進展、長期記憶など様々な機能に関わる。
発見
1970年、Kakiuchiらは、ラット脳抽出物中の環状ヌクレオチドフォスフォジエステラーゼ活性がCa2+により制御されることを報告し[1]、このCa2+依存性を担う活性化因子を見出した[2][3]。また、同じ1970年に独立してCheungは環状ヌクレオチドフォスフォジエステラーゼの活性が精製の過程で減弱することから、精製の過程で分離される分画より活性化因子を発見し報告した[4]。1973年にTeoとWangらはウシの心臓からこの活性化因子を精製し[5]、45Caとゲル濾過の手法を用いてこの別々に発見された因子の正体が同一のCa2+結合タンパク質であることを示した[6][7]。その後、トロポニンCに特性が類似したタンパク質であることが示され[8] [9]、アミノ酸配列が決定され[10]、分光学的解析によってCa2+結合に伴って構造が変化することが示された[11] [12] [13]。その呼び名は研究グループによって、activator protein, modulator protein, Ca2+dependent regulator protein (CDR), Phosphodiesterase Activating Factor (PAF)などさまざまに呼ばれたが、1970年代末にCalmodulinという名称が付けられた[14][15]。
構造
カルモジュリンは148残基のアミノ酸からなる、分子量約16.7ｋDaのタンパク質である。1985年にウシ由来カルモジュリンのX線結晶構造が解かれ、原子レベルでの構造が明らかになった[16]。Ca2+と結合する4つのヘリックス・ループ・ヘリックス構造のEFハンドモチーフを持ち、2つずつがそれぞれペアとなって球状のN末側ドメイン、C末側ドメインを形成し、その間をリンカーがつながったダンベル様の構造をしている。それぞれの球状のドメインの大きさは約25×20×20オングストロームであり、分子全体としては長軸が約65オングストロームの長さである[17]。Ca2+と結合することで、疎水性領域が露出し、ターゲットとなるタンパク質のカルモジュリン結合ドメインと相互作用する。
サブファミリー
Calmodulin1 Calmodulin2 Calmodulin3
ヒト、ラットのCalmodulin1, Calmodulin2, Calmodulin3は同一のアミノ酸配列のタンパク質をコードしている。
機能
カルモジュリンは脳内で10～100マイクロモル/リットルの濃度で発現しており[18]、細胞内で上昇したCa2+と結合し、様々なカルモジュリン結合タンパク質と結合して生理機能を発揮する。カルモジュリン結合タンパク質の多くはCa2+依存的であり、Ca2+/カルモジュリンと結合するが、Ca2+と結合していないカルモジュリンと結合するタンパク質や、Ca2+非依存的に結合するタンパク質も存在する。カルモジュリンの主要な機能は、細胞内のCa2+濃度の変化を感知し、カルモジュリン結合タンパクの機能制御を通じて、細胞機能を制御することである。
カルモジュリン結合タンパク質としては、環状ヌクレオチド代謝酵素（フォスフォジエステラーゼ、アデニル酸シクラーゼ）、膜タンパク質（ATP依存的Ca2+ポンプ、代謝型グルタミン酸受容体、L型カルシウムチャネル、IP3 受容体）、リン酸化酵素（MLCK、Ca2+/CaM依存的キナーゼI/II/IV、ホスホリラーゼキナーゼ）、 脱リン酸化酵素（カルシニューリン）、 細胞骨格系タンパク質（カルデスモン、MAP２、アデューシン、カルスペクトリン、ミオシン）、シグナル伝達タンパク質（RasGRF1、一酸化窒素合成酵素）などが知られている。こうした様々なタンパク質と結合し、その活性や機能を制御することがカルモジュリンの機能である。
阻害剤
W-7[19] ナフタレンスルホンアミド誘導体。カルモジュリンの疎水性領域に結合する。
カルミダゾリウム (Van Belle, 1989)
カルモジュリンを用いたCa2+インディケーター
カルモジュリンがCa2+依存的にターゲットペプチドと相互作用することを用いて、様々なGenetically-encoded Ca2+ indicatorが開発されている。大まかには、２色の異なる色の蛍光タンパク質間の蛍光共鳴エネルギー移動を用いてその２色の蛍光強度の比をレシオメトリック測定することが可能なFRETセンサー(Cameleonなど)と[20][21]、円順列変異GFPを用いてその蛍光強度からCa2+濃度を測定する単色蛍光プローブ（G-CaMPなど）がある[22][23]。2010年前後から、GCaMPの改良が進んでおり、さまざまな色のインディケーターの開発や脳活動を神経細胞レベルで長期間観察するのに用いられている[24][25][26][27]。
- ↑ S Kakiuchi, R Yamazaki
Stimulation of the activity of cyclic 3',5'-nucleotide phosphodiesterase by calcium ion.
Proc. Japan Acad. 46, 387-392:1970 - ↑ S Kakiuchi, R Yamazaki, H Nakajima
Properties of a heat-stable phosphodiesterase activating factor isolated from brain extract
Proc. Japan Acad. 46, 587-592:1970 - ↑
Kakiuchi, S., & Yamazaki, R. (1970).
Calcium dependent phosphodiesterase activity and its activating factor (PAF) from brain studies on cyclic 3',5'-nucleotide phosphodiesterase (3). Biochemical and biophysical research communications, 41(5), 1104-10. [PubMed:4320714] [WorldCat] [DOI] - ↑
Cheung, W.Y. (1970).
Cyclic 3',5'-nucleotide phosphodiesterase. Demonstration of an activator. Biochemical and biophysical research communications, 38(3), 533-8. [PubMed:4315350] [WorldCat] [DOI] - ↑
Teo, T.S., Wang, T.H., & Wang, J.H. (1973).
Purification and properties of the protein activator of bovine heart cyclic adenosine 3',5'-monophosphate phosphodiesterase. The Journal of biological chemistry, 248(2), 588-95. [PubMed:4346337] [WorldCat] - ↑
Teo, T.S., & Wang, J.H. (1973).
Mechanism of activation of a cyclic adenosine 3':5'-monophosphate phosphodiesterase from bovine heart by calcium ions. Identification of the protein activator as a Ca2+ binding protein. The Journal of biological chemistry, 248(17), 5950-5. [PubMed:4353626] [WorldCat] - ↑ 日高弘義、垣内史朗 編
カルモデュリン―Ca2+受容蛋白質
:1981 - ↑
Stevens, F.C., Walsh, M., Ho, H.C., Teo, T.S., & Wang, J.H. (1976).
Comparison of calcium-binding proteins. Bovine heart and brain protein activators of cyclic nucleotide phosphodiesterase and rabbit skeletal muscle troponin C. The Journal of biological chemistry, 251(15), 4495-500. [PubMed:181374] [WorldCat] - ↑
Watterson, D.M., Harrelson, W.G., Keller, P.M., Sharief, F., & Vanaman, T.C. (1976).
Structural similarities between the Ca2+-dependent regulatory proteins of 3':5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase and actomyosin ATPase. The Journal of biological chemistry, 251(15), 4501-13. [PubMed:181375] [WorldCat] - ↑
Watterson, D.M., Sharief, F., & Vanaman, T.C. (1980).
The complete amino acid sequence of the Ca2+-dependent modulator protein (calmodulin) of bovine brain. The Journal of biological chemistry, 255(3), 962-75. [PubMed:7356670] [WorldCat] - ↑
Klee, C.B. (1977).
Conformational transition accompanying the binding of Ca2+ to the protein activator of 3',5'-cyclic adenosine monophosphate phosphodiesterase. Biochemistry, 16(5), 1017-24. [PubMed:14663] [WorldCat] [DOI] - ↑
Wolff, D.J., Poirier, P.G., Brostrom, C.O., & Brostrom, M.A. (1977).
Divalent cation binding properties of bovine brain Ca2+-dependent regulator protein. The Journal of biological chemistry, 252(12), 4108-17. [PubMed:193856] [WorldCat] - ↑
Dedman, J.R., Potter, J.D., Jackson, R.L., Johnson, J.D., & Means, A.R. (1977).
Physicochemical properties of rat testis Ca2+-dependent regulator protein of cyclic nucleotide phosphodiesterase. Relationship of Ca2+-binding, conformational changes, and phosphodiesterase activity. The Journal of biological chemistry, 252(23), 8415-22. [PubMed:200611] [WorldCat] - ↑ "WY Cheung, Calcium and Cell Function: Volume 1"
- ↑
Cheung, W.Y., Lynch, T.J., & Wallace, R.W. (1978).
An endogenous Ca2+-dependent activator protein of brain adenylate cyclase and cyclic neucleotide phosphodiesterase. Advances in cyclic nucleotide research, 9, 233-51. [PubMed:208377] [WorldCat] - ↑
Babu, Y.S., Sack, J.S., Greenhough, T.J., Bugg, C.E., Means, A.R., & Cook, W.J. (1985).
Three-dimensional structure of calmodulin. Nature, 315(6014), 37-40. [PubMed:3990807] [WorldCat] [DOI] - ↑
Babu, Y.S., Sack, J.S., Greenhough, T.J., Bugg, C.E., Means, A.R., & Cook, W.J. (1985).
Three-dimensional structure of calmodulin. Nature, 315(6014), 37-40. [PubMed:3990807] [WorldCat] [DOI] - ↑
Xia, Z., & Storm, D.R. (2005).
The role of calmodulin as a signal integrator for synaptic plasticity. Nature reviews. Neuroscience, 6(4), 267-76. [PubMed:15803158] [WorldCat] [DOI] - ↑
Tanaka, T., & Hidaka, H. (1980).
Hydrophobic regions function in calmodulin-enzyme(s) interactions. The Journal of biological chemistry, 255(23), 11078-80. [PubMed:6254958] [WorldCat] - ↑
Romoser, V.A., Hinkle, P.M., & Persechini, A. (1997).
Detection in living cells of Ca2+-dependent changes in the fluorescence emission of an indicator composed of two green fluorescent protein variants linked by a calmodulin-binding sequence. A new class of fluorescent indicators. The Journal of biological chemistry, 272(20), 13270-4. [PubMed:9148946] [WorldCat] [DOI] - ↑
Miyawaki, A., Llopis, J., Heim, R., McCaffery, J.M., Adams, J.A., Ikura, M., & Tsien, R.Y. (1997).
Fluorescent indicators for Ca2+ based on green fluorescent proteins and calmodulin. Nature, 388(6645), 882-7. [PubMed:9278050] [WorldCat] [DOI] - ↑
Nakai, J., Ohkura, M., & Imoto, K. (2001).
A high signal-to-noise Ca(2+) probe composed of a single green fluorescent protein. Nature biotechnology, 19(2), 137-41. [PubMed:11175727] [WorldCat] [DOI] - ↑
Nagai, T., Sawano, A., Park, E.S., & Miyawaki, A. (2001).
Circularly permuted green fluorescent proteins engineered to sense Ca2+. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 98(6), 3197-202. [PubMed:11248055] [PMC] [WorldCat] [DOI] - ↑
Tian, L., Hires, S.A., Mao, T., Huber, D., Chiappe, M.E., Chalasani, S.H., ..., & Looger, L.L. (2009).
Imaging neural activity in worms, flies and mice with improved GCaMP calcium indicators. Nature methods, 6(12), 875-81. [PubMed:19898485] [PMC] [WorldCat] [DOI] - ↑
Zhao, Y., Araki, S., Wu, J., Teramoto, T., Chang, Y.F., Nakano, M., ..., & Campbell, R.E. (2011).
An expanded palette of genetically encoded Ca²⁺ indicators. Science (New York, N.Y.), 333(6051), 1888-91. [PubMed:21903779] [PMC] [WorldCat] [DOI] - ↑
Chen, T.W., Wardill, T.J., Sun, Y., Pulver, S.R., Renninger, S.L., Baohan, A., ..., & Kim, D.S. (2013).
Ultrasensitive fluorescent proteins for imaging neuronal activity. Nature, 499(7458), 295-300. [PubMed:23868258] [PMC] [WorldCat] [DOI] - ↑
Inoue, M., Takeuchi, A., Horigane, S., Ohkura, M., Gengyo-Ando, K., Fujii, H., ..., & Bito, H. (2015).
Rational design of a high-affinity, fast, red calcium indicator R-CaMP2. Nature methods, 12(1), 64-70. [PubMed:25419959] [WorldCat] [DOI]