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直後の2000年には系統的にIL-1受容体ファミリー遺伝子の探索と機能解析を進めていたJ.E. Simsらのグループがヒト[[ゲノム]]配列データベースの相同性検索から、新たに2つの[[インターロイキン-1受容体]]ファミリーメンバーを発見し、[[three immunoglobulin domain-containing IL-1 receptor-related-1]] ([[TIGIRR-1]])および[[TIGIRR-2]]として報告した<ref name=Born2000><pubmed>10882729</pubmed></ref>[2]。TIGIRR-2とIL1RAPLは同一タンパク質であり、以後、IL1RAPL/TIGIRR-2はIL1RAPL1として、TIGIRR-1は[[IL1RAPL2]]として統一表記されるようになった。 | 直後の2000年には系統的にIL-1受容体ファミリー遺伝子の探索と機能解析を進めていたJ.E. Simsらのグループがヒト[[ゲノム]]配列データベースの相同性検索から、新たに2つの[[インターロイキン-1受容体]]ファミリーメンバーを発見し、[[three immunoglobulin domain-containing IL-1 receptor-related-1]] ([[TIGIRR-1]])および[[TIGIRR-2]]として報告した<ref name=Born2000><pubmed>10882729</pubmed></ref>[2]。TIGIRR-2とIL1RAPLは同一タンパク質であり、以後、IL1RAPL/TIGIRR-2はIL1RAPL1として、TIGIRR-1は[[IL1RAPL2]]として統一表記されるようになった。 | ||
[[ファイル:Yoshida IL1RAPL1 Fig4.png|サムネイル|'''図1. IL1RAPL1の構造''']] | |||
== 構造 == | == 構造 == | ||
ヒトIL1RAPL1タンパク質はN末端のシグナルペプチドを含めて696アミノ酸より構成される1型[[膜貫通タンパク質]]である('''図1''')。細胞外領域に3つの[[イムノグロブリン様ドメイン|イムノグロブリン様 (Ig)ドメイン]]を持ち、細胞内領域に[[Toll/Interleukin-1受容体ドメイン|Toll/Interleukin-1受容体 (TIR)ドメイン]]を1つ持つ。このドメイン配置はIL-1受容体ファミリーの共通構造である。細胞内領域のTIRドメインよりもC末端側にはおよそ150アミノ酸より構成されるC末端領域を持つ。この領域は[[パラログ]]であるIL1RAPL2とIL-1RAPの[[神経細胞]]特異的スプライスバリアント([[IL-1RAPb]])には存在するが、他のIL-1受容体ファミリータンパク質には存在しない('''図1''')<ref name=Smith2009><pubmed>19481478</pubmed></ref>[3]。細胞外領域のIgドメイン内には多数の[[N型糖鎖]]付加部位が存在し、[[糖鎖修飾]]を受けている<ref name=Carrie1999><pubmed>10471494</pubmed></ref><ref name=Yamagata2015><pubmed>25908590</pubmed></ref>[1][4]。C末端には1型[[PDZドメイン]]結合モチーフが存在する(機能については後述)<ref name=Pavlowsky2010><pubmed>20096586</pubmed></ref>[5]。また、細胞外領域の1番目と2番目のIgドメイン、あるいは1から3番目のIgドメインをコードする分泌型と考えられるスプライスバリアント転写物も報告されている<ref name=Carrie1999><pubmed>10471494</pubmed></ref>[1]。 | ヒトIL1RAPL1タンパク質はN末端のシグナルペプチドを含めて696アミノ酸より構成される1型[[膜貫通タンパク質]]である('''図1''')。細胞外領域に3つの[[イムノグロブリン様ドメイン|イムノグロブリン様 (Ig)ドメイン]]を持ち、細胞内領域に[[Toll/Interleukin-1受容体ドメイン|Toll/Interleukin-1受容体 (TIR)ドメイン]]を1つ持つ。このドメイン配置はIL-1受容体ファミリーの共通構造である。細胞内領域のTIRドメインよりもC末端側にはおよそ150アミノ酸より構成されるC末端領域を持つ。この領域は[[パラログ]]であるIL1RAPL2とIL-1RAPの[[神経細胞]]特異的スプライスバリアント([[IL-1RAPb]])には存在するが、他のIL-1受容体ファミリータンパク質には存在しない('''図1''')<ref name=Smith2009><pubmed>19481478</pubmed></ref>[3]。細胞外領域のIgドメイン内には多数の[[N型糖鎖]]付加部位が存在し、[[糖鎖修飾]]を受けている<ref name=Carrie1999><pubmed>10471494</pubmed></ref><ref name=Yamagata2015><pubmed>25908590</pubmed></ref>[1][4]。C末端には1型[[PDZドメイン]]結合モチーフが存在する(機能については後述)<ref name=Pavlowsky2010><pubmed>20096586</pubmed></ref>[5]。また、細胞外領域の1番目と2番目のIgドメイン、あるいは1から3番目のIgドメインをコードする分泌型と考えられるスプライスバリアント転写物も報告されている<ref name=Carrie1999><pubmed>10471494</pubmed></ref>[1]。 | ||
== サブファミリー == | == サブファミリー == | ||
3つのIgドメインと1つの細胞内TIRドメインの共通ドメイン構成をもつ9つのIL-1受容体ファミリーメンバーの一員である('''図1, 2''')<ref name=Rivers-Auty2018><pubmed>29559685</pubmed></ref>[6]。アミノ酸配列はIL-RAPとの間で約50%、パラログのIL1RAPL2との間で62%保存されている。その他のメンバーとの相同性は15-25%程度である。ヒトゲノム中で、IL1RAPL1、IL1RAPL2、IL-1RAP遺伝子(IL1RAP)を除くすべてのIL-1受容体ファミリーメンバー遺伝子は2番染色体の長腕(2q12)にタンデムに並んで存在する。一方、IL1RAPL1及びIL1RAPL2はそれぞれX染色体の短腕(Xp22.1-21.3)と長腕(Xq22)に、IL1RAPは3番染色体長腕(3q28)に存在する。後述するように、他のIL-1受容体ファミリーメンバーとは異なり、IL1RAPL1、IL1RAPL2、IL-1RAPは[[シナプスオーガナイザー]]として機能することからもこれら3つの遺伝子が他とは別個の進化をたどったことが窺える。 | 3つのIgドメインと1つの細胞内TIRドメインの共通ドメイン構成をもつ9つのIL-1受容体ファミリーメンバーの一員である('''図1, 2''')<ref name=Rivers-Auty2018><pubmed>29559685</pubmed></ref>[6]。アミノ酸配列はIL-RAPとの間で約50%、パラログのIL1RAPL2との間で62%保存されている。その他のメンバーとの相同性は15-25%程度である。ヒトゲノム中で、IL1RAPL1、IL1RAPL2、IL-1RAP遺伝子(IL1RAP)を除くすべてのIL-1受容体ファミリーメンバー遺伝子は2番染色体の長腕(2q12)にタンデムに並んで存在する。一方、IL1RAPL1及びIL1RAPL2はそれぞれX染色体の短腕(Xp22.1-21.3)と長腕(Xq22)に、IL1RAPは3番染色体長腕(3q28)に存在する。後述するように、他のIL-1受容体ファミリーメンバーとは異なり、IL1RAPL1、IL1RAPL2、IL-1RAPは[[シナプスオーガナイザー]]として機能することからもこれら3つの遺伝子が他とは別個の進化をたどったことが窺える。 | ||