「Chromosome 9 open reading frame 72」の版間の差分

　C9orf72遺伝子は、神経変性疾患である筋萎縮性側索硬化症（ALS: amyotrophic lateral sclerosis）および前頭側頭型認知症（FTD: frontotemporal dementia）の原因となる代表的な遺伝子の1つとして、研究が進展してきた。

　2006年、家族性ALS/FTD家系を用いた連鎖解析によって、責任遺伝子領域が9番染色体短腕に同定され<ref name=Morita2006><pubmed>16421333</pubmed></ref>[1]<ref name=Vance2006><pubmed>16495328</pubmed></ref>[2]、その後の遺伝子探索によって、2011年にC9orf72遺伝子非翻訳領域内のGGGGCC 6塩基リピート配列の異常伸長（正常: 2-24回リピート, 疾患: 60-4000回リピート）が、原因遺伝子変異として同定された<ref name=DeJesusHernandez2011><pubmed>21944778</pubmed></ref>[3]<ref name=Renton2011><pubmed>21944779</pubmed></ref>[4]。このリピート伸長変異は、欧米のALS/FTDコホートにおいて最も頻度の高い原因遺伝子変異であることが明らかとなり、同遺伝子の生理的機能やリピート伸長変異による病態メカニズムに注目が集まり、研究が展開されている。

　生理的機能に関しては未解明の点が多いものの、分子系統解析では本遺伝子は真核生物の進化初期に出現し、哺乳類を含む広範な生物種で保存されていることから、生物学的に重要な役割を担うと想定されている<ref name=Smeyers2021><pubmed>34025358</pubmed></ref>[5]。特に、C9orf72タンパク質はDENN（differentially expressed in normal and neoplastic cells）ドメインを有し、本ドメインを有する一群のタンパク質はRabファミリーを中心とした低分子量Gタンパク質の活性制御に関与することから、小胞輸送やオートファジーとの関連が注目されている。近年では、自然免疫応答の制御機能についても示唆されている（後述）<ref name=Smeyers2021><pubmed>34025358</pubmed></ref>[5]。

　C9orf72遺伝子連鎖性ALS/FTD（C9-ALS/FTD）の病態メカニズムに関しては、当初、GGGGCCリピート伸長変異による遺伝子機能の喪失や、転写された異常伸長リピート配列を含む変異RNA（リピートRNA）による毒性が想定されていた。しかし2013年に、リピートRNAから非古典的なリピート関連非AUG依存性（RAN: repeat-associated non-AUG）翻訳によって病的なジペプチドリピートペプチドタンパク質（DPR: dipeptide repeat protein）が産生され、実際にDPRが患者脳に蓄積することが明らかになり、現在ではこれら3つの病態メカニズムが協調的に神経変性病態に寄与すると考えられている<ref name=Balendra2018><pubmed>30120348</pubmed></ref>[6]。

　ヒトでは染色体9p21.2に存在する41kbの遺伝子で、12のエクソン（エクソン 1a、1b、2~11）から構成される<ref name=Smeyers2021><pubmed>34025358</pubmed></ref>[5]<ref name=Balendra2018><pubmed>30120348</pubmed></ref>[6]。翻訳開始に利用されるATGコドンはエクソン2に存在し、エクソン2~11がC9orf72タンパク質をコードする。エクソン1aおよび1bはタンパク質をコードしない非翻訳領域である。ALS, FTDと関連するGGGGCCリピート配列は、エクソン1aと1bの間の非翻訳領域に存在する（'''図1'''）<ref name=Smeyers2021><pubmed>34025358</pubmed></ref>[5]<ref name=Balendra2018><pubmed>30120348</pubmed></ref>[6]。

　複数の転写開始点および転写終結点を有し、転写産物については3種類のバリアントが報告されている。Variant 1（V1）はエクソン1a、2~5から構成される短鎖転写産物である。Variant 2（V2）はエクソン1b、2~11、Variant 3（V3）はエクソン1a、2~11から構成される長鎖転写産物である<ref name=Smeyers2021><pubmed>34025358</pubmed></ref>[5]<ref name=Balendra2018><pubmed>30120348</pubmed></ref>[6]。GGGGCCリピート配列は、V1およびV3ではイントロン領域に存在する一方で、V2では転写開始点直上流に存在し、転写産物自体には含まれない（'''図1'''）<ref name=Smeyers2021><pubmed>34025358</pubmed></ref>[5]<ref name=Balendra2018><pubmed>30120348</pubmed></ref>[6]。

　222アミノ酸から構成されるショートアイソフォーム（分子量24.7kDa）と、481アミノ酸から構成されるロングアイソフォーム（分子量54.3kDa）の2種類のアイソフォームが存在する。ショートアイソフォームはV1転写産物から、ロングアイソフォームはV2およびV3転写産物から翻訳される（'''図1'''）<ref name=Smeyers2021><pubmed>34025358</pubmed></ref>[5]<ref name=Balendra2018><pubmed>30120348</pubmed></ref>[6]。ロングアイソフォームはDENNドメインを有し、主にGDP/GTP交換因子（GEF: GDP/GTP exchange factor）として低分子量Gタンパク質の活性制御を担うDENNファミリータンパク質の一員と考えられている<ref name=Levine2013><pubmed>23329412</pubmed></ref>[7]<ref name=Zhang2012><pubmed>23248642</pubmed></ref>[8]。

　C9orf72転写産物はほとんどのヒト組織において発現が認められるが、特に脳、血液細胞、脾臓、脾臓、卵巣などにおいて高発現を示す<ref name=GTExPortal>GTExPortal [Internet]. Available from: https://www.gtexportal.org/home/gene/C9orf72</ref>[9]。脳内では小脳おける発現が顕著であり、血液細胞ではリンパ球よりも骨髄系細胞において高い発現が報告されている<ref name=Renton2011><pubmed>21944779</pubmed></ref>[4]<ref name=Rizzu2016><pubmed>27079381</pubmed></ref>[10]。

　C9orf72タンパク質もまた、ヒトのほとんどの組織で発現している。マウスを用いた解析では、脳、脊髄、および脾臓で特に高い発現を認めている<ref name=Frick2018><pubmed>30075745</pubmed></ref>[11]。

　培養細胞では、C9orf72タンパク質はリソソームと共局在することが報告されている<ref name=Laflamme2019><pubmed>31612854</pubmed></ref>[12]。ヒト脳組織における免疫組織化学では、ショートアイソフォームが主に神経細胞の核膜に分布する一方で、ロングアイソフォームは細胞質全体に広く分布し、神経突起や細胞体に点状構造を形成することが確認されている<ref name=Xiao2015><pubmed>26174152</pubmed></ref>[13]。また、ヒトiPS細胞由来運動ニューロンを用いた検討により、C9orf72タンパク質がシナプス小胞にも局在することが示唆されている<ref name=Frick2018><pubmed>30075745</pubmed></ref>[11]。

　DENNファミリータンパク質の1つであるC9orf72タンパク質は、同じくDENNドメインを有するSMCR8（Smith-Magenis chromosome region 8）、および足場タンパク質として機能するWDR41（WD40-repeat containing protein 41）と三者複合体を形成する[14][15][16][17]。この複合体は協調的に種々の低分子量G タンパク質の活性制御に関与し、他のDENNファミリータンパク質同様、DENNドメインを介して基質からGDPの解離を促進し、GTP結合型への変換を誘導するGEFとして機能する<ref name=Yang2016><pubmed>27617292</pubmed></ref>[14]<ref name=Sellier2016><pubmed>27103069</pubmed></ref>[15][14][15]。逆に、クライオ電子顕微鏡による複合体の構造解析や生化学的解析では、GTPase活性化タンパク質（GAP: GTPase activating protein）としての機能も報告されている<ref name=Su2020><pubmed>32848248</pubmed></ref>[16]<ref name=Tang2020><pubmed>32303654</pubmed></ref>[17][16][17]。C9orf72タンパク質が相互作用する代表的な低分子量G タンパク質は、小胞輸送に関与するRabファミリータンパク質であり、これによってオートファジーやシナプス機能などの様々な生体反応を制御することが明らかになっている。また近年では、自然免疫応答の制御においても重要な役割を担うことが示唆されている。

　培養神経細胞系やヒト脊髄運動ニューロンにおいて、C9orf72タンパク質はRab1、Rab5、Rab7、Rab11などのRabファミリータンパク質と共局在する<ref name=Farg2014><pubmed>24549040</pubmed></ref>[18]。また培養細胞を用いた免疫沈降法による解析では、Rab8aやRab39b、FIP200/Ulk1/ATG13/ATG101複合体と相互作用することが報告されている<ref name=Sellier2016><pubmed>27103069</pubmed></ref>[15]<ref name=Su2020><pubmed>32848248</pubmed></ref>[16]。これらの分子との相互作用を介して、C9orf72タンパク質はオートファジーの開始、基質のリクルートメント、隔離膜の伸長と閉鎖、オートファゴソームとリソソームの融合など、オートファジーの各段階を制御すると考えられている<ref name=Beckers2021><pubmed>33632058</pubmed></ref>[19]。実際に、C9orf72遺伝子をノックダウンした培養細胞では、オートファジーの誘導阻害や異常なオートファゴソームの蓄積が観察されている<ref name=Su2020><pubmed>32848248</pubmed></ref>[16]<ref name=Farg2014><pubmed>24549040</pubmed></ref>[18]。

　C9orf72タンパク質が相互作用するRab39bは、AMPA型グルタミン酸受容体の小胞輸送およびリサイクリングに関与し、受容体のサブユニット構成やシナプスの電気生理学的特性を調節する<ref name=Mignogna2015><pubmed>25784538</pubmed></ref>[20]。C9orf72ノックアウトマウスでは、シナプス後部においてRab39bの発現が低下し、AMPA型グルタミン酸受容体GluR1サブユニットの発現が亢進することが報告されており、C9orf72タンパク質がRab39bの発現や活性を制御することでシナプス機能を調節している可能性が示唆されている<ref name=Xiao2019><pubmed>31651360</pubmed></ref>[21]。

　C9orf72タンパク質は、Rabファミリータンパク質とは異なる低分子量G タンパク質であるArfファミリータンパク質とも相互作用し、特にArf6との相互作用を介して、運動ニューロンにおけるアクチン細胞骨格の動態を制御することが報告されている<ref name=Su2020><pubmed>32848248</pubmed></ref>[16]<ref name=Sivadasan2016><pubmed>27723745</pubmed></ref>[22]。培養神経細胞ではC9orf72遺伝子の過剰発現によって軸索が伸長し、ノックダウンによって短縮することが確認されている<ref name=Sivadasan2016><pubmed>27723745</pubmed></ref>[22]。

　C9orf72ノックアウトマウスでは、脾腫やリンパ節腫脹といった免疫系組織の腫大が認められ、さらにTypeⅠインターフェロンなどの炎症性サイトカインや自己抗体の産生が亢進していることから、免疫系における役割が注目されている<ref name=ORourke2016><pubmed>26989253</pubmed></ref>[23]<ref name=SudriaLopez2016><pubmed>27206760</pubmed></ref>[24]。特に、骨髄系細胞特異的C9orf72ノックアウトマウスにおいても、同様の異常が確認されることから、同細胞での作用が免疫系の制御に重要であると考えられる<ref name=McCauley2020><pubmed>32814898</pubmed></ref>[25]。その詳細な機序は未解明であるものの、C9orf72タンパク質がオートファジー活性を調節することで、STINGやmTORC1といった自然免疫応答に関与する分子の発現を制御する可能性が示唆されている<ref name=McCauley2020><pubmed>32814898</pubmed></ref>[25]<ref name=Shao2020><pubmed>31847700</pubmed></ref>[26]。

　2006年に、欧米の家族性ALS/FTDコホートの連鎖解析によって、責任遺伝子領域として9番染色体短腕13.2-21.3が同定された<ref name=Morita2006><pubmed>16421333</pubmed></ref>[1]<ref name=Vance2006><pubmed>16495328</pubmed></ref>[2]。その後5年にわたる原因遺伝子変異探索の結果、2011年にC9orf72遺伝子の非翻訳領域内に存在するGGGGCCリピート配列の異常伸長が、原因遺伝子変異として同定された<ref name=DeJesusHernandez2011><pubmed>21944778</pubmed></ref>[3]<ref name=Renton2011><pubmed>21944779</pubmed></ref>[4]。この配列のリピート回数は、健常人では2~23回であるが、C9-ALS/FTDでは40~6000回に異常伸長している<ref name=Gossye2015>Gossye H., Engelborghs S., Van Broeckhoven C., van der Zee J. (2015). C9orf72 FTD and/or ALS. GeneReviews® [Internet]. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK268647/</ref>[27]。リピート伸長変異は不完全浸透であり、一般人口においても約0.1~0.4%の頻度で認められる<ref name=Renton2011><pubmed>21944779</pubmed></ref>[4]<ref name=Beck2013><pubmed>23434116</pubmed></ref>[28]。異常リピート回数の明確な閾値の決定は困難であり、リピート回数が24回から30回程度の中間伸長アレルも疾患発症リスクとなることが知られている<ref name=Iacoangeli2019><pubmed>31315673</pubmed></ref>[29]。本リピート伸長変異は、家族性ALSの約40%、家族性FTDの約25％、孤発性ALSおよびFTDの5~6%で認められており、両疾患における最も頻度の高い遺伝的素因である<ref name=Majounie2012><pubmed>22406228</pubmed></ref>[30]。なお、変異の頻度には地域差があり、欧米では高頻度であるのに対し、日本を含むアジア地域では稀である<ref name=Majounie2012><pubmed>22406228</pubmed></ref>[30]。

　臨床的には、ALS、FTD、あるいは両者の合併症状を来たすことが多い<ref name=Balendra2018><pubmed>30120348</pubmed></ref>[6]。病理学的には、RNA結合タンパク質TDP-43の核内からの消失および細胞質での異常凝集が認められる点で、大部分の孤発性ALSや一部のFTD症例と共通している<ref name=Balendra2018><pubmed>30120348</pubmed></ref>[6]。

　C9-ALS/FTD患者の脳組織では、C9orf72転写産物およびタンパク質の発現がともに低下しており、ハプロ不全が神経変性病態に関与する可能性が示唆されている<ref name=DeJesusHernandez2011><pubmed>21944778</pubmed></ref>[3]<ref name=vanBlitterswijk2015><pubmed>26437865</pubmed></ref>[31]<ref name=Waite2014><pubmed>24559645</pubmed></ref>[32]<ref name=Saberi2018><pubmed>29196813</pubmed></ref>[33]。先述の通り、C9orf72ノックアウトマウスでは、免疫系の異常を認められるものの、明らかな神経変性は生じない<ref name=ORourke2016><pubmed>26989253</pubmed></ref>[23]<ref name=SudriaLopez2016><pubmed>27206760</pubmed></ref>[24]。しかし、C9orf72遺伝子の発現低下はオートファジーの障害を介して、後述するDPRによる神経変性病態を増悪させることが報告されており、ハプロ不全と毒性獲得性のメカニズムが協調的に病態に関与していると考えられている<ref name=Zhu2020><pubmed>32284607</pubmed></ref>[34]<ref name=Boivin2020><pubmed>31930538</pubmed></ref>[35]。

　異常伸長したリピート配列は両方向性に転写され、GGGGCCリピートおよびその逆鎖であるCCCCGGリピートを含むリピートRNAが産生される。これらのリピートRNAはRNA結合タンパク質（RBP: RNA-binding protein）と異常な相互作用を獲得して、RBPの生理的な分布や機能を撹乱し得る。特に、リピートRNAは異常な高次構造を形成してRNA fociと呼ばれるRNA凝集体を形成し、種々のRBPと共凝集することが示されている<ref name=DeJesusHernandez2011><pubmed>21944778</pubmed></ref>[3]<ref name=Haeusler2014><pubmed>24598541</pubmed></ref>[36]。例えば、GGGGCCリピートRNAが形成するRNA fociは、hnRNPH, hnRNPF, hnRNPA1, ALYREF, SRSF2, nucleolinといった多数のRBPと共局在し<ref name=Haeusler2014><pubmed>24598541</pubmed></ref>[36]<ref name=Conlon2016><pubmed>27623008</pubmed></ref>[37]<ref name=Lee2013><pubmed>24290757</pubmed></ref>[38]<ref name=CooperKnock2014><pubmed>24866055</pubmed></ref>[39]、これらのタンパク質が本来制御するスプライシング、転写、RNA輸送といったRNA代謝機構を乱す可能性がある。実際に、hnRNPHのRNA fociへの共凝集は標的mRNAのスプライシング異常を来すことが報告されている<ref name=Conlon2016 />[37]。

　非翻訳領域由来のリピートRNAは、AUG開始コドンを欠くものの、RAN翻訳によって異常なDPRが産生される。RAN翻訳は鋳型となるRNAにリピート配列が含まれる際に、AUG開始コドン非存在下に翻訳が開始し、リピートペプチドが産生される非古典的な翻訳であり（'''図3A'''）、元々2011年に、同じく遺伝子非翻訳領域で異常伸長したリピート配列を原因とする脊髄小脳失調症8型（CAGリピート）および筋強直性ジストロフィー1型（CTGリピート）で発見された<ref name=Zu2011><pubmed>21173221</pubmed></ref>[40]。AUGコドン非依存的な翻訳開始には、リピートRNAが形成する高次構造が重要であると示唆されている<ref name=Zu2011><pubmed>21173221</pubmed></ref>[40]。3種類全ての読み枠で翻訳が進行するため、GGGGCCリピートRNAからはDPRとしてポリグリシン-アルギニン（polyGR）、ポリグリシン-アラニン（polyGA）、ポリグリシン-プロリン（polyGP）ペプチドが、CCCCGGリピートRNAからはポリグリシン-プロリン（polyGP）、ポリプロリン-アルギニン（polyPR）、ポリプロリン-アラニン（polyPA）ペプチドが産生され、実際に患者脳や髄液で検出される（'''図3B'''）<ref name=Mori2013a><pubmed>23393093</pubmed></ref>[41]<ref name=Mori2013b><pubmed>24132570</pubmed></ref>[42]<ref name=Ash2013><pubmed>23415312</pubmed></ref>[43]<ref name=Zu2013><pubmed>24248382</pubmed></ref>[44]<ref name=Gendron2013><pubmed>24129584</pubmed></ref>[45]。

　polyGAは凝集性が高く、病理学的にC9-ALS/FTD患者脳で最も豊富に検出されるDPRである<ref name=Mackenzie2015><pubmed>26374446</pubmed></ref>[46]。培養細胞や動物モデルではpolyGAは弱い神経毒性を生じ、またプロテアソームと相互作用することからタンパク質分解系を障害する可能性がある<ref name=Mizielinska2014><pubmed>25103406</pubmed></ref>[47]<ref name=May2014><pubmed>25120191</pubmed></ref>[48]<ref name=Guo2018><pubmed>29398115</pubmed></ref>[49]。一方、アルギニンを含有するDPRであるpolyGRやpolyPRは、患者脳での発現はpolyGAと比較して少ないが<ref name=Mackenzie2015><pubmed>26374446</pubmed></ref>[46]、培養細胞や動物モデルで最も高度な毒性を来す<ref name=Mizielinska2014><pubmed>25103406</pubmed></ref>[47]<ref name=Wen2014><pubmed>25521377</pubmed></ref>[50]。その機序として、核細胞質輸送の障害<ref name=Cook2020><pubmed>32878979</pubmed></ref>[51]や、核小体やストレス顆粒といった膜のないオルガネラの動態の障害<ref name=Boeynaems2017><pubmed>28306503</pubmed></ref>[52]<ref name=Lee2016><pubmed>27768896</pubmed></ref>[53]が実験的に示唆されている。

　なお、C9-ALS/FTD以外にも、ゲノム中に存在するリピート配列の異常伸長は60を超える遺伝性疾患の原因となり、多くが運動ニューロン疾患、小脳失調、認知症、末梢神経障害、てんかん、ミオパチーなどを来す神経筋疾患である（リピート病）。その中でも遺伝子の非翻訳領域内のリピート伸長変異を原因とする疾患群はノンコーディングリピート病として総称され、C9-ALS/FTDと共通する病態基盤が想定されている<ref name=Malik2021><pubmed>34140671</pubmed></ref>[54]<ref name=Fujino2022><pubmed>34940797</pubmed></ref>[55]。