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== 生合成 == | == 生合成 == | ||
=== 新生GPIアンカー型タンパク質ができるまで === | === 新生GPIアンカー型タンパク質ができるまで === | ||
GPIアンカー型タンパク質の生合成は[[小胞体]]膜上で前駆体タンパク質とGPIが別々に合成され、小胞体内腔側でGPIがタンパク質に[[翻訳後修飾]]の形で付加される<ref name=Kinoshita2020><pubmed>32156170</pubmed></ref><ref name=Kinoshita2024><pubmed>39129667</pubmed></ref> ('''図2''') | GPIアンカー型タンパク質の生合成は[[小胞体]]膜上で前駆体タンパク質とGPIが別々に合成され、小胞体内腔側でGPIがタンパク質に[[翻訳後修飾]]の形で付加される<ref name=Kinoshita2020><pubmed>32156170</pubmed></ref><ref name=Kinoshita2024><pubmed>39129667</pubmed></ref> ('''図2''')。前駆体タンパク質はカルボキシ末端におおよそ30〜40残基からなるGPIアンカー付加シグナル配列を持ち、この配列が特定の部位で切断されることで、新たに露出したC末端にGPIアンカーが付加される。GPIは、[[エタノールアミンリン酸]]を介してタンパク質のカルボキシ末端と[[アミド結合]]する。反応は[[トランスアミデーション]]であり、触媒部位に[[システイン]]を持つ[[ホスファチジルイノシトール糖鎖アンカー生合成クラスKタンパク質|ホスファチジルイノシトール糖鎖アンカー生合成クラスK]]([[phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class K]], PIGK]])タンパク質を含む5つのタンパク質からなる[[GPIトランスアミダーゼ]]([[GPI-TA]])によって行われる。最近、GPIトランスアミダーゼ複合体の構造が[[クライオ電顕]]で解かれ、酵素の構造と反応の詳細がかなり明らかになった<ref name=Xu2023><pubmed>37684232</pubmed></ref>。 | ||
GPI部分はPIに構成成分が順に結合していく10段階の連鎖反応によって合成される。最初の2段階は小胞体膜の細胞質側で行われ、イノシトールの6位に[[UDP-Nアセチルグルコサミン]]([[UDP-GlcNAc]])から[[GlcNAc]]が転移して[[GlcNAc-PI]]ができ、それが[[脱アセチル]]され[[GlcN-PI]]になる。GlcN-PIは内腔側へフリップし、その後の反応はタンパク質への付加まで小胞体内腔側で行われる('''図2''')。まず[[イノシトール]]の2位に[[脂肪酸]](主として[[パルミチン酸]])が付加され[[GlcN-(acyl)PI]]になり、その後3つの[[マンノース]]と3つの[[トランスアミダーゼ]]が順に付加され、[[GPIトランスアミダーゼ]] ([[GPI-TA]])の基質となり得る完成型のGPI前駆体となる。脂肪酸、マンノース、トランスアミダーゼは、それぞれ[[アシル-CoA]]、[[ドリコール-リン酸-マンノース]] ([[Dol-P-Man]])、[[ホスファチジルエタノールアミン]]から供与される。哺乳動物細胞の完成型GPI前駆体の構造は、EtN-P-Man3-(EtN-P-)Man2-(EtN-P-)Man1-GlcN-(acyl)PIであり、3つすべてのマンノースにEtN-Pが付いている。 | |||
GPIの生合成とタンパク質への付加には[[PIGA]]など24個の遺伝子が関わっており、それらは[[phosphatidyl inositol glycan]] ([[PIG]])遺伝子群と総称される<ref name=Miyata1993><pubmed>7680492</pubmed></ref><ref name=Takahashi1996><pubmed>8861954</pubmed></ref>('''図2'''上部)。 | |||
PIにGlcNAcを転移する[[GPI-GlcNAc転移酵素]] ([[GPI-GnT]])は従来7つのタンパク質(PIGA、[[PIGC]]、[[PIGH]]、[[PIGQ]]、[[PIGP]]、[[PIGY]]、[[DPM2]])の複合体である考えられていたが<ref name=Murakami2005><pubmed>16162815</pubmed></ref><ref name=Watanabe2000><pubmed>10944123</pubmed></ref>、最近脂質の制御に関わることが知られていた[[ARV1]]タンパク質が8つ目のサブユニットであることがわかってきた<ref name=Lu2025><pubmed>40378954</pubmed></ref>。GPI生合成の開始反応が極めて大きな酵素複合体によって担われていることは、生合成経路が精緻に制御されているであろうことをうかがわせるが、PIGAが触媒成分であること以外それぞれのサブユニットの機能の詳細は未だ不明である。 | |||
GlcNAc- | GlcNAc-PIの脱アセチル化は[[デアセチラーゼ]]であるPIGLによって、イノシトールのアシル化は[[アシル転移酵素]]であるPIGWによって行われる。3つのマンノースは[[Dol-P-Man-dependent Man転移酵素]]であるPIGM/PIGX複合体、PIGV、PIGBによって、3つのEtN-Pは[[EtN-P転移酵素]]であるPIGN、PIGO/PIGF複合体、PIGG/PIGF複合体によって付加される。 | ||
=== GPIアンカー型タンパク質の成熟化 === | === GPIアンカー型タンパク質の成熟化 === | ||