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: HDAC阻害剤も多く存在し、代表的なものとして、[[バルプロ酸]](Valproic acid:VPA)、[[酪酸ナトリウム]](Sodium butyrate:SB)、[[トリコスタチンA]](Trichostatin A:TSA)、[[スベロイルアニリドヒドロキサム酸]](suberoylanilide hydroxamic acid:SAHA)が知られている。 | : HDAC阻害剤も多く存在し、代表的なものとして、[[バルプロ酸]](Valproic acid:VPA)、[[酪酸ナトリウム]](Sodium butyrate:SB)、[[トリコスタチンA]](Trichostatin A:TSA)、[[スベロイルアニリドヒドロキサム酸]](suberoylanilide hydroxamic acid:SAHA)が知られている。 | ||
=== 非ヒストンタンパク質 === | === 非ヒストンタンパク質 === | ||
その他にも、[[wikipedia:P53|P53]] 、[[wikipedia:E2F|E2F]]、[[wikipedia:MyoD|MyoD]]、[[wikipedia:STAT3|STAT3]]など数多くの非ヒストンタンパク質もまた、部位特異的にアセチル化されることが知られている<ref name="ref1"><pubmed>18804549</pubmed></ref>(表1、2)。アセチル化により、これらタンパク質の安定性や分解をはじめ、活性や局在、特異的相互作用などが制御され、転写、[[増殖]]、[[アポトーシス]]、[[分化]]など、細胞の様々な過程がコントロールされている。現在では、ヒストンおよび非ヒストンタンパク質のアセチル化が、[[メチル化]]や[[リン酸化]]など他の修飾とクロストークし、最終的なシグナル発現に重要な働きをしていることが明らかとなっている。いくつかの修飾がある決まった順序で組み合わさることが、ある機能発現には必要であり、一方では、互いに阻害し合うこともある。このように組み合わせを変えることで、細胞内情報伝達のネットワークの多様性を生み出している<ref><pubmed>18722172</pubmed></ref>。 | その他にも、[[wikipedia:P53|P53]] 、[[wikipedia:E2F|E2F]]、[[wikipedia:MyoD|MyoD]]、[[wikipedia:STAT3|STAT3]]など数多くの非ヒストンタンパク質もまた、部位特異的にアセチル化されることが知られている<ref name="ref1"><pubmed>18804549</pubmed></ref>(表1、2)。アセチル化により、これらタンパク質の安定性や分解をはじめ、活性や局在、特異的相互作用などが制御され、転写、[[増殖]]、[[アポトーシス]]、[[分化]]など、細胞の様々な過程がコントロールされている。現在では、ヒストンおよび非ヒストンタンパク質のアセチル化が、[[メチル化]]や[[リン酸化]]など他の修飾とクロストークし、最終的なシグナル発現に重要な働きをしていることが明らかとなっている。いくつかの修飾がある決まった順序で組み合わさることが、ある機能発現には必要であり、一方では、互いに阻害し合うこともある。このように組み合わせを変えることで、細胞内情報伝達のネットワークの多様性を生み出している<ref><pubmed>18722172</pubmed></ref>。 | ||
{| border="1" cellpadding="1" style="width:100%" | {| border="1" cellpadding="1" style="width:100%" | ||
|+ '''表1:代表的なアセチル化酵素<ref name="ref1" />''' | |+ '''表1: 代表的なアセチル化酵素<ref name="ref1" />''' | ||
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| [[ACTR]]、[[ATF-2]]、[[CBP]]、[[CDY]]、[[CLOCK]]、[[EWI]]、[[Elp3]]、[[GCN5L]]、[[GRIP]]、[[HAT1]]、[[HBO1]]、[[MCM3AP]]、[[MORF]]、[[MOZ]]、[[ | | [[ACTR]]、[[ATF-2]]、[[CBP]]、[[CDY]]、[[CLOCK]]、[[EWI]]、[[Elp3]]、[[GCN5L]]、[[GRIP]]、[[HAT1]]、[[HBO1]]、[[MCM3AP]]、[[MORF]]、[[MOZ]]、[[P300]]、[[PCAF]]、[[P/CIP]]、[[SRC-1]]、[[HTAFII250]]、[[TFIIB]]、[[Tip60]] | ||
|} | |} | ||
{| border="1" cellpadding="1" style="width:100%" | {| border="1" cellpadding="1" style="width:100%" | ||
|+ '''表2:代表的なアセチル化される非ヒストンタンパク質<ref name="ref1" />''' | |+ '''表2: 代表的なアセチル化される非ヒストンタンパク質<ref name="ref1" />''' | ||
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| [[Acetyl-CoA Synthetase]]、[[ACTR]]、[[AP endonuclease]]、[[AR]]、[[ATM]]、[[Brm]]、[[E2F1]], [[-2]], [[-3]]、[[EKLF]]、[[ERα]]、[[FoxO1]], [[2]], [[3]]、[[GATA1]]、[[HIF-1α]]、[[HMG A1]]、[[HSP90]]、[[Importin-α]]、[[Ku70]]、[[MEF2A]]、[[ミトコンドリアタンパク質]]、[[MyoD]]、[[ | | [[Acetyl-CoA Synthetase]]、[[ACTR]]、[[AP endonuclease]]、[[AR]]、[[ATM]]、[[Brm]]、[[E2F1]], [[-2]], [[-3]]、[[EKLF]]、[[ERα]]、[[FoxO1]], [[2]], [[3]]、[[GATA1]]、[[HIF-1α]]、[[HMG A1]]、[[HSP90]]、[[Importin-α]]、[[Ku70]]、[[MEF2A]]、[[ミトコンドリアタンパク質]]、[[MyoD]]、[[C-Myb]]、[[C-Myc]]、[[NF-κB]]、[[P21]]、[[P53]]、[[P73]]、[[P300]]、[[PCNA]]、[[PGC-1α]]、[[PR]]、[[STAT3]] | ||
|} | |} | ||
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{| border="1" cellpadding="1" style="width:100%" | {| border="1" cellpadding="1" style="width:100%" | ||
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|- | |- | ||
| style="text-align:center" | p53, p73, [[Smad7]], c-Myc, [[Runx3]], AR, [[H2A.z]], E2F1, [[NF-E4]], [[ER81]], [[SREBP1a]], [[HNF6]], [[BACE1]] | | style="text-align:center" | p53, p73, [[Smad7]], c-Myc, [[Runx3]], AR, [[H2A.z]], E2F1, [[NF-E4]], [[ER81]], [[SREBP1a]], [[HNF6]], [[BACE1]] | ||
| style="text-align:center" | [[GATA1]], HIF-1α, [[ | | style="text-align:center" | [[GATA1]], HIF-1α, [[PRb]] | ||
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| colspan="2" style="text-align:center" | '''DNAへの結合''' | | colspan="2" style="text-align:center" | '''DNAへの結合''' | ||
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| style="text-align:center" | 減少 | | style="text-align:center" | 減少 | ||
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| style="text-align:center" | p53, [[SRY]], STAT3, GATA, E2F1, [[ | | style="text-align:center" | p53, [[SRY]], STAT3, GATA, E2F1, [[P50]] (NF-κB), [[ERα]], [[P65]] (NF-κB), c-Myb, MyoD, [[HNF-4]], [[AML1]], [[BETA2]], [[NF-E2]], [[KLF13]], [[TAL1]]/[[SCL]], [[TAF(I)68]], [[AP endonuclease]] | ||
| style="text-align:center" | [[YY1]], HMG-A1, [[HMG-N2]], [[ | | style="text-align:center" | [[YY1]], HMG-A1, [[HMG-N2]], [[P65]] (NF-κB), [[DEK]], [[KLF13]], [[Fen-1]] | ||
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| colspan="2" style="text-align:center" | '''遺伝子の発現''' | | colspan="2" style="text-align:center" | '''遺伝子の発現''' | ||
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| style="text-align:center" | 転写抑制 | | style="text-align:center" | 転写抑制 | ||
|- | |- | ||
| style="text-align:center" | p53, [[HMG-A1]], STAT3, AR, ERα (basal), GATA, [[EKLF]], MyoD, E2F1, p65 (NF-κB), [[GR]], p73, PGC1α, [[MEF2D]], [[GCMa]], [[PLAG1]], [[PLAG2]], [[Bcl-6]], [[ | | style="text-align:center" | p53, [[HMG-A1]], STAT3, AR, ERα (basal), GATA, [[EKLF]], MyoD, E2F1, p65 (NF-κB), [[GR]], p73, PGC1α, [[MEF2D]], [[GCMa]], [[PLAG1]], [[PLAG2]], [[Bcl-6]], [[Β-カテニン]], [[KLF5]], [[Sp1]], [[BETA2]], [[Cart1]], [[RIP140]], [[TAF(I)68]] | ||
| style="text-align:center" | ERα (ligand-bound), HIF-1α, [[STAT1]], [[FOXO1]], [[FOXO4]], [[RIP140]] | | style="text-align:center" | ERα (ligand-bound), HIF-1α, [[STAT1]], [[FOXO1]], [[FOXO4]], [[RIP140]] | ||
|- | |- | ||
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|- | |- | ||
| style="text-align:center" | STAT3, AR, [[EKLF]], Importin A, STAT1, TFIIB, α-[[チュブリン]], [[アクチン]], [[コータクチン]] | | style="text-align:center" | STAT3, AR, [[EKLF]], Importin A, STAT1, TFIIB, α-[[チュブリン]], [[アクチン]], [[コータクチン]] | ||
| style="text-align:center" | [[ | | style="text-align:center" | [[P65]] ([[RelA]]), [[Ku70]], [[HSP90]] | ||
|- | |- | ||
| colspan="2" style="text-align:center" | '''局在化''' | | colspan="2" style="text-align:center" | '''局在化''' | ||
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|- | |- | ||
| style="text-align:center" | [[PCAF]], SRY, [[CtBP2]], [[POP-1]], [[HNF-4]], [[PCNA]] | | style="text-align:center" | [[PCAF]], SRY, [[CtBP2]], [[POP-1]], [[HNF-4]], [[PCNA]] | ||
| style="text-align:center" | [[ | | style="text-align:center" | [[C-Abl]], p300, PAP | ||
|- | |- | ||
| colspan="2" style="text-align:center" | '''mRNAの安定性''' | | colspan="2" style="text-align:center" | '''mRNAの安定性''' | ||
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| style="text-align:center" | 減少 | | style="text-align:center" | 減少 | ||
|- | |- | ||
| style="text-align:center" | [[ | | style="text-align:center" | [[P21]], [[Brm]] | ||
| style="text-align:center" | [[チロシン水酸化酵素]] (TH), [[ | | style="text-align:center" | [[チロシン水酸化酵素]] (TH), [[ENOS]] | ||
|- | |- | ||
| colspan="2" style="text-align:center" | '''酵素活性''' | | colspan="2" style="text-align:center" | '''酵素活性''' | ||
99行目: | 100行目: | ||
| style="text-align:center" | 減少 | | style="text-align:center" | 減少 | ||
|- | |- | ||
| style="text-align:center" | p300, [[ATM]] | | style="text-align:center" | p300, [[ATM]] | ||
| style="text-align:center" | [[PTEN]], [[HDAC1]], [[Mdm2]], [[ACS]], [[Neil2]], [[Polβ]] | | style="text-align:center" | [[PTEN]], [[HDAC1]], [[Mdm2]], [[ACS]], [[Neil2]], [[Polβ]] | ||
|} | |} | ||
ACS: | 略称一覧(ABC順) ACS: [[アセチルコエンチームA合成酵素]]、 ACTR: [[Histone acetyltransferase and nuclear receptor coactivator]]、 AML: [[急性骨髄性白血病タンパク質]]、 AP endonuclease: [[Apurinic/apyrimidinic endonuclease 1]]、 AR: [[アンドロゲン受容体]]、 ATF: [[Activating transcription factor]]、 ATM: [[Ataxia telangiectasia mutated]]、 BACE: [[Βセクレターゼ]]、 Bcl: [[B-cell CLL/lymphoma]]、 BETA2: [[BETA2転写因子]]、 Brm: [[The catalytic subunit of SWI/SNF chromatin remodeling complex]]、 c-Abl: [[C-abl癌遺伝子]]、 c-Myb: [[V-myb myeloblastosis viral oncogene homolog]]、 c-Myc: [[V-myc myelocytomatosis viral oncogene homolog]]、 Cart: [[Cartilage homeoprotein]]、 CBP(CREBBP): [[CREB結合タンパク質]]、 CDY: [[Chromodomain protein, Y-linked]]、 CLOCK: [[Circadian locomotor output cycles kaput]]、 CtBP(CTBP): [[C-terminal-binding protein]]、 DEK: [[DEK癌遺伝子]]、 E2F: [[E2F転写因子]]、 EKLF: [[Erythroid Krüppel様因子]]、 Elp3: [[Elongator complex protein]]、 eNOS: 内皮型一酸化窒素合成酵素、 ER: [[エストロゲン受容体]]、 ER81: [[Ets-related protein 81]]、 EWI: [[Egg-white inhibitor of cysteine proteinase]]、 Fen-1: [[Flap endonuclease-1]]、 Fox: [[Forkhead box]]、 GATA: [[GATA-binding protein]]、 GCM: [[Glial cells missing homolog]]、 GCN(KAT2): [[General control non-derepressible]] ([[K(lysine) acetyltransferase]])、 GR: [[グルココルチコイド受容体]]、 GRIP(NCOA2): [[グルココルチコイド受容体結合蛋白質]]([[Nuclear receptor coactivator 2]])、 H2A: [[ヒストン2Aサブユニット]]、 HAT: ヒストンアセチル基転移酵素、 HBO: [[Histone acetyltransferase binding to ORC]]、 HDAC: ヒストン脱アセチル酵素、 HIF: [[低酸素誘導因子]]、 HMG: [[High mobility group]]、 HNF: [[Hepatocyte nuclear factor]]、 HSP: [[熱ショックタンパク質]]、 hTAFII: [[Human TATA-binding protein-associated factor]]、 KLF: [[Krüppel様因子]]、 Ku70(XRCC6): [[Lupus Ku autoantigen protein p70]] ([[X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6]])、 MCM3AP: [[Minichromosome maintenance complex component 3 associated protein]]、 Mdm(MDM2): [[Murine double minute]] ([[P53 E3 ubiquitin protein ligase homolog]])、 MEF: [[Myocyte-specific enhancer factor]]、 MORF(KAT6B): [[Monocytic leukemia zinc-finger protein related factor]] ([[K(lysine) acetyltransferase 6B]] )、 MOZ(KAT6A): [[Monocytic leukemia zinc-finger protein]] ([[K(lysine) acetyltransferase 6A]] )、 MyoD: [[Myogenic differentiation]]、 Neil: [[DNA Glycosylase Nei-like]]、 NF-E: [[Nuclear factor, erythroid-derived]]、 NF-κB: [[Nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells]]、 p/CIP: [[P300/CBP interacting protein]]、 p21: [[Cyclin-dependent kinase inhibitor]]、 p300: [[E1A binding protein p300]]、 p50 (NF-κB): [[Nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 1]]、 p53: [[Tumor protein p53]]、 p65 (NF-κB): [[Nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells subunit protein 65]]、 p65 (RelA): [[V-rel reticuloendotheliosis viral oncogene homolog A]]、 p73: [[Tumor protein p73]]、 PAP: [[Poly(A) polymerase]]、 PCAF(KAT2B): p300/CBP-associated factor([[K(lysine) acetyltransferase 2B]])、 PCNA: [[Proliferating cell nuclear antigen]]、 PGC: [[PPAR-γ coactivator]]、 PLAG: [[Pleiomorphic adenoma gene]]、 Pol: [[Polymerase (DNA directed)]]、 POP-1: [[Wnt signaling nuclear effector]]、 PR: [[プロゲステロン受容体]]、 pRb(RB): [[Retinoblastoma]]、 PTEN: [[Phosphatase and tensin homolog deleted from chromosome 10]]、 RIP140: [[Receptor interacting protein 140]]、 Runx: [[Runt-related transcription factor]]、 Smad: [[Sma and Mad Related Family]]、 Sp1: [[Specificity protein 1]]、 SRC-1: [[ステロイド受容体コアクチベーター1]]、 SREBP1a: [[Sterol regulatory element binding transcription factor 1]]、 SRY: [[Sex-determining region Y]]、 STAT: [[シグナル伝達兼転写活性化因子]]、 TAF(I)68: [[TATA box binding protein (TBP)-associated factor (I)68]]、 TAL1/SCL: [[T-cell acute lymphoblastic leukemia 1/Stem cell leukemia]]、 TFIIB(GTF2B): [[General transcription factor IIB]]、 Tip60(KAT5): [[Tat interactive protein, 60kDa]]([[K(lysine) acetyltransferase 5]])、 YY1: [[転写抑制因子yin-yang 1]] | ||
ACTR: | |||
AML: | |||
AP endonuclease:Apurinic/apyrimidinic endonuclease | |||
AR: | |||
ATF:Activating | |||
ATM:Ataxia telangiectasia | |||
BACE: | |||
Bcl:B-cell CLL/ | |||
BETA2: | |||
Brm: | |||
c-Abl: | |||
c-Myb: | |||
c-Myc: | |||
Cart: | |||
CBP(CREBBP): | |||
CDY:Chromodomain protein, Y-linked | |||
CLOCK:Circadian | |||
CtBP(CTBP):C-terminal-binding | |||
DEK: | |||
E2F: | |||
EKLF:Erythroid | |||
Elp3:Elongator complex | |||
eNOS:内皮型一酸化窒素合成酵素、 | |||
ER: | |||
ER81: | |||
EWI: | |||
Fen-1:Flap endonuclease- | |||
Fox:Forkhead | |||
GATA:GATA-binding | |||
GCM: | |||
GCN(KAT2): | |||
GR: | |||
GRIP(NCOA2): | |||
H2A: | |||
HAT:ヒストンアセチル基転移酵素、 | |||
HBO: | |||
HDAC:ヒストン脱アセチル酵素、 | |||
HIF: | |||
HMG:High mobility | |||
HNF: | |||
HSP: | |||
hTAFII: | |||
KLF: | |||
Ku70(XRCC6):Lupus Ku autoantigen protein p70(X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6)、 | |||
MCM3AP: | |||
Mdm(MDM2): | |||
MEF:Myocyte-specific enhancer | |||
MORF(KAT6B):Monocytic leukemia zinc-finger protein related factor(K(lysine) acetyltransferase 6B )、 | |||
MOZ(KAT6A):Monocytic leukemia zinc-finger protein(K(lysine) acetyltransferase 6A )、 | |||
MyoD: | |||
Neil:DNA Glycosylase Nei- | |||
NF-E: | |||
NF-κB: | |||
p/CIP: | |||
p21: | |||
p300:E1A binding protein | |||
p50 (NF-κB): | |||
p53: | |||
p65 (NF-κB): | |||
p65 (RelA): | |||
p73: | |||
PAP: | |||
PCAF(KAT2B):p300/CBP-associated factor(K(lysine) acetyltransferase 2B )、 | |||
PCNA: | |||
PGC:PPAR- | |||
PLAG: | |||
Pol: | |||
POP-1:Wnt signaling nuclear | |||
PR: | |||
pRb(RB): | |||
PTEN:Phosphatase and | |||
RIP140: | |||
Runx: | |||
Smad:Sma and Mad Related | |||
Sp1: | |||
SRC-1: | |||
SREBP1a: | |||
SRY:Sex-determining region | |||
STAT: | |||
TAF(I)68:TATA box binding protein (TBP)-associated factor (I) | |||
TAL1/SCL:T-cell acute lymphoblastic leukemia 1/Stem cell | |||
TFIIB(GTF2B): | |||
Tip60(KAT5):Tat interactive protein, | |||
YY1:転写抑制因子yin-yang 1 | |||
== 神経系でのタンパク質アセチル化 == | == 神経系でのタンパク質アセチル化 == |