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　もともとは[[ショウジョウバエ]]で同定された[[wikipedia:JA:遺伝子|遺伝子]]（dNumb）で、変異体は[[外感覚器前駆細胞]]（Sensory Organ Precursor、SOP）の[[wikipedia:ja:細胞系譜|細胞系譜]]選択異常を示す<ref name=ref1><pubmed> 2752427 </pubmed></ref> 。ショウジョウバエのNumbタンパク質は前駆細胞の分裂時に非対称に分配され、[[Notch]]タンパク質と相互作用してNotchシグナル伝達を抑制することで、娘細胞の運命決定の非対称性を作り出しているとされる。哺乳類ではNumb（mNumb）と[[Numb-like]]（Numbl）の２つの遺伝子が同定されている。また、mNumbでは、[[wikipedia:ja:選択的スプライシング|選択的スプライシング]]によって活性の異なるタンパク質アイソフォームが作られる<ref name=ref2><pubmed> 10551880 </pubmed></ref><ref name=ref3><pubmed> 10468633 </pubmed></ref>ため、その機能は多様である。
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2012年5月15日 (火) 00:44時点における版

Numb homolog (Drosophila)
PDB rendering based on 1wj1.
Identifiers
Symbols NUMB; C14orf41; S171; c14_5527
External IDs OMIM: 603728 MGI: 107423 HomoloGene: 2775 GeneCards: NUMB Gene
RNA expression pattern
PBB GE NUMB 207545 s at tn.png
PBB GE NUMB 209073 s at tn.png
More reference expression data
Orthologs
Species Human Mouse
Entrez 8650 18222
Ensembl ENSG00000133961 ENSMUSG00000021224
UniProt P49757 Q9QZS3
RefSeq (mRNA) NM_001005743.1 NM_001136075.1
RefSeq (protein) NP_001005743.1 NP_001129547.1
Location (UCSC) Chr 14:
73.74 – 73.93 Mb		 Chr 12:
85.13 – 85.26 Mb
PubMed search [1] [2]

　もともとはショウジョウバエで同定された遺伝子（dNumb）で、変異体は外感覚器前駆細胞（Sensory Organ Precursor、SOP）の細胞系譜選択異常を示す[1] 。ショウジョウバエのNumbタンパク質は前駆細胞の分裂時に非対称に分配され、Notchタンパク質と相互作用してNotchシグナル伝達を抑制することで、娘細胞の運命決定の非対称性を作り出しているとされる。哺乳類ではNumb（mNumb）とNumb-like（Numbl）の２つの遺伝子が同定されている。また、mNumbでは、選択的スプライシングによって活性の異なるタンパク質アイソフォームが作られる[2][3]ため、その機能は多様である。

構造

　dNumb、mNumb、Numbl、さらには他の脊椎動物で報告されているNumbといった各タンパク質に共通するモチーフとして、アミノ末端側にリン酸化チロシン結合ドメイン（phosphotyrosine-binding domain, PTB domain）がある[4]。また、カルボキシ末端側にはEps15ホモロジー領域（DPFとNPF）がある。またmNumbにはPTBドメインとDPFの間にプロリンに富む配列（proline-rich region、PRR）があり、PRR中にSrc homology-3 binding site様の配列を含んでいる。mNumbについてはPTBドメインとPRRに選択的スプライシングがあり、全部で4種類（p72、p71、p66、p65）のタンパク質ができる。P71は全長であるp72のPTBドメインの一部を欠いており、P66はPRRの対部分、p65は両方を欠損している。NumblはPRRを持たないが、特徴的なグルタミンに富む配列を持つ。

生化学的な活性とその調節

　Numbはその構造から各種のタンパク質と相互作用して働くアダプターのような機能をしていると予想され、相互作用する相手によって様々な活性を持つと考えられている。

Notchシグナルの抑制

　Numbの機能としてよく知られているのは、Notchシグナルの抑制である。Notchが活性化されて細胞内領域（Notch intracellular domain, NICD）が切り出され、wikipedia:ja:核内に移行して転写制御に関わるが(Notchの項参照)、NumbはNICDに結合するとともに、HECT-domain E3 ubiquitin ligaseであるItch（ショウジョウバエのSuppressor of Deltex）に結合することで、NICDのポリユビキチン化とそれに続く分解を促進している[5]。また、Numbは後述するようにエンドサイトーシスに関連した機能をもっており、エンドサイトーシスによって細胞膜上のNotchタンパク質の量を調節している可能性も指摘されている。

エンドサイトーシスによる細胞間、細胞—基質接着の制御

　dNumbやNumblも含め、Numbタンパク質はカルボキシ末端のDPFとNPFモチーフを持っており、これを介してクラスリンアダプタータンパク質であるα-アダプチンやEpsin 15 homology domainファミリータンパク質と結合し、エンドサイトーシスの制御に関わっている[6]。NumbはRab11陽性のエンドソームに分布し、カドヘリン／カテニン複合体（cadherin/catenin complex）の継続的な取り込みとリサイクルによる接着結合（adherens junction、アドヘレンスジャンクションの項を参照）の維持に働いている[7]。また、移動中の細胞のリーディングエッジではβ-インテグリン（細胞外基質の受容体）に結合し、クラスリンを含む構造（おそらくはエンドソーム）への取り込みに関わっていると思われる。非典型的プロテインキナーゼC（aPKC）によるリン酸化によってNumbタンパク質とβ-インテグリンの結合が外れることから、aPKCがNumbの偏った細胞内局在とそれに続く方向性を持つ細胞移動を制御していると考えられる[8][9]。

その他

　mNumbやNumblが膜結合型β-アミロイド前駆タンパク質（APP）やAPPの細胞内領域に結合し、APPの輸送とプロセシングを制御するという報告がある[10]。また、Hedgehogシグナルのターゲットである転写因子Gli1と結合してItchをリクルートすることで、Gli1のプロテアソーム依存性の分解を促進することが報告された[11][12]。さらに、ヒトにおいてmNumbがE3 ubiquitin ligaseの一種であるHDM3に結合して不活性化し、ガン抑制タンパク質であるp53のHDM3によるユビキチン化とそれに続く分解を抑制するという報告もある[13]。これらの報告から、Numbの多様な機能が明らかになりつつある。

神経発生における機能と活性

　前述したように、ショウジョウバエではSOPの分裂時にdNumbが非対称に局在して、娘細胞に不等分配されることから、dNumbが非対称分裂による発生運命の決定に関わっていることが示されている[1]。このことから、脊椎動物の神経発生においても同様のことが期待された。マウスでは神経上皮組織において脳室側、すなわち頂端（apical）側に局在することから、分裂期の神経上皮細胞の分裂方向によっては、不等分配される可能性が示唆された。しかし、その後の観察で、apicalに局在するmNumbを不等分配できるような脳室面に平行な分裂面での細胞分裂が非常に稀であったことが示され、このモデルの妥当性は失われている。

　一方、ニワトリについては分裂期前期から中期の神経上皮細胞においてNumbが基底膜側に局在していることが示されている[14]。この場合には、分裂面が脳室面に対して直交していても、分裂期中期以降にNumbが側方に輸送されることで不等分配を可能にしている。これは、基底膜側に非対称に局在している中間径フィラメントの一種であるTransitinにNumbが結合して一緒に運ばれることによる[15]。マウスではTransitin遺伝子そのものが無い（比較的構造の似ているネスチン（Nestin）は非対称な細胞内局在を示さない）ため、同様の分子メカニズムは生物種間で保存されていないと思われる。ゼブラフィッシュでもNumbの細胞内局在が調べられているが、分裂期の神経上皮細胞では基底膜側から側方にかけて分布しており、不等分配もされないようである。

　mNumbやNumblの神経発生における機能については、ノックアウト（KO）マウスを用いた解析がおこなわれている[4]。複数のグループが通常のノックアウトやコンディショナルノックアウト（CKO）によって大脳皮質における機能を調べているが、結果がまちまちで、とりわけニューロン分化における機能についてコンセンサスが得られないままである。

　NumblのKOマウスの発生は正常らしい一方、mNumbとNumblのダブルノックアウトはmNumb単独よりも明瞭な表現型（後述）を示すとされるが、そもそも神経上皮細胞で広く発現しているmNumbと、分化したニューロンで発現する（すなわち非対称分裂には関与しないと考えられる）Numblのダブルノックアウトで機能重複について論ずることに疑問が残る。

　また、Nestin-Creを用いたダブルCKOの場合には神経上皮細胞の数が減少することで間接的にニューロンの数が減少すると報告されたが、Emx-Creを用いた研究では神経上皮細胞の過増殖と分化の抑制が示されている。さらにD6-Creを用いた論文では、mNumbとNumblが神経上皮細胞の維持に働いていると報告している。このような結果の一貫性の無さの原因がどこにあるのかは明らかではないが、これらの３種類のCreによるノックアウトの時期が、それぞれ8.5、9.5、10.5日胚とずれているのが原因ではないかとする考えもある[4]。

　この説にある程度の根拠を与えているのが、前述した選択的スプライシングによって作られるアイソフォームの存在である。in vitroの培養系を用いた解析では、PRRを持っているアイソフォーム（上記のp72とp71に相当する）は増殖を促進する一方、PRRのほとんどを持たないアイソフォーム（上記のp66とp65に相当する）はニューロン分化を促進することが示されている[3]。これと対応して、PRRを持つアイソフォームは主に7〜10日胚の時期に発現しておりその後低下するが、PRRを持たないアイソフォームの発現は胚発生期から成体の脳にいたるまで発現が続く。これらの活性がどのような分子メカニズムによるものかは明らかでは無いが、おそらくは直接的にNotchシグナルを抑制したり、接着結合を維持することによって間接的にNotchシグナルを促進したりすることが重要なのであろう。

　一方、小脳の発生過程では異なる機能があると示唆されている。すなわち、小脳顆粒細胞の前駆細胞の増殖はヘッジホッグ（Hedgehog）シグナル（SHHの項を参照）によって促進されているが、上記のようにmNumbはGli1の分解促進によってHedgehogシグナルを抑制することで小脳顆粒細胞の分化を促進していると考えられる。

参考文献

  1. ↑ 1.0 1.1 Uemura, T., Shepherd, S., Ackerman, L., Jan, L.Y., & Jan, Y.N. (1989).
    numb, a gene required in determination of cell fate during sensory organ formation in Drosophila embryos. Cell, 58(2), 349-60. [PubMed:2752427] [WorldCat] [DOI]
  2. ↑ Dho, S.E., French, M.B., Woods, S.A., & McGlade, C.J. (1999).
    Characterization of four mammalian numb protein isoforms. Identification of cytoplasmic and membrane-associated variants of the phosphotyrosine binding domain. The Journal of biological chemistry, 274(46), 33097-104. [PubMed:10551880] [WorldCat] [DOI]
  3. ↑ 3.0 3.1 Verdi, J.M., Bashirullah, A., Goldhawk, D.E., Kubu, C.J., Jamali, M., Meakin, S.O., & Lipshitz, H.D. (1999).
    Distinct human NUMB isoforms regulate differentiation vs. proliferation in the neuronal lineage. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 96(18), 10472-6. [PubMed:10468633] [PMC] [WorldCat] [DOI]
  4. ↑ 4.0 4.1 4.2 Gulino, A., Di Marcotullio, L., & Screpanti, I. (2010).
    The multiple functions of Numb. Experimental cell research, 316(6), 900-6. [PubMed:19944684] [WorldCat] [DOI]
  5. ↑ Di Marcotullio, L., Ferretti, E., Greco, A., De Smaele, E., Po, A., Sico, M.A., ..., & Gulino, A. (2006).
    Numb is a suppressor of Hedgehog signalling and targets Gli1 for Itch-dependent ubiquitination. Nature cell biology, 8(12), 1415-23. [PubMed:17115028] [WorldCat] [DOI]
  6. ↑ Santolini, E., Puri, C., Salcini, A.E., Gagliani, M.C., Pelicci, P.G., Tacchetti, C., & Di Fiore, P.P. (2000).
    Numb is an endocytic protein. The Journal of cell biology, 151(6), 1345-52. [PubMed:11121447] [PMC] [WorldCat] [DOI]
  7. ↑ Rasin, M.R., Gazula, V.R., Breunig, J.J., Kwan, K.Y., Johnson, M.B., Liu-Chen, S., ..., & Sestan, N. (2007).
    Numb and Numbl are required for maintenance of cadherin-based adhesion and polarity of neural progenitors. Nature neuroscience, 10(7), 819-27. [PubMed:17589506] [WorldCat] [DOI]
  8. ↑ Wang, Z., Sandiford, S., Wu, C., & Li, S.S. (2009).
    Numb regulates cell-cell adhesion and polarity in response to tyrosine kinase signalling. The EMBO journal, 28(16), 2360-73. [PubMed:19609305] [PMC] [WorldCat] [DOI]
  9. ↑ Smith, C.A., Lau, K.M., Rahmani, Z., Dho, S.E., Brothers, G., She, Y.M., ..., & McGlade, C.J. (2007).
    aPKC-mediated phosphorylation regulates asymmetric membrane localization of the cell fate determinant Numb. The EMBO journal, 26(2), 468-80. [PubMed:17203073] [PMC] [WorldCat] [DOI]
  10. ↑ Kyriazis, G.A., Wei, Z., Vandermey, M., Jo, D.G., Xin, O., Mattson, M.P., & Chan, S.L. (2008).
    Numb endocytic adapter proteins regulate the transport and processing of the amyloid precursor protein in an isoform-dependent manner: implications for Alzheimer disease pathogenesis. The Journal of biological chemistry, 283(37), 25492-502. [PubMed:18599481] [PMC] [WorldCat] [DOI]
  11. ↑ Di Marcotullio, L., Ferretti, E., Greco, A., De Smaele, E., Po, A., Sico, M.A., ..., & Gulino, A. (2006).
    Numb is a suppressor of Hedgehog signalling and targets Gli1 for Itch-dependent ubiquitination. Nature cell biology, 8(12), 1415-23. [PubMed:17115028] [WorldCat] [DOI]
  12. ↑ Di Marcotullio, L., Greco, A., Mazzà, D., Canettieri, G., Pietrosanti, L., Infante, P., ..., & Gulino, A. (2011).
    Numb activates the E3 ligase Itch to control Gli1 function through a novel degradation signal. Oncogene, 30(1), 65-76. [PubMed:20818436] [WorldCat] [DOI]
  13. ↑ Colaluca, I.N., Tosoni, D., Nuciforo, P., Senic-Matuglia, F., Galimberti, V., Viale, G., ..., & Di Fiore, P.P. (2008).
    NUMB controls p53 tumour suppressor activity. Nature, 451(7174), 76-80. [PubMed:18172499] [WorldCat] [DOI]
  14. ↑ Wakamatsu, Y., Maynard, T.M., Jones, S.U., & Weston, J.A. (1999).
    NUMB localizes in the basal cortex of mitotic avian neuroepithelial cells and modulates neuronal differentiation by binding to NOTCH-1. Neuron, 23(1), 71-81. [PubMed:10402194] [WorldCat] [DOI]
  15. ↑ Wakamatsu, Y., Nakamura, N., Lee, J.A., Cole, G.J., & Osumi, N. (2007).
    Transitin, a nestin-like intermediate filament protein, mediates cortical localization and the lateral transport of Numb in mitotic avian neuroepithelial cells. Development (Cambridge, England), 134(13), 2425-33. [PubMed:17522158] [WorldCat] [DOI]


（執筆者：若松義雄　担当編集委員：大隅典子）

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