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=== basic Helix-Loop-Helixドメイン === | === basic Helix-Loop-Helixドメイン === | ||
約50アミノ酸からなり、塩基性領域、Helix-Loop-Helix領域2つの機能的部分に分けられる('''図1''')。 | 約50アミノ酸からなり、塩基性領域、Helix-Loop-Helix領域2つの機能的部分に分けられる('''図1''')。 | ||
塩基性領域はドメインのN末端側に位置し、正電荷を持つ[[アミノ酸]]([[リジン]]、[[アルギニン]]など)に富む。[[DNA]]への直接的な結合を担い、標的遺伝子の[[プロモーター]]や[[エンハンサー]]領域に存在する特定のコンセンサス配列、主にE-boxと呼ばれる「CANNTG」(NPASファミリーの場合は特にCACGTGが多い)を認識する<ref name=Murre1989><pubmed>2503252</pubmed></ref><ref name=Yutzey1992><pubmed>1329039</pubmed></ref>('''図2''')。 | 塩基性領域はドメインのN末端側に位置し、正電荷を持つ[[アミノ酸]]([[リジン]]、[[アルギニン]]など)に富む。[[DNA]]への直接的な結合を担い、標的遺伝子の[[プロモーター]]や[[エンハンサー]]領域に存在する特定のコンセンサス配列、主にE-boxと呼ばれる「CANNTG」(NPASファミリーの場合は特にCACGTGが多い)を認識する<ref name=Murre1989><pubmed>2503252</pubmed></ref><ref name=Yutzey1992><pubmed>1329039</pubmed></ref>('''図2''')。 | ||
Helix-Loop-Helix領域は2つの[[αヘリックス]]が柔軟なループ構造で連結された構造。この領域はタンパク質の二量体形成に不可欠である。[[class I bHLH-PASスーパーファミリー]]に属するNPASファミリーはそれぞれ、機能的なDNA結合のために[[class II bHLH-PASスーパーファミリー]]に属する[[ARNT]](別名[[HIF1β]])/[[ARNT2]]、または、その神経系特異的ホモログである[[ | Helix-Loop-Helix領域は2つの[[αヘリックス]]が柔軟なループ構造で連結された構造。この領域はタンパク質の二量体形成に不可欠である。[[class I bHLH-PASスーパーファミリー]]に属するNPASファミリーはそれぞれ、機能的なDNA結合のために[[class II bHLH-PASスーパーファミリー]]に属する[[ARNT]](別名[[HIF1β]])/[[ARNT2]]、または、その神経系特異的ホモログである[[ARNT-like 1]] ([[ARNTL]]、別名BMAL1)/BMAL2と、特異的にヘテロ二量体を形成する<ref name=Swanson1993><pubmed>8287061</pubmed></ref><ref name=Hirose1996><pubmed>8657146</pubmed></ref><ref name=Wu2016 />。 | ||
=== PASドメイン === | === PASドメイン === | ||
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[[転写調節因子]]としての機能を通じて、個体レベルでの多様な生理現象に関与する。 | [[転写調節因子]]としての機能を通じて、個体レベルでの多様な生理現象に関与する。 | ||
=== 転写調節 === | === 転写調節 === | ||
最も基本的な分子機能は、転写因子としての役割である。適切なパートナーと安定なヘテロ二量体を形成した後、標的遺伝子の[[プロモーター]]や[[エンハンサー]]領域に存在する[[E-boxコンセンサス配列]](主にCACGTGまたはその周辺配列)に特異的に結合する<ref name=Wu2016 /><ref name=Sun2022><pubmed>36343253</pubmed></ref>('''図2''')。結合後、C末端領域などを介して[[コアクチベーター]](例:[[サイクリックAMP応答因子結合タンパク質]] ([[cAMP responsive element binding protein-binding protein]], [[CBP]]/[[p300]]) | 最も基本的な分子機能は、転写因子としての役割である。適切なパートナーと安定なヘテロ二量体を形成した後、標的遺伝子の[[プロモーター]]や[[エンハンサー]]領域に存在する[[E-boxコンセンサス配列]](主にCACGTGまたはその周辺配列)に特異的に結合する<ref name=Wu2016 /><ref name=Sun2022><pubmed>36343253</pubmed></ref>('''図2''')。結合後、C末端領域などを介して[[コアクチベーター]](例:[[サイクリックAMP応答因子結合タンパク質-結合タンパク質]] ([[cAMP responsive element binding protein-binding protein]], [[CBP]]/[[p300]])と[[nuclear receptor coactivator 1]] ([[NCOA1]])/[[steroid receptor coactivator 1]] ([[SRC-1]]))やコリプレッサー(例: [[nuclear receptor corepressor 2]] ([[NCOR2]])/[[silencing mediator of retinoic acid and thyroid hormone receptor]] ([[SMRT]]))をリクルートすることにより、ヒストンの[[アセチル化]]・[[脱アセチル化]]などの[[クロマチン]]修飾を誘導し、標的遺伝子の転写効率を精密に正または負に制御する<ref name=Bersten2013><pubmed>24263188</pubmed></ref><ref name=Luoma2018><pubmed>30509165</pubmed></ref>。 | ||
=== パートナー選択性と標的遺伝子特異性 === | === パートナー選択性と標的遺伝子特異性 === | ||
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===シグナル伝達経路とのクロストーク === | ===シグナル伝達経路とのクロストーク === | ||
NPASファミリーの活動は、他の細胞内シグナル伝達経路と密接に連携している。例えば、NPAS4の発現は神経活動に伴う[[カルシウム]]流入によって厳密に制御されており <ref name=Lin2008><pubmed>18815592</pubmed></ref>、[[カルシウム/カルモジュリン依存的タンパク質リン酸化酵素]]や[[転写因子]] ([[cAMP response element-binding protein]] | NPASファミリーの活動は、他の細胞内シグナル伝達経路と密接に連携している。例えば、NPAS4の発現は神経活動に伴う[[カルシウム]]流入によって厳密に制御されており <ref name=Lin2008><pubmed>18815592</pubmed></ref>、[[カルシウム/カルモジュリン依存的タンパク質リン酸化酵素]] ([[Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase|Ca<sup>2+</sup>/calmodulin-dependent protein kinase]], [[CaMK]])や[[転写因子]] ([[cAMP response element-binding protein]], [[CREB]]と[[myocyte enhancer factor 2]] ([[MEF2]]))がNPAS4遺伝子の発現制御に関与している<ref name=Sun2016><pubmed>26987258</pubmed></ref>。また、NPAS2の活性は概日時計のフィードバックループや代謝産物によって調節される<ref name=Reick2001><pubmed>11441147</pubmed></ref><ref name=Eckel-Mahan2013><pubmed>23303907</pubmed></ref>。このように、NPASファミリーは様々な細胞内外の刺激に応答し、それを転写レベルの変化へと変換する重要な結節点として機能している。 | ||
==NPAS1== | ==NPAS1== | ||
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== NPAS2 == | == NPAS2 == | ||
=== 組織分布 === | === 組織分布 === | ||
中枢神経系では、[[概日リズム]]の中枢である[[視交叉上核]]([[suprachiasmatic nucleus]], [[SCN]])に加えて、大脳皮質、[[海馬]]、[[線条体]]などの[[前脳]]領域で広く発現している<ref name=Reick2001 /> | 中枢神経系では、[[概日リズム]]の中枢である[[視交叉上核]]([[suprachiasmatic nucleus]], [[SCN]])に加えて、大脳皮質、[[海馬]]、[[線条体]]などの[[前脳]]領域で広く発現している<ref name=Reick2001 />。末梢組織では、[[肝臓]]、[[腎臓]]、肺、[[心臓]]などでも発現が確認されている<ref name=Hogenesch1997><pubmed>9079689</pubmed></ref><ref name=Storch2002><pubmed>11967526</pubmed></ref>。SCNや肝臓においては、その[[mRNA]]およびタンパク質レベルが[[概日周期]]に従ってリズミカルに変動することが知られている<ref name=Reick2001><pubmed>11441147</pubmed></ref><ref name=Storch2002 />。 | ||
=== 機能 === | === 機能 === | ||
==== リガンド応答性 ==== | ==== リガンド応答性 ==== | ||
NPAS2は[[ヘム]]をリガンドとして結合し、細胞内のガス状分子([[CO]], [[酸素|O<sub>2</sub>]], [[NO]])の濃度変化に応じてその立体構造や転写活性が変化する可能性が示唆されている<ref name=Dioum2002><pubmed>12446832</pubmed></ref><ref name=Gilles-Gonzalez2005><pubmed>15598487</pubmed></ref>。これにより、NPAS2は細胞の代謝状態(例:ヘム生合成レベル)やガス環境を感知し、概日リズムや代謝関連遺伝子の発現を調節する役割を担っていると考えられる<ref name=Kitanishi2008><pubmed>18479150</pubmed></ref>。NPAS1, 3, 4も、PAS-Bドメイン内にリガンド結合ポケットを有することが構造的に示されており<ref name=Wu2016 /><ref name=Sun2022><pubmed>36343253</pubmed></ref>('''図2''')、これらのタンパク質は未知の内因性リガンドによって活性が制御されている可能性が考えられる。 | NPAS2は[[ヘム]]をリガンドとして結合し、細胞内のガス状分子([[CO]], [[酸素|O<sub>2</sub>]], [[NO]])の濃度変化に応じてその立体構造や転写活性が変化する可能性が示唆されている<ref name=Dioum2002><pubmed>12446832</pubmed></ref><ref name=Gilles-Gonzalez2005><pubmed>15598487</pubmed></ref>。これにより、NPAS2は細胞の代謝状態(例:ヘム生合成レベル)やガス環境を感知し、概日リズムや代謝関連遺伝子の発現を調節する役割を担っていると考えられる<ref name=Kitanishi2008><pubmed>18479150</pubmed></ref>。NPAS1, 3, 4も、PAS-Bドメイン内にリガンド結合ポケットを有することが構造的に示されており<ref name=Wu2016 /><ref name=Sun2022><pubmed>36343253</pubmed></ref>('''図2''')、これらのタンパク質は未知の内因性リガンドによって活性が制御されている可能性が考えられる。 | ||
==== 概日リズム制御 ==== | ==== 概日リズム制御 ==== | ||
視交叉上核(SCN)において、CLOCKと共にコア[[時計遺伝子]](period ( | 視交叉上核(SCN)において、CLOCKと共にコア[[時計遺伝子]](period (PER)、cryptochrome (CRY)など)の転写を制御する転写活性化因子として機能し、約24時間周期の概日リズム発振に寄与する<ref name=Reick2001><pubmed>11441147</pubmed></ref><ref name=Parekh2019><pubmed>30962277</pubmed></ref>。末梢組織(肝臓、肺など)においても、それぞれの組織における概日時計の維持に関与する<ref name=Storch2002><pubmed>11967526</pubmed></ref>。NPAS2変異マウスは、正常な光周期下では比較的正常な活動リズムを示すが、恒常暗黒下での活動周期の不安定性や、特定の光パルスに対する位相シフト反応の変化、睡眠ホメオスタシスの異常などを示す<ref name=Dudley2003><pubmed>12843397</pubmed></ref><ref name=Mongrain2011><pubmed>22039518</pubmed></ref>。 | ||
==== 代謝調節 ==== | ==== 代謝調節 ==== | ||
特に肝臓において、[[糖新生]]や[[脂質]]代謝に関わる遺伝子の発現を概日的に制御し、[[エネルギー恒常性]]の維持に関与する<ref name=Lee2015><pubmed>25212631</pubmed></ref><ref name=Ma2023><pubmed>36978001</pubmed></ref>。 | 特に肝臓において、[[糖新生]]や[[脂質]]代謝に関わる遺伝子の発現を概日的に制御し、[[エネルギー恒常性]]の維持に関与する<ref name=Lee2015><pubmed>25212631</pubmed></ref><ref name=Ma2023><pubmed>36978001</pubmed></ref>。 | ||
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[[ファイル:Tsuboi NPAS Fig3.png|サムネイル|'''図3. 健常時と損傷時の脳におけるNPAS4の役割'''<br><br> | [[ファイル:Tsuboi NPAS Fig3.png|サムネイル|'''図3. 健常時と損傷時の脳におけるNPAS4の役割'''<br><br> | ||
]] | ]] | ||
[[ファイル:Tsuboi NPAS Fig4.png|サムネイル|'''図4. 神経活動依存的なDNA切断とその修復におけるNPAS4の役割'''<br>文献<ref name=Delint-Ramirez2023><pubmed>37084713</pubmed></ref> | [[ファイル:Tsuboi NPAS Fig4.png|サムネイル|'''図4. 神経活動依存的なDNA切断とその修復におけるNPAS4の役割'''<br>文献<ref name=Delint-Ramirez2023><pubmed>37084713</pubmed></ref>の図を改変。]] | ||
== NPAS4 == | == NPAS4 == | ||
=== 組織分布 === | === 組織分布 === | ||
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=== 機能 === | === 機能 === | ||
==== 神経活動依存的な遺伝子発現のマスターレギュレーター ==== | ==== 神経活動依存的な遺伝子発現のマスターレギュレーター ==== | ||
NPAS4は、[[興奮性ニューロン]]での標的遺伝子([[BDNF]]など)を活性化させて、[[抑制性シナプス]]の数を増加させることで、回路全体の活動を低下させる一方、抑制性ニューロンでの標的遺伝子([[MDM2]]など)を不活性化させて、[[シナプス形成]]を促進し[[GABA]]の放出を増加させることで、回路全体の活動を低下させるという、[[恒常的な可塑性]]を維持する役割を果たす('''図3''')。 | NPAS4は、[[興奮性ニューロン]]での標的遺伝子([[神経栄養因子]] ([[brain-derived neurotrophic factor]], [[BDNF]])など)を活性化させて、[[抑制性シナプス]]の数を増加させることで、回路全体の活動を低下させる一方、抑制性ニューロンでの標的遺伝子([[MDM2]]など)を不活性化させて、[[シナプス形成]]を促進し[[GABA]]の放出を増加させることで、回路全体の活動を低下させるという、[[恒常的な可塑性]]を維持する役割を果たす('''図3''')。 | ||
ニューロンが活動すると迅速に発現が誘導され、その後、抑制性シナプスの形成や機能に関わる遺伝子群([[glutamate decarboxylase 1]]/[[glutamate decarboxylase 2|2]] ([[GAD1]] | ニューロンが活動すると迅速に発現が誘導され、その後、抑制性シナプスの形成や機能に関わる遺伝子群([[glutamate decarboxylase 1]]/[[glutamate decarboxylase 2|2]] ([[GAD1]]/[[GAD2|2]])、[[ソマトスタチン]] ([[somatostatin]], [[SST]])、[[BDNF]])、[[イオンチャネル]]、その他の転写因子など、多岐にわたる標的遺伝子の発現を協調的に制御する<ref name=Lin2008><pubmed>18815592</pubmed></ref><ref name=Bloodgood2013><pubmed>24201284</pubmed></ref><ref name=Pollina2023><pubmed>36792830</pubmed></ref><ref name=Spiegel2014 />。これにより、神経回路の活動レベルに応じた適応的な変化を引き起こす。 | ||
[[Fos]]、Npas4、[[Egr1]]などの最初期遺伝子(immediately early gene: IEG)のプロモーターでは、感覚刺激により[[topoisomerase IIβ]]([[TOP2B]])を介してDNA二本鎖切断(double-strand break: DSB)が形成される。マウス海馬ニューロンを[[カイニン酸]]で刺激した2時間後に観察されるDSB部位の大部分(69%)は、NPAS4/ARNTヘテロダイマーが最も多く結合しているNpas4遺伝子座と重なっていた<ref name=Pollina2023><pubmed>36792830</pubmed></ref>('''図4''')。 | [[Fos]]、Npas4、[[Egr1]]などの最初期遺伝子(immediately early gene: IEG)のプロモーターでは、感覚刺激により[[topoisomerase IIβ]]([[TOP2B]])を介してDNA二本鎖切断(double-strand break: DSB)が形成される。マウス海馬ニューロンを[[カイニン酸]]で刺激した2時間後に観察されるDSB部位の大部分(69%)は、NPAS4/ARNTヘテロダイマーが最も多く結合しているNpas4遺伝子座と重なっていた<ref name=Pollina2023><pubmed>36792830</pubmed></ref>('''図4''')。 | ||
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==== シナプス可塑性・学習記憶 ==== | ==== シナプス可塑性・学習記憶 ==== | ||
海馬依存的な[[空間記憶]]や[[文脈的恐怖記憶]]、扁桃体依存的な[[手がかり恐怖記憶]]など、様々な種類の学習・記憶課題の遂行に必要である<ref name=Ramamoorthi2011><pubmed>22194569</pubmed></ref><ref name=Ploski2011><pubmed>21887312</pubmed></ref> | 海馬依存的な[[空間記憶]]や[[文脈的恐怖記憶]]、扁桃体依存的な[[手がかり恐怖記憶]]など、様々な種類の学習・記憶課題の遂行に必要である<ref name=Ramamoorthi2011><pubmed>22194569</pubmed></ref><ref name=Ploski2011><pubmed>21887312</pubmed></ref>。また、[[長期増強]]([[long-term potentiation]], [[LTP]])や[[長期抑圧]]([[long-term depression]], [[LTD]])といったシナプス可塑性の誘導や維持にも関与することが示されている<ref name=Bloodgood2013><pubmed>24201284</pubmed></ref>。 | ||
==== 恒常性可塑性と神経保護 ==== | ==== 恒常性可塑性と神経保護 ==== | ||
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=== 疾患との関わり=== | === 疾患との関わり=== | ||
==== てんかん ==== | ==== てんかん ==== | ||
[[てんかん]] | [[てんかん]]発作は強力な神経活動刺激であり、発作時にNPAS4の発現が海馬などで著しく誘導される<ref name=Lin2008 />。NPAS4は抑制性シナプスの形成を促進することから、発作後の神経回路の過剰興奮を抑制する保護的な役割(抗てんかん作用)を持つと考えられている。実際に、NPAS4欠損マウスは、薬物誘発性てんかん発作に対する感受性が亢進し、発作重症度が増加することが示されている<ref name=Shan2018><pubmed>29222951</pubmed></ref>。 | ||
==== 脳梗塞・神経変性疾患 ==== | ==== 脳梗塞・神経変性疾患 ==== | ||
[[脳虚血]]などの神経傷害後にもNPAS4の発現が誘導され、神経保護に関与する可能性が示唆されている<ref name=Shamloo2006><pubmed>17156197</pubmed></ref><ref name=Takahashi2021><pubmed>34349016</pubmed></ref>('''図3''')。その機能不全が神経変性疾患の病態に関わる可能性も研究されている。 | |||
==== 不安障害・心的外傷後ストレス障害 ==== | ==== 不安障害・心的外傷後ストレス障害 ==== | ||
扁桃体におけるNPAS4の機能は[[恐怖記憶]]の形成と消去に関与するため、その調節異常が不安障害や[[心的外傷後ストレス障害]]([[posttraumatic stress disorder]], [[PTSD]])の病態に関与する可能性が考えられている<ref name=Ploski2011><pubmed>21887312</pubmed></ref>。 | |||
==== 依存症 ==== | ==== 依存症 ==== | ||
薬物([[コカイン]]など)投与によって[[線条体]] | 薬物([[コカイン]]など)投与によって[[線条体]]などでNPAS4の発現が誘導され、薬物に対する[[報酬学習]]や[[精神刺激薬]]感受性、[[依存]]からの再燃に関与することが示唆されている<ref name=Taniguchi2017><pubmed>28957664</pubmed></ref>。 | ||
==== 自閉スペクトラム症==== | ==== 自閉スペクトラム症==== | ||
病態仮説の一つである神経回路の[[興奮/抑制バランス]]の破綻において、NPAS4が重要な役割を果たしている可能性が注目されている。NPAS4の機能異常と[[自閉スペクトラム症]]病態との関連、および治療標的としての可能性が探求されている<ref name=Rein2021><pubmed>32099100</pubmed></ref>。 | |||
== 関連語 == | == 関連語 == | ||
* [[転写因子]] | * [[転写因子]] | ||